Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXA9

SALL3, Sal-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL3Q9BXA9 AC083973.1-205ENST00000518994 601 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SALL3Q9BXA9 MIR5695-201ENST00000579717 85 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SALL3Q9BXA9 AC090897.2-201ENST00000581715 130 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SALL3Q9BXA9 ZNFX1-AS1_2.1-201ENST00000610973 93 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SALL3Q9BXA9 CATSPERB-201ENST00000256343 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
SALL3Q9BXA9 MGAT4C-211ENST00000621808 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
SALL3Q9BXA9 RNU6-545P-201ENST00000362681 104 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SALL3Q9BXA9 Y_RNA.82-201ENST00000363000 102 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SALL3Q9BXA9 Y_RNA.92-201ENST00000363043 102 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SALL3Q9BXA9 Y_RNA.235-201ENST00000364412 102 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SALL3Q9BXA9 Y_RNA.286-201ENST00000364813 102 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SALL3Q9BXA9 Y_RNA.306-201ENST00000365015 102 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SALL3Q9BXA9 Y_RNA.312-201ENST00000365089 102 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SALL3Q9BXA9 Y_RNA.322-201ENST00000365151 102 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SALL3Q9BXA9 RNU6-21P-201ENST00000384710 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SALL3Q9BXA9 TRAJ48-201ENST00000390489 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.91□□□□□ -1.94
SALL3Q9BXA9 CYCSP48-201ENST00000417124 323 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SALL3Q9BXA9 LINC01701-201ENST00000419614 451 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
SALL3Q9BXA9 AC009414.1-201ENST00000427200 443 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SALL3Q9BXA9 AC012308.1-201ENST00000451232 178 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SALL3Q9BXA9 AC007395.1-201ENST00000451333 677 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SALL3Q9BXA9 Y_RNA.650-201ENST00000459002 102 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SALL3Q9BXA9 AC234781.5-201ENST00000508429 271 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SALL3Q9BXA9 AC008869.1-201ENST00000510938 442 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
SALL3Q9BXA9 AC074133.1-201ENST00000515696 183 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SALL3Q9BXA9 RNU6-581P-201ENST00000516214 105 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SALL3Q9BXA9 RNU6-346P-201ENST00000516288 111 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SALL3Q9BXA9 Y_RNA.676-201ENST00000516393 96 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SALL3Q9BXA9 SNORA25.14-201ENST00000516481 132 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SALL3Q9BXA9 SNORA27.4-201ENST00000516650 95 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SALL3Q9BXA9 RNU7-110P-201ENST00000516891 62 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SALL3Q9BXA9 Y_RNA.777-201ENST00000516982 102 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SALL3Q9BXA9 AC006199.1-201ENST00000548728 219 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SALL3Q9BXA9 LINC02309-201ENST00000553679 207 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
SALL3Q9BXA9 AL139193.1-201ENST00000554967 539 ntTSL 4 BASIC2.91□□□□□ -1.94
SALL3Q9BXA9 AC233702.2-202ENST00000562547 291 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SALL3Q9BXA9 MIR548AI-201ENST00000579940 88 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SALL3Q9BXA9 Y_RNA.771-201ENST00000598668 102 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SALL3Q9BXA9 AC046143.2-201ENST00000609789 160 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SALL3Q9BXA9 AL365265.1-201ENST00000621045 234 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SALL3Q9BXA9 Y_RNA.789-201ENST00000622480 102 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SALL3Q9BXA9 CACNB4-228ENST00000636598 7808 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
SALL3Q9BXA9 ZBBX-201ENST00000307529 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.94
SALL3Q9BXA9 ZBBX-204ENST00000392767 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.94
SALL3Q9BXA9 PIK3CA-201ENST00000263967 9093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.94
