Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ13

SHOC2, Leucine-rich repeat protein SHOC-2, humanhuman

Predictions only

Length 582 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHOC2Q9UQ13 ETDC-201ENST00000635820 180 ntAPPRIS P1 BASIC2.61□□□□□ -1.99
SHOC2Q9UQ13 MIR3674-201ENST00000636576 68 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SHOC2Q9UQ13 U6.104-201ENST00000637979 90 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SHOC2Q9UQ13 CYSLTR1-201ENST00000373304 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
SHOC2Q9UQ13 PTPN22-203ENST00000460620 1794 ntTSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
SHOC2Q9UQ13 GABRG2-209ENST00000638660 3799 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
SHOC2Q9UQ13 UHMK1-204ENST00000545294 8117 ntTSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
SHOC2Q9UQ13 MYSM1-208ENST00000622766 6020 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
SHOC2Q9UQ13 Y_RNA.230-201ENST00000364348 109 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SHOC2Q9UQ13 RNA5SP240-201ENST00000365355 128 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SHOC2Q9UQ13 RNU6-1264P-201ENST00000383891 107 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SHOC2Q9UQ13 RNU6-1026P-201ENST00000384465 108 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SHOC2Q9UQ13 RNU6-21P-201ENST00000384710 107 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SHOC2Q9UQ13 MIR548B-201ENST00000385247 97 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SHOC2Q9UQ13 BCL2L11-207ENST00000405953 425 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
SHOC2Q9UQ13 RNA5SP184-201ENST00000411071 108 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SHOC2Q9UQ13 AL109933.2-201ENST00000452651 260 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SHOC2Q9UQ13 RNU6-1132P-201ENST00000459214 107 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SHOC2Q9UQ13 HMGN2P9-201ENST00000476875 229 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SHOC2Q9UQ13 HMGB3P17-201ENST00000504195 649 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SHOC2Q9UQ13 DEFB108E-201ENST00000524692 240 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SHOC2Q9UQ13 LINC02165-201ENST00000563061 443 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
SHOC2Q9UQ13 BCL2L11-225ENST00000640419 249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
SHOC2Q9UQ13 MCMDC2-207ENST00000492775 1831 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
SHOC2Q9UQ13 MAP4K3-205ENST00000437545 3924 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
SHOC2Q9UQ13 Z82209.1-201ENST00000422141 2135 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SHOC2Q9UQ13 CYLC2-201ENST00000374798 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
SHOC2Q9UQ13 NEB-203ENST00000397345 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
SHOC2Q9UQ13 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
SHOC2Q9UQ13 RMDN2-203ENST00000402091 1973 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
SHOC2Q9UQ13 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
SHOC2Q9UQ13 NOC3L-201ENST00000371361 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
SHOC2Q9UQ13 MARCH7-203ENST00000409591 2147 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
SHOC2Q9UQ13 PIK3C2G-203ENST00000535651 2497 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
SHOC2Q9UQ13 Y_RNA.237-201ENST00000364439 102 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SHOC2Q9UQ13 Y_RNA.331-201ENST00000365267 102 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SHOC2Q9UQ13 MIR586-201ENST00000385035 97 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SHOC2Q9UQ13 TRDJ3-201ENST00000390476 59 ntAPPRIS P1 BASIC2.59□□□□□ -1.99
SHOC2Q9UQ13 TRAJ48-201ENST00000390489 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.59□□□□□ -1.99
SHOC2Q9UQ13 MIR1283-1-201ENST00000408494 87 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SHOC2Q9UQ13 RNA5SP475-201ENST00000410568 110 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SHOC2Q9UQ13 LINC02041-201ENST00000440726 246 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
SHOC2Q9UQ13 SEPT14P8-201ENST00000508026 178 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SHOC2Q9UQ13 PRELID2P1-201ENST00000552837 301 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SHOC2Q9UQ13 MIR3671-201ENST00000580455 88 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SHOC2Q9UQ13 SNORD113-5-201ENST00000607261 78 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SHOC2Q9UQ13 TPTE2-204ENST00000400103 1652 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
