Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 TMEM232-201ENST00000455884 2501 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
USP18Q9UMW8 SMARCAD1-206ENST00000509418 2348 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
USP18Q9UMW8 ZMYM2-203ENST00000382874 10139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
USP18Q9UMW8 SCOC-201ENST00000338517 1864 ntTSL 4 BASIC2.95□□□□□ -1.94
USP18Q9UMW8 RNU6-944P-201ENST00000364023 107 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
USP18Q9UMW8 Y_RNA.277-201ENST00000364754 102 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
USP18Q9UMW8 SNORA72.2-201ENST00000365028 127 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
USP18Q9UMW8 Y_RNA.418-201ENST00000384029 102 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
USP18Q9UMW8 RNU2-54P-201ENST00000410299 190 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
USP18Q9UMW8 RNA5SP475-201ENST00000410568 110 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
USP18Q9UMW8 AL353680.1-201ENST00000433788 337 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
USP18Q9UMW8 RPL23AP3-201ENST00000453844 468 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
USP18Q9UMW8 AC080013.2-201ENST00000460866 323 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
USP18Q9UMW8 RNA5SP24-201ENST00000516478 95 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
USP18Q9UMW8 RNU6-1098P-201ENST00000516772 96 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
USP18Q9UMW8 RNU6-56P-201ENST00000516986 93 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
USP18Q9UMW8 AP003171.1-201ENST00000532770 266 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
USP18Q9UMW8 AC105245.1-201ENST00000581934 244 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
USP18Q9UMW8 AC009779.6-201ENST00000603972 165 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
USP18Q9UMW8 ZEB2_AS1_1.1-201ENST00000621504 128 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
USP18Q9UMW8 AC064859.1-201ENST00000624741 174 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
USP18Q9UMW8 ZBED5-202ENST00000432999 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
USP18Q9UMW8 AC080128.1-201ENST00000474389 1917 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
USP18Q9UMW8 SIRT1-202ENST00000403579 3333 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
USP18Q9UMW8 RMDN2-203ENST00000402091 1973 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
USP18Q9UMW8 MINDY3-202ENST00000378036 2452 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
USP18Q9UMW8 AC135776.4-201ENST00000624300 1904 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
USP18Q9UMW8 SLC4A7-201ENST00000295736 7757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
USP18Q9UMW8 Y_RNA.383-201ENST00000383855 97 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
USP18Q9UMW8 MIR218-1-201ENST00000384999 110 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
USP18Q9UMW8 MARCH7-203ENST00000409591 2147 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
USP18Q9UMW8 AC009963.1-201ENST00000417265 157 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
USP18Q9UMW8 Z98949.2-201ENST00000440996 144 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
USP18Q9UMW8 AC069023.1-201ENST00000442231 221 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
USP18Q9UMW8 RNU2-12P-201ENST00000517216 168 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
USP18Q9UMW8 RNU6-586P-201ENST00000517265 104 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
USP18Q9UMW8 AC022784.2-201ENST00000521298 328 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
USP18Q9UMW8 AC069133.1-201ENST00000522857 566 ntTSL 4 BASIC2.94□□□□□ -1.94
USP18Q9UMW8 MIR3199-1-201ENST00000582434 88 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
USP18Q9UMW8 AL109918.3-201ENST00000603072 338 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
USP18Q9UMW8 AC069294.1-201ENST00000608397 350 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
USP18Q9UMW8 LEKR1-212ENST00000640869 237 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
USP18Q9UMW8 MIR133A1HG-202ENST00000581072 4226 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
USP18Q9UMW8 TTC6-201ENST00000267368 1681 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
USP18Q9UMW8 MBNL3-205ENST00000370857 8760 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
USP18Q9UMW8 ROCK2-203ENST00000401753 4017 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
USP18Q9UMW8 OSTN-201ENST00000339051 402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
USP18Q9UMW8 Y_RNA.44-201ENST00000362676 108 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
USP18Q9UMW8 Y_RNA.54-201ENST00000362766 105 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
USP18Q9UMW8 U3.8-201ENST00000363675 217 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
