Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

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Length 3,210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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CENPFP49454 AC239868.4-201ENST00000608318 671 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
CENPFP49454 AL391834.1-201ENST00000609609 560 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
CENPFP49454 AC106754.2-201ENST00000623006 233 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
CENPFP49454 Y_RNA.244-201ENST00000364484 109 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
CENPFP49454 RNU6-1306P-201ENST00000365219 99 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
CENPFP49454 Y_RNA.591-201ENST00000410228 104 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
CENPFP49454 RNU7-73P-201ENST00000458743 63 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
CENPFP49454 MIR466-201ENST00000580653 84 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
CENPFP49454 AC080188.3-201ENST00000624842 748 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
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CENPFP49454 CAPZA2-214ENST00000628758 525 ntTSL 5 BASIC-1.8□□□□□ -2.7
CENPFP49454 MTND3P8-201ENST00000412909 339 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
CENPFP49454 MTATP6P26-201ENST00000445926 662 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
CENPFP49454 BNIP3P24-201ENST00000593398 557 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
CENPFP49454 LRRIQ3-204ENST00000395089 2673 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC-1.8□□□□□ -2.7
CENPFP49454 Y_RNA.247-201ENST00000364500 92 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
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CENPFP49454 HGF-207ENST00000453018 721 ntTSL 3 BASIC-1.81□□□□□ -2.7
CENPFP49454 AC093259.1-201ENST00000509755 300 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
CENPFP49454 LINC02500-201ENST00000512547 493 ntTSL 3 BASIC-1.81□□□□□ -2.7
CENPFP49454 AC060788.1-201ENST00000521318 469 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
CENPFP49454 AP003072.1-201ENST00000531740 145 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
CENPFP49454 MIR6818-201ENST00000621576 65 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
CENPFP49454 AC010255.2-201ENST00000505209 428 ntTSL 3 BASIC-1.81□□□□□ -2.7
CENPFP49454 MTND2P33-201ENST00000506452 1031 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
CENPFP49454 AC013417.1-201ENST00000549896 271 ntTSL 5 BASIC-1.81□□□□□ -2.7
CENPFP49454 RNU6-31P-201ENST00000384388 108 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
CENPFP49454 MTCO3P29-201ENST00000432119 779 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
CENPFP49454 MIR3921-201ENST00000577308 85 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
CENPFP49454 MIR215-201ENST00000384858 110 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
CENPFP49454 MIR29B1-201ENST00000385015 81 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
CENPFP49454 SNORD45.4-201ENST00000516629 73 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
CENPFP49454 AC025917.1-202ENST00000566344 635 ntTSL 5 BASIC-1.82□□□□□ -2.7
CENPFP49454 RNU6-784P-201ENST00000384330 106 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
CENPFP49454 AC010154.1-201ENST00000425857 269 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
CENPFP49454 USP9YP14-201ENST00000430663 563 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
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CENPFP49454 AC012668.1-201ENST00000457625 228 ntTSL 3 BASIC-1.83□□□□□ -2.7
CENPFP49454 SNORD32B-201ENST00000364460 84 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
CENPFP49454 Y_RNA.511-201ENST00000384514 103 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
CENPFP49454 PPP1R11P2-201ENST00000423543 382 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
CENPFP49454 RPS24P1-201ENST00000438550 371 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
CENPFP49454 Z82210.1-201ENST00000440037 231 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
CENPFP49454 SNORA25.11-201ENST00000515935 105 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
CENPFP49454 AC215217.1-201ENST00000562162 347 ntTSL 3 BASIC-1.83□□□□□ -2.7
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CENPFP49454 SNORD24-201ENST00000383884 75 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
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CENPFP49454 CCDC7-209ENST00000539197 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC-1.83□□□□□ -2.7
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CENPFP49454 Y_RNA.396-201ENST00000383949 103 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
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CENPFP49454 MIR802-201ENST00000390235 94 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
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CENPFP49454 AC112771.1-201ENST00000463581 102 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
CENPFP49454 AC099520.1-206ENST00000523434 486 ntTSL 3 BASIC-1.84□□□□□ -2.7
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CENPFP49454 RPL36P19-201ENST00000430744 301 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
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CENPFP49454 AC122133.1-201ENST00000613964 233 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
CENPFP49454 Y_RNA.174-201ENST00000363781 105 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.7
CENPFP49454 RNU4-76P-201ENST00000364509 141 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.7
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CENPFP49454 AC023512.1-201ENST00000444513 499 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.7
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CENPFP49454 RNU6-466P-201ENST00000391224 103 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
CENPFP49454 LINC02220-201ENST00000510065 270 ntTSL 5 BASIC-1.85□□□□□ -2.71
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CENPFP49454 AC090680.2-201ENST00000550279 742 ntTSL 3 BASIC-1.85□□□□□ -2.71
CENPFP49454 RNU6-862P-201ENST00000362804 105 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
CENPFP49454 Y_RNA.250-201ENST00000364542 110 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
CENPFP49454 AL138830.1-201ENST00000435802 402 ntTSL 3 BASIC-1.86□□□□□ -2.71
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CENPFP49454 Y_RNA.23-201ENST00000362496 106 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
CENPFP49454 SNORD115-33-201ENST00000363723 82 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
CENPFP49454 RNU6-1130P-201ENST00000365434 107 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
CENPFP49454 AL122017.1-201ENST00000435858 784 ntTSL 2 BASIC-1.86□□□□□ -2.71
CENPFP49454 AC018448.1-201ENST00000552843 316 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
CENPFP49454 AL139021.2-201ENST00000556390 399 ntTSL 3 BASIC-1.86□□□□□ -2.71
CENPFP49454 AC093249.1-201ENST00000567049 203 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
CENPFP49454 AC016542.1-201ENST00000608259 493 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
CENPFP49454 Y_RNA.38-201ENST00000362617 102 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
CENPFP49454 RNU5B-2P-201ENST00000363036 113 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
CENPFP49454 FAM204CP-201ENST00000424489 642 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
CENPFP49454 AC046134.1-201ENST00000514454 666 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
CENPFP49454 AC090617.3-201ENST00000573670 475 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
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