SHOC2Q9UQ13 RNU4-90P-201ENST00000362773 141 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SHOC2Q9UQ13 Y_RNA.188-201ENST00000363952 111 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SHOC2Q9UQ13 RNA5SP181-201ENST00000410246 98 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SHOC2Q9UQ13 RNU2-48P-201ENST00000410694 191 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SHOC2Q9UQ13 Y_RNA.618-201ENST00000410949 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SHOC2Q9UQ13 AC097662.1-205ENST00000433324 241 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
SHOC2Q9UQ13 AC104389.3-201ENST00000445629 235 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SHOC2Q9UQ13 SRI-210ENST00000490437 570 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
SHOC2Q9UQ13 Y_RNA.680-201ENST00000516441 93 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SHOC2Q9UQ13 SCARNA24.2-201ENST00000516968 130 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SHOC2Q9UQ13 RNU6-1271P-201ENST00000517049 105 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SHOC2Q9UQ13 AC022469.2-201ENST00000554759 396 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
SHOC2Q9UQ13 AC012433.1-201ENST00000588916 398 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SHOC2Q9UQ13 AC022441.3-201ENST00000605737 136 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SHOC2Q9UQ13 SDR42E1P4-201ENST00000620894 481 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SHOC2Q9UQ13 AC006001.4-201ENST00000622243 395 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SHOC2Q9UQ13 IGHVIII-44-202ENST00000636235 289 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SHOC2Q9UQ13 MTND5P6-201ENST00000422338 1798 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SHOC2Q9UQ13 TMPRSS11A-201ENST00000334830 3054 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
SHOC2Q9UQ13 ZNF470-202ENST00000391709 6601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
SHOC2Q9UQ13 Y_RNA.14-201ENST00000362415 103 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SHOC2Q9UQ13 SNORD81.1-201ENST00000363064 77 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SHOC2Q9UQ13 U3.8-201ENST00000363675 217 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SHOC2Q9UQ13 RNA5SP456-201ENST00000364002 114 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SHOC2Q9UQ13 RNU6-454P-201ENST00000364292 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SHOC2Q9UQ13 RNU6-290P-201ENST00000365212 101 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SHOC2Q9UQ13 Y_RNA.446-201ENST00000384178 104 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SHOC2Q9UQ13 Y_RNA.447-201ENST00000384184 113 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SHOC2Q9UQ13 HMGN2P18-201ENST00000450680 270 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SHOC2Q9UQ13 AC018868.1-201ENST00000491307 315 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SHOC2Q9UQ13 RNU6-991P-201ENST00000516168 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SHOC2Q9UQ13 RNU6-1338P-201ENST00000516328 91 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SHOC2Q9UQ13 RNU6-155P-201ENST00000516347 100 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SHOC2Q9UQ13 RNA5SP490-201ENST00000517141 136 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SHOC2Q9UQ13 AC087463.2-201ENST00000565943 472 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
SHOC2Q9UQ13 MIR4753-201ENST00000585119 83 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SHOC2Q9UQ13 C1orf141-205ENST00000475209 2079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
SHOC2Q9UQ13 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
SHOC2Q9UQ13 DENND4A-202ENST00000443035 8665 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
SHOC2Q9UQ13 AL391987.6-201ENST00000305671 199 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SHOC2Q9UQ13 MIR410-201ENST00000362222 80 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SHOC2Q9UQ13 SNORD31B-201ENST00000364977 69 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SHOC2Q9UQ13 Y_RNA.350-201ENST00000365409 98 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SHOC2Q9UQ13 RNU6-1310P-201ENST00000384153 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SHOC2Q9UQ13 Y_RNA.477-201ENST00000384352 108 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SHOC2Q9UQ13 Y_RNA.518-201ENST00000384552 113 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SHOC2Q9UQ13 MIR300-201ENST00000401138 83 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SHOC2Q9UQ13 RNU6-1199P-201ENST00000411249 104 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SHOC2Q9UQ13 AL390729.2-201ENST00000416137 156 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SHOC2Q9UQ13 AC016717.1-201ENST00000448918 286 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SHOC2Q9UQ13 MTND1P19-201ENST00000511780 315 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SHOC2Q9UQ13 RNU6-667P-201ENST00000517186 102 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SHOC2Q9UQ13 AC009107.1-201ENST00000561923 330 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
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