Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 LINC00428-201ENST00000415620 227 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
TRAF1Q13077 snoU13.26-201ENST00000459452 105 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
TRAF1Q13077 AC117462.1-201ENST00000461186 554 ntTSL 4 BASIC2.39□□□□□ -2.03
TRAF1Q13077 AC145146.1-201ENST00000496370 254 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
TRAF1Q13077 SNORA25.14-201ENST00000516481 132 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
TRAF1Q13077 AC040936.1-201ENST00000534543 172 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
TRAF1Q13077 AL122017.1-202ENST00000570612 319 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
TRAF1Q13077 RPL30P11-203ENST00000598995 310 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
TRAF1Q13077 AC062037.2-201ENST00000610137 73 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
TRAF1Q13077 MIR6715A-201ENST00000615929 79 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
TRAF1Q13077 AC068631.1-220ENST00000630726 256 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
TRAF1Q13077 CENPCP1-201ENST00000533085 2578 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
TRAF1Q13077 Y_RNA.26-201ENST00000362539 101 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
TRAF1Q13077 Y_RNA.105-201ENST00000363182 111 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
TRAF1Q13077 Y_RNA.179-201ENST00000363844 90 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
TRAF1Q13077 Y_RNA.288-201ENST00000364854 92 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
TRAF1Q13077 Y_RNA.376-201ENST00000365638 108 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
TRAF1Q13077 Y_RNA.396-201ENST00000383949 103 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
TRAF1Q13077 RNU6-793P-201ENST00000384233 104 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
TRAF1Q13077 Y_RNA.461-201ENST00000384263 103 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
TRAF1Q13077 RNU6-505P-201ENST00000384427 107 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
TRAF1Q13077 AC019129.1-201ENST00000403786 261 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
TRAF1Q13077 U6atac.2-201ENST00000408644 118 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
TRAF1Q13077 Y_RNA.595-201ENST00000410403 105 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
TRAF1Q13077 LINC02331-201ENST00000418927 602 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
TRAF1Q13077 UBL5P3-201ENST00000475112 231 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
TRAF1Q13077 RPL26P26-201ENST00000480251 434 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
TRAF1Q13077 AC074133.1-201ENST00000515696 183 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
TRAF1Q13077 Y_RNA.683-201ENST00000516508 93 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
TRAF1Q13077 AC136932.1-201ENST00000574771 208 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
TRAF1Q13077 MIR4300-201ENST00000581016 96 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
TRAF1Q13077 PRPSAP2-229ENST00000628609 192 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
TRAF1Q13077 TBC1D31-206ENST00000518805 2201 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
TRAF1Q13077 SAGE1-201ENST00000324447 2952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
TRAF1Q13077 MCF2-204ENST00000414978 3813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
TRAF1Q13077 LINC00645-203ENST00000557399 3512 ntTSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
TRAF1Q13077 Y_RNA.143-201ENST00000363520 106 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
TRAF1Q13077 SNORA38-201ENST00000363946 132 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
TRAF1Q13077 MT-TW-201ENST00000387382 68 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
TRAF1Q13077 SNORA46.1-201ENST00000391069 153 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
TRAF1Q13077 AC121342.1-201ENST00000423914 550 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
TRAF1Q13077 AL353743.2-202ENST00000439544 473 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
TRAF1Q13077 AC010095.1-201ENST00000443543 144 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
TRAF1Q13077 AC110588.1-201ENST00000559699 137 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
TRAF1Q13077 AC233702.2-202ENST00000562547 291 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
TRAF1Q13077 AC023824.2-201ENST00000566185 400 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
TRAF1Q13077 TCL6_2.1-201ENST00000615162 119 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
TRAF1Q13077 MIR376A1-201ENST00000616574 68 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
TRAF1Q13077 MIR7515-201ENST00000637837 67 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
TRAF1Q13077 HMHB1-202ENST00000638299 126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
TRAF1Q13077 ANKRD20A9P-201ENST00000457997 2978 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
TRAF1Q13077 MTND5P35-201ENST00000557537 1720 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
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TRAF1Q13077 MDM2-206ENST00000350057 1401 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
TRAF1Q13077 snoU2_19.1-201ENST00000362361 80 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
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TRAF1Q13077 Y_RNA.230-201ENST00000364348 109 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
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TRAF1Q13077 AL356379.1-201ENST00000414105 126 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
TRAF1Q13077 AC096920.1-201ENST00000423991 241 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
TRAF1Q13077 SNORD127-201ENST00000458892 86 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
TRAF1Q13077 RPS23P5-201ENST00000495419 428 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
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TRAF1Q13077 AC022784.2-201ENST00000521298 328 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
TRAF1Q13077 AL356133.2-201ENST00000521572 371 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
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TRAF1Q13077 AK6P2-201ENST00000549020 471 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
TRAF1Q13077 MIR4423-201ENST00000580922 80 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
TRAF1Q13077 MIR3117-201ENST00000584034 78 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
TRAF1Q13077 AL670379.2-201ENST00000604983 252 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
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TRAF1Q13077 AC005562.2-201ENST00000618264 111 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
TRAF1Q13077 ASPM-202ENST00000367408 3747 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
TRAF1Q13077 SNORD81.1-201ENST00000363064 77 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
TRAF1Q13077 RNU6-926P-201ENST00000384075 107 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
TRAF1Q13077 SNORA67.3-201ENST00000384366 140 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
TRAF1Q13077 AL390729.2-201ENST00000416137 156 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
TRAF1Q13077 RPL21P38-201ENST00000418090 167 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
TRAF1Q13077 AC139712.2-201ENST00000424302 339 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
TRAF1Q13077 AC093423.2-201ENST00000429074 437 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
TRAF1Q13077 CBX3P6-201ENST00000430257 527 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
TRAF1Q13077 AL445305.1-201ENST00000432577 575 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
TRAF1Q13077 AC005002.2-201ENST00000438228 269 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
TRAF1Q13077 AC080013.2-201ENST00000460866 323 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
TRAF1Q13077 TRBVB-201ENST00000477100 408 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
TRAF1Q13077 AC023157.2-201ENST00000540596 141 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
TRAF1Q13077 AC104984.5-201ENST00000586878 94 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
TRAF1Q13077 DLX6-AS1_2.1-201ENST00000613701 207 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
TRAF1Q13077 BCL2L11-225ENST00000640419 249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
TRAF1Q13077 FSIP2-206ENST00000611759 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
TRAF1Q13077 RNU1-72P-201ENST00000362976 153 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TRAF1Q13077 Y_RNA.84-201ENST00000363011 104 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TRAF1Q13077 snoU2_19.2-201ENST00000363024 80 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TRAF1Q13077 CLDN10-202ENST00000376855 701 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
TRAF1Q13077 Y_RNA.483-201ENST00000384380 101 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TRAF1Q13077 Y_RNA.581-201ENST00000391017 97 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
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