SALL3Q9BXA9 AC002543.1-201ENST00000299783 1954 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SALL3Q9BXA9 GAGE12B-201ENST00000361446 117 ntAPPRIS P1 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SALL3Q9BXA9 MIR410-201ENST00000362222 80 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SALL3Q9BXA9 Y_RNA.275-201ENST00000364726 110 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SALL3Q9BXA9 Y_RNA.292-201ENST00000364904 97 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SALL3Q9BXA9 Y_RNA.595-201ENST00000410403 105 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SALL3Q9BXA9 RNU6-1001P-201ENST00000411265 100 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SALL3Q9BXA9 Y_RNA.626-201ENST00000411288 95 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SALL3Q9BXA9 PLCL2-AS1-201ENST00000414844 311 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SALL3Q9BXA9 LINC01162-201ENST00000447262 447 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SALL3Q9BXA9 RPS29P20-201ENST00000489592 171 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SALL3Q9BXA9 AC034223.1-201ENST00000511054 599 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SALL3Q9BXA9 LNX1-AS1-203ENST00000511989 488 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SALL3Q9BXA9 SNORA40.9-201ENST00000515895 93 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SALL3Q9BXA9 ACA59.2-201ENST00000517061 156 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SALL3Q9BXA9 AP002392.1-201ENST00000537692 208 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SALL3Q9BXA9 TRAV1-1-201ENST00000542354 392 ntAPPRIS P1 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SALL3Q9BXA9 UBL5P4-201ENST00000562584 236 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SALL3Q9BXA9 RNU6-91P-201ENST00000607774 107 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SALL3Q9BXA9 AL359198.2-201ENST00000611836 194 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SALL3Q9BXA9 MIR3199-2-201ENST00000636243 86 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SALL3Q9BXA9 BX322639.1-202ENST00000423987 2213 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SALL3Q9BXA9 AC138915.1-201ENST00000565427 1685 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SALL3Q9BXA9 N4BP2L2-211ENST00000504114 2513 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SALL3Q9BXA9 RNA5SP289-201ENST00000362332 137 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SALL3Q9BXA9 RNU6-961P-201ENST00000363893 105 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SALL3Q9BXA9 RNU6-1180P-201ENST00000364935 107 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SALL3Q9BXA9 RNU6-245P-201ENST00000384020 107 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SALL3Q9BXA9 AL365496.1-201ENST00000426885 215 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SALL3Q9BXA9 AC110995.1-201ENST00000444185 628 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SALL3Q9BXA9 TMSB4XP3-201ENST00000445144 114 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SALL3Q9BXA9 AC117394.2-201ENST00000487827 323 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SALL3Q9BXA9 AC012055.2-201ENST00000504167 335 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SALL3Q9BXA9 RNU6ATAC9P-201ENST00000516210 116 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SALL3Q9BXA9 Y_RNA.683-201ENST00000516508 93 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SALL3Q9BXA9 SNORD19.2-201ENST00000516978 73 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SALL3Q9BXA9 AP003128.1-201ENST00000531414 448 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SALL3Q9BXA9 LINC02253-201ENST00000559321 448 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SALL3Q9BXA9 MIR3136-201ENST00000583498 78 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SALL3Q9BXA9 AC008749.1-201ENST00000597650 306 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SALL3Q9BXA9 AC011921.3-201ENST00000605540 361 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SALL3Q9BXA9 AC010999.1-201ENST00000611856 324 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SALL3Q9BXA9 AC005520.5-201ENST00000613926 164 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SALL3Q9BXA9 AL590240.4-201ENST00000616908 390 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SALL3Q9BXA9 AC023490.3-201ENST00000621762 358 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SALL3Q9BXA9 CTSLP2-204ENST00000629029 392 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SALL3Q9BXA9 AP000550.4-201ENST00000639507 358 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SALL3Q9BXA9 LINC01938-201ENST00000521341 1864 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SALL3Q9BXA9 OR8K3-203ENST00000641662 2438 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SALL3Q9BXA9 SEL1L2-201ENST00000284951 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SALL3Q9BXA9 SNORA25.1-201ENST00000362326 128 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SALL3Q9BXA9 SNORD56.5-201ENST00000364281 72 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SALL3Q9BXA9 RNU6-1175P-201ENST00000365200 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SALL3Q9BXA9 SNORA36A-201ENST00000384221 132 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SALL3Q9BXA9 SNORA46.1-201ENST00000391069 153 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
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