Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 RNU6-326P-201ENST00000365480 107 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PGGT1BP53609 RNU6-245P-201ENST00000384020 107 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PGGT1BP53609 SNORD58.1-201ENST00000391313 66 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PGGT1BP53609 MIR1298-201ENST00000408783 112 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PGGT1BP53609 RNA5SP504-201ENST00000410676 117 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PGGT1BP53609 RNU6-1199P-201ENST00000411249 104 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PGGT1BP53609 AL139156.1-201ENST00000412785 841 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PGGT1BP53609 AC093382.1-201ENST00000413311 379 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
PGGT1BP53609 EIF4EP4-201ENST00000424916 578 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PGGT1BP53609 LINC02336-201ENST00000434117 330 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
PGGT1BP53609 RPS15AP28-201ENST00000435088 386 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PGGT1BP53609 MTND2P29-201ENST00000438595 412 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PGGT1BP53609 RNU4-71P-201ENST00000516258 113 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PGGT1BP53609 RNU6-155P-201ENST00000516347 100 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PGGT1BP53609 RNU2-44P-201ENST00000516795 194 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PGGT1BP53609 AC023442.3-201ENST00000532199 495 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
PGGT1BP53609 PTP4A1-204ENST00000578299 135 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
PGGT1BP53609 AC105245.1-201ENST00000581934 244 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PGGT1BP53609 RPL30P11-203ENST00000598995 310 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PGGT1BP53609 SNRPGP20-201ENST00000604477 205 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PGGT1BP53609 AC022441.3-201ENST00000605737 136 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PGGT1BP53609 AC067747.1-201ENST00000608026 250 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PGGT1BP53609 U4.3-201ENST00000621047 82 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PGGT1BP53609 AL807742.1-203ENST00000637444 759 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
PGGT1BP53609 GABRG2-209ENST00000638660 3799 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.04
PGGT1BP53609 SACS-201ENST00000382292 15324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
PGGT1BP53609 RMDN2-203ENST00000402091 1973 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
PGGT1BP53609 RNA5SP289-201ENST00000362332 137 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PGGT1BP53609 RNU1-62P-201ENST00000362599 164 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PGGT1BP53609 RNU4-80P-201ENST00000363200 141 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PGGT1BP53609 Y_RNA.200-201ENST00000364018 102 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PGGT1BP53609 Y_RNA.230-201ENST00000364348 109 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PGGT1BP53609 SNORD114-30-201ENST00000364448 72 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PGGT1BP53609 RNU6-1328P-201ENST00000410938 106 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PGGT1BP53609 AC097662.1-205ENST00000433324 241 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
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PGGT1BP53609 AC108488.2-201ENST00000438485 421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
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PGGT1BP53609 AC005154.1-208ENST00000440438 353 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
PGGT1BP53609 AC069023.1-201ENST00000442231 221 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
PGGT1BP53609 SUMO1P2-201ENST00000452524 304 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PGGT1BP53609 AC137770.1-201ENST00000504620 530 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
PGGT1BP53609 LNX1-AS1-202ENST00000510785 550 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
PGGT1BP53609 AC074133.1-201ENST00000515696 183 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PGGT1BP53609 RPPH1-2P-201ENST00000516688 293 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
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PGGT1BP53609 DEFB117-201ENST00000602356 141 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PGGT1BP53609 AC037487.3-201ENST00000606668 112 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
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PGGT1BP53609 RNA5SP475-201ENST00000410568 110 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
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PGGT1BP53609 Y_RNA.679-201ENST00000516416 91 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PGGT1BP53609 AC022559.1-201ENST00000520905 205 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PGGT1BP53609 AC090616.3-201ENST00000582184 217 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PGGT1BP53609 AL162424.1-201ENST00000602325 221 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PGGT1BP53609 AL670379.2-201ENST00000604983 252 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
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PGGT1BP53609 AL365434.2-201ENST00000607979 234 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PGGT1BP53609 AC004792.1-201ENST00000614523 137 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PGGT1BP53609 MIR1291-201ENST00000627649 87 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PGGT1BP53609 ANKRD30BP1-201ENST00000451052 2186 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PGGT1BP53609 SKIL-203ENST00000426052 2757 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
PGGT1BP53609 Y_RNA.29-201ENST00000362570 113 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PGGT1BP53609 RNU1-72P-201ENST00000362976 153 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PGGT1BP53609 RNU6-944P-201ENST00000364023 107 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
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