Protein–RNA interactions for Protein: Q12908

SLC10A2, Ileal sodium/bile acid cotransporter, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A2Q12908 ZNF280D-204ENST00000558320 3666 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
SLC10A2Q12908 AC069528.2-201ENST00000624849 1991 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SLC10A2Q12908 RNU6-655P-201ENST00000362858 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SLC10A2Q12908 RNU5F-3P-201ENST00000363767 117 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SLC10A2Q12908 U3.9-201ENST00000363823 204 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SLC10A2Q12908 Y_RNA.240-201ENST00000364469 95 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SLC10A2Q12908 Y_RNA.304-201ENST00000365011 112 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SLC10A2Q12908 RNU6-1264P-201ENST00000383891 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SLC10A2Q12908 Y_RNA.398-201ENST00000383952 99 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SLC10A2Q12908 RNU6ATAC19P-201ENST00000408096 110 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SLC10A2Q12908 U3.40-201ENST00000408706 208 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SLC10A2Q12908 RNA5SP475-201ENST00000410568 110 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SLC10A2Q12908 Z98742.2-201ENST00000431564 187 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SLC10A2Q12908 AL121580.1-201ENST00000449941 219 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
SLC10A2Q12908 RPS3P1-201ENST00000456781 192 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SLC10A2Q12908 AC004917.1-201ENST00000490856 575 ntTSL 4 BASIC2.55□□□□□ -2
SLC10A2Q12908 AC020703.1-201ENST00000505051 521 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
SLC10A2Q12908 HSPE1P18-201ENST00000517602 280 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SLC10A2Q12908 NCRNA00250-201ENST00000519500 519 ntTSL 4 BASIC2.55□□□□□ -2
SLC10A2Q12908 CYCSP23-201ENST00000519781 313 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SLC10A2Q12908 MRPS18CP4-201ENST00000535821 231 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SLC10A2Q12908 AC107958.3-201ENST00000553410 431 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
SLC10A2Q12908 PTP4A1-204ENST00000578299 135 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
SLC10A2Q12908 RNU6-91P-201ENST00000607774 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SLC10A2Q12908 AL138880.2-201ENST00000616214 239 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SLC10A2Q12908 PARPBP-201ENST00000327680 3014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
SLC10A2Q12908 MIR6073-201ENST00000352083 89 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SLC10A2Q12908 RNU6-1210P-201ENST00000363775 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SLC10A2Q12908 SNORA5B-201ENST00000363786 132 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SLC10A2Q12908 RNA5SP68-201ENST00000363885 119 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SLC10A2Q12908 RNU1-57P-201ENST00000384491 166 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SLC10A2Q12908 RNU6-763P-201ENST00000390865 106 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SLC10A2Q12908 AL357139.1-201ENST00000407792 426 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SLC10A2Q12908 AL365496.1-201ENST00000426885 215 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SLC10A2Q12908 U8.19-201ENST00000459095 133 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SLC10A2Q12908 Y_RNA.637-201ENST00000459424 114 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SLC10A2Q12908 RPL36AP48-201ENST00000485521 314 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SLC10A2Q12908 RNU6-436P-201ENST00000516171 114 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SLC10A2Q12908 AP001001.1-201ENST00000532422 826 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
SLC10A2Q12908 AL157911.1-202ENST00000554123 502 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
SLC10A2Q12908 AC025281.1-201ENST00000567026 265 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SLC10A2Q12908 SNORD11B-201ENST00000607707 90 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SLC10A2Q12908 TCL6_2.1-201ENST00000615162 119 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SLC10A2Q12908 U6.106-201ENST00000636360 105 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SLC10A2Q12908 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
SLC10A2Q12908 AC103988.1-201ENST00000566382 2177 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SLC10A2Q12908 PRKG1-205ENST00000401604 5922 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
SLC10A2Q12908 ZNF804A-202ENST00000613975 3986 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
SLC10A2Q12908 PIK3C2G-202ENST00000433979 4840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
