Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 MIR1273C-201ENST00000578669 77 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
TROQ12816 MIR4752-201ENST00000579672 72 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
TROQ12816 RPL17P51-201ENST00000605218 238 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
TROQ12816 AC104073.3-201ENST00000610942 955 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
TROQ12816 AC091304.9-201ENST00000612091 226 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
TROQ12816 SNORD98-201ENST00000636377 67 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
TROQ12816 RNA5SP48-201ENST00000363969 126 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
TROQ12816 RNU6-975P-201ENST00000384296 105 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
TROQ12816 Y_RNA.555-201ENST00000384673 110 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
TROQ12816 MIR544A-201ENST00000384855 91 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
TROQ12816 MIR1253-201ENST00000408273 105 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
TROQ12816 AC013401.1-202ENST00000422017 626 ntTSL 2 BASIC-0.81□□□□□ -2.54
TROQ12816 AC108488.2-201ENST00000438485 421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC-0.81□□□□□ -2.54
TROQ12816 RNU6-953P-201ENST00000459154 107 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
TROQ12816 XACT-201ENST00000468762 497 ntTSL 5 BASIC-0.81□□□□□ -2.54
TROQ12816 AC027701.1-201ENST00000520155 823 ntTSL 3 BASIC-0.81□□□□□ -2.54
TROQ12816 AC009269.3-201ENST00000558429 472 ntTSL 5 BASIC-0.81□□□□□ -2.54
TROQ12816 AC010525.2-201ENST00000590920 195 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
TROQ12816 AC104458.1-201ENST00000608243 463 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
TROQ12816 MIR6507-201ENST00000613630 70 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
TROQ12816 AC006927.4-201ENST00000639187 543 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
TROQ12816 RNU6-78P-201ENST00000362897 107 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
TROQ12816 RNU6-1048P-201ENST00000364054 107 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
TROQ12816 Y_RNA.288-201ENST00000364854 92 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
TROQ12816 Y_RNA.376-201ENST00000365638 108 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
TROQ12816 RNU6-650P-201ENST00000365658 111 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
TROQ12816 SNORA75B-201ENST00000384053 137 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
TROQ12816 Y_RNA.534-201ENST00000384599 112 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
TROQ12816 SNORA75.1-201ENST00000391130 148 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
TROQ12816 FGFR1OP2P1-201ENST00000395943 500 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
TROQ12816 AL355143.1-201ENST00000407101 841 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
TROQ12816 RNU6ATAC6P-201ENST00000408132 126 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
TROQ12816 MIR1207-201ENST00000408249 87 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
TROQ12816 Y_RNA.623-201ENST00000411128 95 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
TROQ12816 ELOCP21-201ENST00000412558 336 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
TROQ12816 MTND3P17-201ENST00000416968 344 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
TROQ12816 AL355674.1-201ENST00000423681 648 ntTSL 1 (best) BASIC-0.82□□□□□ -2.54
TROQ12816 AL512326.2-201ENST00000426359 151 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
TROQ12816 HSFY7P-201ENST00000432672 318 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
TROQ12816 AC011891.1-201ENST00000437088 432 ntTSL 3 BASIC-0.82□□□□□ -2.54
TROQ12816 HSFY8P-201ENST00000437934 318 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
TROQ12816 ZNF736P1Y-201ENST00000440402 1276 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
TROQ12816 ZNF736P5Y-201ENST00000451173 805 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
TROQ12816 AC009468.2-201ENST00000457372 366 ntTSL 5 BASIC-0.82□□□□□ -2.54
TROQ12816 RNU6-1315P-201ENST00000517187 99 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
TROQ12816 MTND1P36-201ENST00000522384 936 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
TROQ12816 LINC02258-201ENST00000551280 777 ntTSL 2 BASIC-0.82□□□□□ -2.54
TROQ12816 AL122017.1-202ENST00000570612 319 ntTSL 5 BASIC-0.82□□□□□ -2.54
TROQ12816 AC012433.1-201ENST00000588916 398 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
TROQ12816 AP001033.2-201ENST00000609701 1003 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
