Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q15

SMG1, Serine/threonine-protein kinase SMG1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,661 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG1Q96Q15 AC090897.1-201ENST00000580909 226 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
SMG1Q96Q15 Y_RNA.778-201ENST00000620203 90 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
SMG1Q96Q15 MT-TM-201ENST00000387377 68 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
SMG1Q96Q15 USP9YP13-201ENST00000417797 480 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
SMG1Q96Q15 AL358176.1-201ENST00000457477 357 ntTSL 5 BASIC-1.02□□□□□ -2.57
SMG1Q96Q15 KLRF1-203ENST00000537723 598 ntTSL 1 (best) BASIC-1.02□□□□□ -2.57
SMG1Q96Q15 LINC00871-202ENST00000556071 554 ntTSL 3 BASIC-1.02□□□□□ -2.57
SMG1Q96Q15 AC138749.4-201ENST00000563970 127 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
SMG1Q96Q15 AC006213.4-201ENST00000616184 634 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
SMG1Q96Q15 AL513423.1-201ENST00000621695 132 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
SMG1Q96Q15 BX322639.1-202ENST00000423987 2213 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
SMG1Q96Q15 Y_RNA.168-201ENST00000363740 102 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
SMG1Q96Q15 FCF1P10-201ENST00000407590 479 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
SMG1Q96Q15 TAF13P2-201ENST00000416876 286 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
SMG1Q96Q15 CALM2P4-201ENST00000430810 426 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
SMG1Q96Q15 AL031667.1-201ENST00000440222 725 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
SMG1Q96Q15 XACT-201ENST00000468762 497 ntTSL 5 BASIC-1.03□□□□□ -2.57
SMG1Q96Q15 RNU5B-3P-201ENST00000516601 115 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
SMG1Q96Q15 CR383656.7-201ENST00000548164 174 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
SMG1Q96Q15 AC138058.1-201ENST00000620572 449 ntTSL 3 BASIC-1.03□□□□□ -2.57
SMG1Q96Q15 SNORD115-27-201ENST00000364430 82 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
SMG1Q96Q15 SNORA67.2-201ENST00000384300 149 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
SMG1Q96Q15 MIR215-201ENST00000384858 110 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
SMG1Q96Q15 SNORD100-201ENST00000408573 76 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
SMG1Q96Q15 RNU6-333P-201ENST00000459117 107 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
SMG1Q96Q15 CCNG1-203ENST00000504553 732 ntTSL 3 BASIC-1.03□□□□□ -2.57
SMG1Q96Q15 AC107023.1-201ENST00000552757 356 ntTSL 5 BASIC-1.03□□□□□ -2.57
SMG1Q96Q15 RNU6-86P-201ENST00000606534 107 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
SMG1Q96Q15 RNU6-1133P-201ENST00000410963 100 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
SMG1Q96Q15 MTCO1P17-201ENST00000411522 491 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
SMG1Q96Q15 AL929288.2-201ENST00000446368 407 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
SMG1Q96Q15 RNU7-102P-201ENST00000458948 62 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
SMG1Q96Q15 AC107401.1-201ENST00000503426 685 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
SMG1Q96Q15 LINC02220-201ENST00000510065 270 ntTSL 5 BASIC-1.03□□□□□ -2.57
SMG1Q96Q15 AC020661.3-201ENST00000558101 414 ntTSL 3 BASIC-1.03□□□□□ -2.57
SMG1Q96Q15 MIR1248-201ENST00000629190 106 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
SMG1Q96Q15 MGST1-207ENST00000535309 1331 ntTSL 1 (best) BASIC-1.03□□□□□ -2.58
SMG1Q96Q15 RNU6-1094P-201ENST00000362416 104 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
SMG1Q96Q15 SNORD18.1-201ENST00000363807 70 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
SMG1Q96Q15 RNU6-1127P-201ENST00000384580 107 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
SMG1Q96Q15 TRAJ41-201ENST00000390496 62 ntAPPRIS P1 BASIC-1.04□□□□□ -2.58
SMG1Q96Q15 OR6C5P-201ENST00000452388 923 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
SMG1Q96Q15 ART2BP-201ENST00000453501 499 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
SMG1Q96Q15 MIR2115-201ENST00000516657 100 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
SMG1Q96Q15 AL157687.1-201ENST00000554853 619 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
SMG1Q96Q15 CAPZA2-214ENST00000628758 525 ntTSL 5 BASIC-1.04□□□□□ -2.58
SMG1Q96Q15 AC091304.10-201ENST00000641554 121 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
SMG1Q96Q15 Y_RNA.529-201ENST00000384586 119 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
SMG1Q96Q15 SNORD56B-201ENST00000384713 71 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
SMG1Q96Q15 MIR518F-201ENST00000384973 87 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