SLC10A2Q12908 RNU6-1048P-201ENST00000364054 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SLC10A2Q12908 SNORD115-30-201ENST00000364117 82 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SLC10A2Q12908 Y_RNA.262-201ENST00000364641 102 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SLC10A2Q12908 MIR196B-201ENST00000384852 84 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SLC10A2Q12908 MIR767-201ENST00000390228 109 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SLC10A2Q12908 NDUFB4P4-201ENST00000404822 243 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SLC10A2Q12908 MIR320B2-201ENST00000408479 138 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SLC10A2Q12908 AC009414.1-201ENST00000427200 443 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SLC10A2Q12908 AC104332.2-201ENST00000429959 156 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SLC10A2Q12908 AL441985.1-201ENST00000457727 251 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SLC10A2Q12908 AL049873.1-201ENST00000480540 376 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SLC10A2Q12908 AL159163.1-201ENST00000507747 600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
SLC10A2Q12908 RNU7-200P-201ENST00000516105 62 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SLC10A2Q12908 RNA5SP148-201ENST00000516527 94 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SLC10A2Q12908 RNU2-44P-201ENST00000516795 194 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SLC10A2Q12908 MIR3144-201ENST00000579460 79 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SLC10A2Q12908 AC130469.1-201ENST00000597256 388 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
SLC10A2Q12908 AL137847.3-201ENST00000611521 109 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SLC10A2Q12908 AC002064.3-201ENST00000623448 346 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SLC10A2Q12908 SLC4A7-201ENST00000295736 7757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
SLC10A2Q12908 LRRC70-201ENST00000334994 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
SLC10A2Q12908 AC134026.1-201ENST00000623249 2239 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SLC10A2Q12908 AC002546.1-201ENST00000588041 2504 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SLC10A2Q12908 SNHG14-215ENST00000551631 4008 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SLC10A2Q12908 MIR21-201ENST00000362134 72 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SLC10A2Q12908 RNU4-10P-201ENST00000364383 140 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SLC10A2Q12908 RNU6-1130P-201ENST00000365434 107 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SLC10A2Q12908 RNU6-1310P-201ENST00000384153 107 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SLC10A2Q12908 SNORA26.5-201ENST00000391215 123 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SLC10A2Q12908 AL031003.1-201ENST00000404229 172 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SLC10A2Q12908 RNA5SP181-201ENST00000410246 98 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SLC10A2Q12908 RNU2-2P-201ENST00000410396 191 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SLC10A2Q12908 RNU6-1077P-201ENST00000410506 102 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SLC10A2Q12908 RNU6-1135P-201ENST00000411083 103 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SLC10A2Q12908 AC005160.1-201ENST00000432405 381 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SLC10A2Q12908 AC007179.2-207ENST00000435557 556 ntTSL 4 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SLC10A2Q12908 RPS12P2-201ENST00000439728 269 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SLC10A2Q12908 TMEM132D-AS1-202ENST00000510001 293 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
SLC10A2Q12908 SNORA31.1-201ENST00000515993 133 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SLC10A2Q12908 MIR449C-201ENST00000516047 92 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SLC10A2Q12908 SNORA31.5-201ENST00000516190 133 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SLC10A2Q12908 RNU6-56P-201ENST00000516986 93 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SLC10A2Q12908 AC068992.1-202ENST00000519280 270 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SLC10A2Q12908 AC079598.5-201ENST00000547460 117 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SLC10A2Q12908 AC027176.1-201ENST00000560204 514 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SLC10A2Q12908 RNU2-4P-201ENST00000606190 192 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SLC10A2Q12908 U2.15-201ENST00000611544 191 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SLC10A2Q12908 U2.16-201ENST00000613119 191 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SLC10A2Q12908 U2.12-201ENST00000613778 191 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SLC10A2Q12908 U2.9-201ENST00000615427 191 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SLC10A2Q12908 MIR6817-201ENST00000615588 66 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.9 ms