TROQ12816 AC010999.1-201ENST00000611856 324 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
TROQ12816 MESTIT1_1.1-201ENST00000618871 140 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
TROQ12816 Y_RNA.33-201ENST00000362591 102 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
TROQ12816 MIR300-201ENST00000401138 83 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
TROQ12816 MIR1283-1-201ENST00000408494 87 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
TROQ12816 PLCL2-AS1-201ENST00000414844 311 ntTSL 2 BASIC-0.83□□□□□ -2.54
TROQ12816 AC004543.1-201ENST00000418764 369 ntTSL 5 BASIC-0.83□□□□□ -2.54
TROQ12816 USP9YP28-201ENST00000435142 589 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
TROQ12816 TPTE2P1-204ENST00000435256 593 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
TROQ12816 MIR2115-201ENST00000516657 100 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
TROQ12816 RNA5SP66-201ENST00000517178 101 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
TROQ12816 AC026616.1-201ENST00000523157 525 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
TROQ12816 AP001372.4-201ENST00000524889 472 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
TROQ12816 AP001189.2-201ENST00000527320 189 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
TROQ12816 AP003168.1-201ENST00000530091 307 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
TROQ12816 UBE2Q2P8-201ENST00000560644 102 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
TROQ12816 MIR3165-201ENST00000579874 75 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
TROQ12816 AL355512.1-202ENST00000607952 209 ntTSL 5 BASIC-0.83□□□□□ -2.54
TROQ12816 AC104260.1-201ENST00000616660 539 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
TROQ12816 AC092104.1-201ENST00000497346 1441 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
TROQ12816 E2F5-208ENST00000521429 1551 ntTSL 5 BASIC-0.83□□□□□ -2.54
TROQ12816 AC099786.3-201ENST00000565735 1410 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
TROQ12816 MIRLET7C-201ENST00000362160 84 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
TROQ12816 SNORD65C-201ENST00000390962 71 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
TROQ12816 MIR1305-201ENST00000408300 86 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
TROQ12816 AL627311.1-201ENST00000431514 115 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
TROQ12816 SUMO1P3-201ENST00000439961 304 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
TROQ12816 RNU7-102P-201ENST00000458948 62 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
TROQ12816 RNU7-128P-201ENST00000517247 62 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
TROQ12816 RNA5SP169-201ENST00000517268 117 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
TROQ12816 AC007948.1-201ENST00000581632 242 ntTSL 5 BASIC-0.84□□□□□ -2.54
TROQ12816 AC134878.1-201ENST00000619901 243 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
TROQ12816 AL136221.1-201ENST00000621449 509 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
TROQ12816 AL008636.1-201ENST00000625038 1018 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
TROQ12816 AC091304.10-201ENST00000641554 121 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
TROQ12816 RNU6-1141P-201ENST00000364520 107 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
TROQ12816 RNU4-56P-201ENST00000364700 142 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
TROQ12816 RNU6-701P-201ENST00000384059 107 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
TROQ12816 RNU6-447P-201ENST00000410293 104 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
TROQ12816 RNU6-1118P-201ENST00000410382 104 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
TROQ12816 RNU6-1076P-201ENST00000410397 104 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
TROQ12816 RNU6-355P-201ENST00000410427 104 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
TROQ12816 RNU6-791P-201ENST00000410467 104 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
TROQ12816 RNU6-705P-201ENST00000410601 104 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
TROQ12816 RNU6-1100P-201ENST00000410691 104 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
TROQ12816 RNU6-860P-201ENST00000410860 104 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
TROQ12816 RNU6-1217P-201ENST00000411276 104 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
TROQ12816 RNU6-785P-201ENST00000411324 104 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
TROQ12816 AL096799.1-201ENST00000425900 381 ntTSL 2 BASIC-0.85□□□□□ -2.55
TROQ12816 AF129075.1-201ENST00000457162 794 ntTSL 3 BASIC-0.85□□□□□ -2.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.8 ms