Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ3

KRTAP9-3, Keratin-associated protein 9-3, humanhuman

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-3Q9BYQ3 DCLK1-204ENST00000379893 4612 ntTSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 SETDB2-205ENST00000611815 5313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 HYDIN-201ENST00000288168 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 WDPCP-203ENST00000409120 5408 ntTSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 FLG-201ENST00000368799 12747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 MBNL1-204ENST00000324210 5465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 DOPEY1-201ENST00000237163 7995 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 RABGAP1L-208ENST00000392064 6282 ntTSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 MDM4-203ENST00000367182 10073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR331-201ENST00000362302 94 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-833P-201ENST00000363486 107 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 5S_rRNA.1-201ENST00000364415 116 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 Y_RNA.239-201ENST00000364444 113 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-198P-201ENST00000384258 104 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 Y_RNA.537-201ENST00000384626 109 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-1237P-201ENST00000384777 107 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR452-201ENST00000385020 85 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR136-201ENST00000385207 82 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNA5SP237-201ENST00000410414 113 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 RPS27P16-201ENST00000425758 201 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 CST2P1-201ENST00000425770 87 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC027119.1-201ENST00000440877 241 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
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KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORA59A-201ENST00000459326 152 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC02269-201ENST00000509968 511 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-982P-201ENST00000516216 102 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNA5SP168-201ENST00000516642 112 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 TEK-204ENST00000519097 3836 ntTSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL162274.2-201ENST00000614406 332 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 MED23-203ENST00000368058 4576 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 CREB5-201ENST00000357727 8532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 ABCG2-204ENST00000515655 4276 ntTSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 SMNDC1-202ENST00000369603 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 RAD17-206ENST00000358030 2648 ntTSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 WDR64-201ENST00000366552 4371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 RYR3-208ENST00000622037 15564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 DAAM1-202ENST00000395125 5806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 EYA1-205ENST00000388742 3907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 PPFIBP1-201ENST00000228425 5933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 NFAT5-202ENST00000354436 13229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 EMSY-207ENST00000525919 4074 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
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KRTAP9-3Q9BYQ3 ZFX-211ENST00000539115 6801 ntTSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 PTPRZ1-201ENST00000393386 8175 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 ADGRL3-218ENST00000514996 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
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KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR607-201ENST00000385241 96 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 AP003025.1-201ENST00000421650 149 ntTSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-274P-201ENST00000459566 107 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 RN7SL636P-201ENST00000497504 294 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
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KRTAP9-3Q9BYQ3 PCDH18-201ENST00000344876 5906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
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KRTAP9-3Q9BYQ3 ERBIN-214ENST00000511297 4257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 ATG12-208ENST00000509910 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 ARHGEF12-213ENST00000532993 8753 ntTSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 LRRC9-202ENST00000445360 4717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNF17-201ENST00000255324 5119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.04□□□□□ -2.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 DPCR1-202ENST00000462446 5314 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 NCOA7-202ENST00000368357 5521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 WDR35-202ENST00000345530 6960 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 EYA4-202ENST00000355286 4317 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 ANKRD36B-202ENST00000359901 4297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
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KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR554-201ENST00000384874 96 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORD28B-201ENST00000390993 75 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 CCDC110-202ENST00000393540 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORA11.1-201ENST00000408133 129 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-628P-201ENST00000410675 107 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 RYR3-202ENST00000415757 15557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.04□□□□□ -2.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 HMGN2P21-201ENST00000447764 270 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 DPY19L2P1-203ENST00000458672 3347 ntTSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 BRCA1-210ENST00000471181 5936 ntTSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 RPL29-203ENST00000475248 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 CLDND1-208ENST00000503004 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
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