Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

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Length 1,464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 RNU6-123P-201ENST00000516163 102 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
GRIN2AQ12879 AP003086.2-201ENST00000534168 437 ntTSL 3 BASIC-0.55□□□□□ -2.5
GRIN2AQ12879 AL139286.2-201ENST00000606838 396 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
GRIN2AQ12879 MPP6-209ENST00000625307 126 ntTSL 5 BASIC-0.55□□□□□ -2.5
GRIN2AQ12879 SNORD115-24-201ENST00000363528 82 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
GRIN2AQ12879 Y_RNA.495-201ENST00000384435 112 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
GRIN2AQ12879 AC008700.1-202ENST00000513657 468 ntTSL 5 BASIC-0.56□□□□□ -2.5
GRIN2AQ12879 MTCO3P27-201ENST00000514397 196 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
GRIN2AQ12879 AC109479.2-201ENST00000517842 174 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
GRIN2AQ12879 AC025647.1-201ENST00000517879 253 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
GRIN2AQ12879 MIR548AO-201ENST00000579992 96 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
GRIN2AQ12879 AL117336.2-201ENST00000602435 335 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
GRIN2AQ12879 ZRANB2-AS2-218ENST00000608360 722 ntTSL 5 BASIC-0.56□□□□□ -2.5
GRIN2AQ12879 AC012409.4-201ENST00000612923 249 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
GRIN2AQ12879 RN7SL660P-201ENST00000614852 299 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
GRIN2AQ12879 FTX_2.1-201ENST00000618816 94 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
GRIN2AQ12879 Y_RNA.583-201ENST00000391033 113 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
GRIN2AQ12879 PCNPP3-201ENST00000393579 471 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
GRIN2AQ12879 RNA5SP118-201ENST00000410385 109 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
GRIN2AQ12879 MTND4P15-201ENST00000437913 1033 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
GRIN2AQ12879 Y_RNA.659-201ENST00000515994 113 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
GRIN2AQ12879 RNU6-977P-201ENST00000516411 103 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
GRIN2AQ12879 RNU7-28P-201ENST00000516759 62 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
GRIN2AQ12879 EBAG9-207ENST00000531677 777 ntTSL 1 (best) BASIC-0.57□□□□□ -2.5
GRIN2AQ12879 AC005176.2-201ENST00000596933 147 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
GRIN2AQ12879 AL355297.3-201ENST00000604082 446 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
GRIN2AQ12879 RBM11P1-201ENST00000604951 799 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
GRIN2AQ12879 TCL6_2.1-201ENST00000615162 119 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
GRIN2AQ12879 Y_RNA.514-201ENST00000384528 112 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
GRIN2AQ12879 EIF4E2P1-201ENST00000393781 255 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
GRIN2AQ12879 AC114491.1-201ENST00000416095 246 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
GRIN2AQ12879 ZNF736P7Y-201ENST00000425158 820 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
GRIN2AQ12879 LINC00354-202ENST00000440860 376 ntTSL 2 BASIC-0.58□□□□□ -2.5
GRIN2AQ12879 AL353743.2-204ENST00000456242 419 ntTSL 3 BASIC-0.58□□□□□ -2.5
GRIN2AQ12879 SNORD126-201ENST00000459475 77 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
GRIN2AQ12879 RNU2-46P-201ENST00000517038 113 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
GRIN2AQ12879 AC009145.3-201ENST00000567386 476 ntTSL 3 BASIC-0.58□□□□□ -2.5
GRIN2AQ12879 MIR4743-201ENST00000584576 69 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
GRIN2AQ12879 AC068792.1-201ENST00000621354 417 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
GRIN2AQ12879 RNU6-336P-201ENST00000364891 107 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
GRIN2AQ12879 SNORD114-12-201ENST00000365400 75 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
GRIN2AQ12879 RNU6-607P-201ENST00000411283 108 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
GRIN2AQ12879 MTCO2P8-201ENST00000412213 658 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
GRIN2AQ12879 AC004386.2-201ENST00000441858 148 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