SMG1Q96Q15 MIR518B-201ENST00000385127 83 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
SMG1Q96Q15 RNU6-1176P-201ENST00000390955 107 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
SMG1Q96Q15 AC013828.1-201ENST00000481845 158 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
SMG1Q96Q15 AC091917.1-201ENST00000506330 566 ntTSL 4 BASIC-1.04□□□□□ -2.58
SMG1Q96Q15 AC106744.2-201ENST00000513955 898 ntTSL 5 BASIC-1.04□□□□□ -2.58
SMG1Q96Q15 AC022483.1-201ENST00000514020 567 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
SMG1Q96Q15 Y_RNA.336-201ENST00000365307 109 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
SMG1Q96Q15 DEFB110-202ENST00000393660 189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC-1.04□□□□□ -2.58
SMG1Q96Q15 AL445193.1-201ENST00000441183 141 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
SMG1Q96Q15 RNA5SP272-201ENST00000516095 111 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
SMG1Q96Q15 AL589986.2-201ENST00000429352 397 ntTSL 2 BASIC-1.05□□□□□ -2.58
SMG1Q96Q15 AC007000.2-201ENST00000442564 487 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
SMG1Q96Q15 SNORD18.2-201ENST00000459604 70 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
SMG1Q96Q15 PCMTD1P2-201ENST00000565017 355 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
SMG1Q96Q15 RNU6-934P-201ENST00000365154 107 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
SMG1Q96Q15 RNU6-431P-201ENST00000383874 107 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
SMG1Q96Q15 SNORA22B-201ENST00000383876 138 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
SMG1Q96Q15 RNU6-741P-201ENST00000383889 107 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
SMG1Q96Q15 RNU6-455P-201ENST00000384681 107 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
SMG1Q96Q15 RPS24P1-201ENST00000438550 371 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
SMG1Q96Q15 RNU6ATAC32P-201ENST00000516026 76 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
SMG1Q96Q15 ACA59.2-201ENST00000517061 156 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
SMG1Q96Q15 AC010525.2-201ENST00000590920 195 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
SMG1Q96Q15 AP001429.1-201ENST00000602568 530 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
SMG1Q96Q15 AL451064.1-201ENST00000607718 471 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
SMG1Q96Q15 AL109620.1-201ENST00000618738 1197 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
SMG1Q96Q15 RNU6-529P-201ENST00000363383 104 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
SMG1Q96Q15 MIR889-201ENST00000401280 79 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
SMG1Q96Q15 RNU6-1001P-201ENST00000411265 100 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
SMG1Q96Q15 AL356583.2-201ENST00000426536 280 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
SMG1Q96Q15 TMEM212-IT1-201ENST00000456146 470 ntTSL 3 BASIC-1.05□□□□□ -2.58
SMG1Q96Q15 AC107463.1-202ENST00000514526 689 ntTSL 2 BASIC-1.05□□□□□ -2.58
SMG1Q96Q15 AC145141.2-201ENST00000518473 501 ntTSL 3 BASIC-1.05□□□□□ -2.58
SMG1Q96Q15 AL118556.1-201ENST00000555257 502 ntTSL 2 BASIC-1.05□□□□□ -2.58
SMG1Q96Q15 RNU6-31P-201ENST00000384388 108 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
SMG1Q96Q15 Y_RNA.582-201ENST00000391023 95 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
SMG1Q96Q15 RNA5SP484-201ENST00000458857 111 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
SMG1Q96Q15 AL139021.2-201ENST00000556390 399 ntTSL 3 BASIC-1.06□□□□□ -2.58
SMG1Q96Q15 MIR4771-2-201ENST00000577758 74 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
SMG1Q96Q15 MIR4771-1-201ENST00000582617 74 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
SMG1Q96Q15 MIR3136-201ENST00000583498 78 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
SMG1Q96Q15 BNIP3P30-201ENST00000601184 574 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
SMG1Q96Q15 AC010205.1-201ENST00000616668 449 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
SMG1Q96Q15 RNU6-819P-201ENST00000364116 107 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
SMG1Q96Q15 Y_RNA.577-201ENST00000384794 101 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
SMG1Q96Q15 RNA5SP467-201ENST00000391274 118 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
SMG1Q96Q15 AL512326.2-201ENST00000426359 151 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
SMG1Q96Q15 AL592447.1-201ENST00000447592 540 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
SMG1Q96Q15 AC244093.3-201ENST00000615419 411 ntTSL 3 BASIC-1.06□□□□□ -2.58
SMG1Q96Q15 Y_RNA.151-201ENST00000363566 112 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
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