Protein–RNA interactions for Protein: Q96GF1

RNF185, E3 ubiquitin-protein ligase RNF185, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF185Q96GF1 AC091179.3-201ENST00000474761 144 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
RNF185Q96GF1 RPS29P11-201ENST00000496507 171 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
RNF185Q96GF1 HMGN1P13-201ENST00000505795 138 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
RNF185Q96GF1 AC093303.1-201ENST00000514549 295 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
RNF185Q96GF1 RNU6-1114P-201ENST00000516022 107 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
RNF185Q96GF1 RNU6-1041P-201ENST00000516254 102 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
RNF185Q96GF1 RNU6-307P-201ENST00000516743 106 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
RNF185Q96GF1 AK6P2-201ENST00000549020 471 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
RNF185Q96GF1 RBM11P1-201ENST00000604951 799 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
RNF185Q96GF1 FGF7-202ENST00000560270 1688 ntTSL 1 (best) BASIC1.26□□□□□ -2.21
RNF185Q96GF1 SAGE1-202ENST00000370709 2879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
RNF185Q96GF1 MIR126-201ENST00000362291 85 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
RNF185Q96GF1 RNU6-862P-201ENST00000362804 105 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
RNF185Q96GF1 RNU6-112P-201ENST00000363599 104 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
RNF185Q96GF1 U3.8-201ENST00000363675 217 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
RNF185Q96GF1 Y_RNA.179-201ENST00000363844 90 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
RNF185Q96GF1 RNU4-42P-201ENST00000364738 142 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
RNF185Q96GF1 Y_RNA.364-201ENST00000365532 101 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
RNF185Q96GF1 MIR583-201ENST00000384846 75 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
RNF185Q96GF1 MIR548B-201ENST00000385247 97 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
RNF185Q96GF1 TRAJ39-201ENST00000390498 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.25□□□□□ -2.21
RNF185Q96GF1 RNU6-700P-201ENST00000391043 107 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
RNF185Q96GF1 EBAG9P1-201ENST00000418955 543 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
RNF185Q96GF1 MTCYBP10-201ENST00000424905 650 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
RNF185Q96GF1 USP9YP16-201ENST00000430287 407 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
RNF185Q96GF1 AC010095.1-201ENST00000443543 144 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
RNF185Q96GF1 USP9YP23-201ENST00000455085 407 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
RNF185Q96GF1 AC022445.1-201ENST00000457499 408 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
RNF185Q96GF1 AC010409.1-201ENST00000487382 476 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
RNF185Q96GF1 AC025465.3-201ENST00000510570 311 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
RNF185Q96GF1 AC096711.2-201ENST00000510592 454 ntTSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
RNF185Q96GF1 SCARNA16.2-201ENST00000516520 172 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
RNF185Q96GF1 RNU6ATAC12P-201ENST00000516542 115 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
RNF185Q96GF1 SNORA31.17-201ENST00000516953 127 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
RNF185Q96GF1 RNU1-117P-201ENST00000517041 158 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
RNF185Q96GF1 TRAV1-1-201ENST00000542354 392 ntAPPRIS P1 BASIC1.25□□□□□ -2.21
RNF185Q96GF1 AC092490.2-202ENST00000544922 462 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
RNF185Q96GF1 AC090510.1-201ENST00000567456 425 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
RNF185Q96GF1 AC090617.3-201ENST00000573670 475 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
RNF185Q96GF1 MIR5094-201ENST00000578766 85 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
RNF185Q96GF1 AC104984.5-201ENST00000586878 94 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
RNF185Q96GF1 UBE2V2P2-201ENST00000587677 504 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
RNF185Q96GF1 RNU6ATAC35P-201ENST00000609276 444 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
RNF185Q96GF1 SCOC-AS1-203ENST00000609616 405 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
RNF185Q96GF1 Hammerhead_HH9.1-201ENST00000616606 77 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
RNF185Q96GF1 Six3os1_7.1-201ENST00000621512 201 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
RNF185Q96GF1 AL359757.2-201ENST00000624309 274 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
RNF185Q96GF1 snoZ196.1-201ENST00000625269 89 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
RNF185Q96GF1 AL669831.3-213ENST00000636676 183 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