GRIN2AQ12879 RNU7-56P-201ENST00000458744 62 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
GRIN2AQ12879 RNU7-51P-201ENST00000516560 62 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
GRIN2AQ12879 RNA5SP94-201ENST00000516917 108 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
GRIN2AQ12879 AC105185.1-201ENST00000518705 535 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
GRIN2AQ12879 DEFB131C-201ENST00000528817 165 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
GRIN2AQ12879 AL163973.2-201ENST00000548096 288 ntTSL 3 BASIC-0.59□□□□□ -2.5
GRIN2AQ12879 AC069114.1-201ENST00000580927 287 ntTSL 2 BASIC-0.59□□□□□ -2.5
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GRIN2AQ12879 Y_RNA.256-201ENST00000364594 104 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.5
GRIN2AQ12879 SNORD14C-201ENST00000365382 88 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.5
GRIN2AQ12879 MIR892B-201ENST00000401279 77 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.5
GRIN2AQ12879 RNU6-1304P-201ENST00000411374 106 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.5
GRIN2AQ12879 AL355314.1-201ENST00000453639 316 ntTSL 5 BASIC-0.6□□□□□ -2.5
GRIN2AQ12879 MTND4LP25-201ENST00000570218 163 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.5
GRIN2AQ12879 AL596327.1-201ENST00000603629 213 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.5
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GRIN2AQ12879 snoZ196.1-201ENST00000625269 89 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.5
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GRIN2AQ12879 MIR520C-201ENST00000385005 87 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
GRIN2AQ12879 RNU6-127P-201ENST00000390897 107 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
GRIN2AQ12879 AC091705.1-201ENST00000412197 209 ntTSL 5 BASIC-0.61□□□□□ -2.51
GRIN2AQ12879 AL356361.2-201ENST00000430542 443 ntTSL 3 BASIC-0.61□□□□□ -2.51
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GRIN2AQ12879 AL445523.1-201ENST00000451184 1362 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
GRIN2AQ12879 SNORA36A-201ENST00000384221 132 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
GRIN2AQ12879 MIR586-201ENST00000385035 97 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
GRIN2AQ12879 RPL17P35-201ENST00000432217 549 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
GRIN2AQ12879 AC106744.2-201ENST00000513955 898 ntTSL 5 BASIC-0.61□□□□□ -2.51
GRIN2AQ12879 RN7SKP164-201ENST00000516138 266 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
GRIN2AQ12879 AC022690.2-201ENST00000525673 589 ntTSL 3 BASIC-0.61□□□□□ -2.51
GRIN2AQ12879 AC013828.2-201ENST00000532487 235 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
GRIN2AQ12879 CCDC7-208ENST00000537047 657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC-0.61□□□□□ -2.51
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GRIN2AQ12879 AC027288.2-201ENST00000553028 243 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
GRIN2AQ12879 AC020891.3-201ENST00000560011 363 ntTSL 3 BASIC-0.61□□□□□ -2.51
GRIN2AQ12879 AL670379.3-201ENST00000605040 251 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
GRIN2AQ12879 MIR526A1-201ENST00000384897 85 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
GRIN2AQ12879 RPS29P13-201ENST00000402041 169 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
GRIN2AQ12879 MIR548H2-201ENST00000408874 88 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
GRIN2AQ12879 AC013470.1-201ENST00000453438 462 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
GRIN2AQ12879 AC110799.1-201ENST00000509098 449 ntTSL 3 BASIC-0.62□□□□□ -2.51
GRIN2AQ12879 Y_RNA.696-201ENST00000516725 107 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
GRIN2AQ12879 RNU7-128P-201ENST00000517247 62 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
GRIN2AQ12879 AC010376.1-201ENST00000522101 334 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
GRIN2AQ12879 MIR544B-201ENST00000582372 78 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
GRIN2AQ12879 AC012467.1-201ENST00000607740 256 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
GRIN2AQ12879 SNORA18.1-201ENST00000363418 128 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
GRIN2AQ12879 Y_RNA.336-201ENST00000365307 109 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
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