USP18Q9UMW8 RNU6-454P-201ENST00000364292 107 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
USP18Q9UMW8 SNORD21-201ENST00000383953 95 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
USP18Q9UMW8 MIR586-201ENST00000385035 97 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
USP18Q9UMW8 MIR1294-201ENST00000408503 142 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
USP18Q9UMW8 RN7SKP123-201ENST00000410732 291 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
USP18Q9UMW8 AL358234.1-201ENST00000421132 273 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
USP18Q9UMW8 MTCO1P5-201ENST00000433573 344 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
USP18Q9UMW8 POLR2KP2-201ENST00000438155 177 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
USP18Q9UMW8 U91324.1-201ENST00000442864 447 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
USP18Q9UMW8 AL139109.1-201ENST00000455491 297 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
USP18Q9UMW8 AC003982.1-202ENST00000469928 248 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
USP18Q9UMW8 RNU4-71P-201ENST00000516258 113 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
USP18Q9UMW8 RNU1-117P-201ENST00000517041 158 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
USP18Q9UMW8 AC007536.1-201ENST00000533382 349 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
USP18Q9UMW8 SNORD53-201ENST00000579969 78 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
USP18Q9UMW8 AC006504.5-204ENST00000592404 765 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
USP18Q9UMW8 AC037487.3-201ENST00000606668 112 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
USP18Q9UMW8 N4BP2L2-211ENST00000504114 2513 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
USP18Q9UMW8 PRKACB-218ENST00000610703 4240 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
USP18Q9UMW8 UBE2WP1-201ENST00000362030 340 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
USP18Q9UMW8 U8.9-201ENST00000365667 134 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
USP18Q9UMW8 MIR95-201ENST00000385072 81 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
USP18Q9UMW8 RNU2-64P-201ENST00000411315 191 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
USP18Q9UMW8 AC093382.1-201ENST00000413311 379 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
USP18Q9UMW8 MRPS10P1-201ENST00000448483 130 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
USP18Q9UMW8 AC090515.1-201ENST00000465295 476 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
USP18Q9UMW8 AC137770.1-201ENST00000504620 530 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
USP18Q9UMW8 AC087463.2-201ENST00000565943 472 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
USP18Q9UMW8 AL355512.1-202ENST00000607952 209 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
USP18Q9UMW8 PRKG1-205ENST00000401604 5922 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
USP18Q9UMW8 CACNB4-238ENST00000636901 7706 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
USP18Q9UMW8 FOXP2-211ENST00000408937 6443 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
USP18Q9UMW8 MIR26A1-201ENST00000362205 77 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
USP18Q9UMW8 Y_RNA.269-201ENST00000364685 89 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
USP18Q9UMW8 RNU6-200P-201ENST00000364743 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
USP18Q9UMW8 MIR548B-201ENST00000385247 97 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
USP18Q9UMW8 AL590004.2-201ENST00000404787 371 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
USP18Q9UMW8 Z82209.1-201ENST00000422141 2135 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
USP18Q9UMW8 TOMM22P2-201ENST00000430735 237 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
USP18Q9UMW8 AC093893.1-201ENST00000505781 510 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
USP18Q9UMW8 SNORA9.3-201ENST00000516383 129 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
USP18Q9UMW8 RNU5F-4P-201ENST00000516581 114 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
USP18Q9UMW8 RNU6-107P-201ENST00000516643 102 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
USP18Q9UMW8 SNORA27.4-201ENST00000516650 95 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
USP18Q9UMW8 MIR3605-201ENST00000583214 100 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
USP18Q9UMW8 ZNF861P-201ENST00000588126 639 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
USP18Q9UMW8 AC023043.3-201ENST00000593113 385 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
USP18Q9UMW8 ZNRD1-AS1_2.5-201ENST00000614729 76 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
USP18Q9UMW8 KCNQ1OT1_5.1-201ENST00000621902 226 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
USP18Q9UMW8 AL160287.1-202ENST00000638113 454 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
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