RNF185Q96GF1 LINC01790-201ENST00000447194 2852 ntTSL 2 BASIC1.25□□□□□ -2.21
RNF185Q96GF1 ST7-AS2-206ENST00000456577 1351 ntTSL 1 (best) BASIC1.24□□□□□ -2.21
RNF185Q96GF1 MTND5P16-201ENST00000460269 1703 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
RNF185Q96GF1 RNU6-874P-201ENST00000362390 105 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
RNF185Q96GF1 RNU6-222P-201ENST00000362438 107 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
RNF185Q96GF1 SNORA72.1-201ENST00000363485 129 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
RNF185Q96GF1 Y_RNA.142-201ENST00000363491 102 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
RNF185Q96GF1 RNU6-414P-201ENST00000363705 104 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
RNF185Q96GF1 RNU6-1188P-201ENST00000363795 107 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
RNF185Q96GF1 SNORD87-201ENST00000364849 89 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
RNF185Q96GF1 Y_RNA.303-201ENST00000364998 94 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
RNF185Q96GF1 AL354864.1-201ENST00000373226 539 ntTSL 2 BASIC1.24□□□□□ -2.21
RNF185Q96GF1 Y_RNA.415-201ENST00000384012 112 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
RNF185Q96GF1 SNAP23-203ENST00000397138 477 ntTSL 1 (best) BASIC1.24□□□□□ -2.21
RNF185Q96GF1 RNU6-370P-201ENST00000411008 104 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
RNF185Q96GF1 RNU6-57P-201ENST00000411348 103 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
RNF185Q96GF1 AL445685.2-201ENST00000422551 342 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
RNF185Q96GF1 EIF1P2-201ENST00000428233 350 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
RNF185Q96GF1 AL353997.1-201ENST00000432936 108 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
RNF185Q96GF1 AC003989.2-201ENST00000440224 169 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
RNF185Q96GF1 RNU6-221P-201ENST00000459541 99 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
RNF185Q96GF1 RPL17P19-201ENST00000489069 552 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
RNF185Q96GF1 TRAPPC2P7-201ENST00000509650 231 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
RNF185Q96GF1 RNU4ATAC7P-201ENST00000516280 125 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
RNF185Q96GF1 RNU6-1213P-201ENST00000517075 94 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
RNF185Q96GF1 AC025647.1-201ENST00000517879 253 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
RNF185Q96GF1 SNHG14-219ENST00000553134 470 ntTSL 2 BASIC1.24□□□□□ -2.21
RNF185Q96GF1 MIR5695-201ENST00000579717 85 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
RNF185Q96GF1 MIR4801-201ENST00000582704 82 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
RNF185Q96GF1 MIR5690-201ENST00000583739 73 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
RNF185Q96GF1 MZT1P2-201ENST00000604387 248 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
RNF185Q96GF1 AC113139.1-201ENST00000605049 239 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
RNF185Q96GF1 AC016925.2-201ENST00000605108 242 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
RNF185Q96GF1 AC010999.1-201ENST00000611856 324 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
RNF185Q96GF1 AC092794.2-201ENST00000620933 563 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
RNF185Q96GF1 AC068733.3-201ENST00000632757 269 ntTSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
RNF185Q96GF1 MIR338-201ENST00000636369 67 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
RNF185Q96GF1 XRCC4-202ENST00000338635 1579 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC1.24□□□□□ -2.21
RNF185Q96GF1 MIR424-201ENST00000362227 98 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
RNF185Q96GF1 RNU6-727P-201ENST00000363592 107 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
RNF185Q96GF1 RNU1-96P-201ENST00000364163 162 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
RNF185Q96GF1 RNU6-296P-201ENST00000384608 107 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
RNF185Q96GF1 MIR9-3-201ENST00000385084 90 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
RNF185Q96GF1 SNORA26.9-201ENST00000391322 122 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
RNF185Q96GF1 MIR1185-2-201ENST00000408687 86 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
RNF185Q96GF1 AC007098.1-201ENST00000420122 367 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
RNF185Q96GF1 CST2P1-201ENST00000425770 87 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
RNF185Q96GF1 FTH1P12-201ENST00000432137 551 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
RNF185Q96GF1 AC245047.4-201ENST00000433189 144 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
RNF185Q96GF1 MTND4P18-201ENST00000447010 465 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
RNF185Q96GF1 Z68323.1-201ENST00000450365 519 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119.8 ms