Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 NOX4-202ENST00000343727 3347 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
ZNF548Q8NEK5 CACNB4-228ENST00000636598 7808 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
ZNF548Q8NEK5 CEP70-211ENST00000484888 1993 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
ZNF548Q8NEK5 ZMYM1-203ENST00000373330 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
ZNF548Q8NEK5 RNA5SP289-201ENST00000362332 137 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.44-201ENST00000362676 108 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.555-201ENST00000384673 110 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
ZNF548Q8NEK5 RNU6-21P-201ENST00000384710 107 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.569-201ENST00000384749 103 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
ZNF548Q8NEK5 MIR186-201ENST00000384988 86 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
ZNF548Q8NEK5 MIR549A-201ENST00000385268 96 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
ZNF548Q8NEK5 NCKAP5-IT1-201ENST00000416437 554 ntTSL 4 BASIC2.48□□□□□ -2.01
ZNF548Q8NEK5 MAGEA8-AS1-201ENST00000427671 476 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
ZNF548Q8NEK5 AP001324.2-201ENST00000461163 319 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
ZNF548Q8NEK5 AL121594.1-201ENST00000475906 575 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
ZNF548Q8NEK5 RNU6-182P-201ENST00000516970 105 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
ZNF548Q8NEK5 AC008115.2-201ENST00000539988 241 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
ZNF548Q8NEK5 AC018448.1-201ENST00000552843 316 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
ZNF548Q8NEK5 AC005176.2-201ENST00000596933 147 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
ZNF548Q8NEK5 MIR7515-201ENST00000637837 67 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
ZNF548Q8NEK5 CCDC66-201ENST00000326595 3027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
ZNF548Q8NEK5 LUZP4-201ENST00000371920 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
ZNF548Q8NEK5 ZNF117-204ENST00000620222 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
ZNF548Q8NEK5 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
ZNF548Q8NEK5 ARHGAP15-202ENST00000409869 2968 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
ZNF548Q8NEK5 XRCC4-205ENST00000511817 1636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
ZNF548Q8NEK5 FAM184A-202ENST00000352896 3700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
ZNF548Q8NEK5 UBE2WP1-201ENST00000362030 340 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
ZNF548Q8NEK5 MIR410-201ENST00000362222 80 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.76-201ENST00000362931 109 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
ZNF548Q8NEK5 RNU6-1210P-201ENST00000363775 107 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.200-201ENST00000364018 102 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.297-201ENST00000364950 91 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
ZNF548Q8NEK5 RNU6-1083P-201ENST00000384022 107 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
ZNF548Q8NEK5 AL603908.1-201ENST00000406098 201 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
ZNF548Q8NEK5 SNORA3.2-201ENST00000408221 125 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
ZNF548Q8NEK5 RPL19P1-201ENST00000411635 428 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
ZNF548Q8NEK5 MTND5P15-201ENST00000434246 349 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
ZNF548Q8NEK5 RNU1-41P-201ENST00000516161 162 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
ZNF548Q8NEK5 RNU1-48P-201ENST00000516400 162 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
ZNF548Q8NEK5 EIF4A1P12-201ENST00000551910 141 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
ZNF548Q8NEK5 AC103810.1-201ENST00000579873 453 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
ZNF548Q8NEK5 AP005062.1-201ENST00000581502 607 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
ZNF548Q8NEK5 AC100778.1-201ENST00000583579 332 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
ZNF548Q8NEK5 AC008749.1-201ENST00000597650 306 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
ZNF548Q8NEK5 SNRPGP20-201ENST00000604477 205 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
ZNF548Q8NEK5 MIR6715A-201ENST00000615929 79 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
ZNF548Q8NEK5 FTX_2.1-201ENST00000618816 94 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
ZNF548Q8NEK5 KCNQ1OT1_5.1-201ENST00000621902 226 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
ZNF548Q8NEK5 SEL1L2-201ENST00000284951 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
ZNF548Q8NEK5 AC009975.1-201ENST00000634588 2698 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
ZNF548Q8NEK5 HELLS-201ENST00000239026 2740 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
ZNF548Q8NEK5 OR51A4-202ENST00000641898 4393 ntAPPRIS P1 BASIC2.46□□□□□ -2.02
ZNF548Q8NEK5 SMARCAD1-206ENST00000509418 2348 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
ZNF548Q8NEK5 SPAM1-206ENST00000460182 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
ZNF548Q8NEK5 MGAT4C-210ENST00000620241 3194 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
ZNF548Q8NEK5 OSTN-201ENST00000339051 402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.29-201ENST00000362570 113 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.275-201ENST00000364726 110 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.418-201ENST00000384029 102 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
ZNF548Q8NEK5 RNU1-57P-201ENST00000384491 166 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
ZNF548Q8NEK5 MIR627-201ENST00000384979 97 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
ZNF548Q8NEK5 MIR1298-201ENST00000408783 112 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
ZNF548Q8NEK5 RPL23AP36-201ENST00000413895 458 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
ZNF548Q8NEK5 RAB28P5-201ENST00000427490 651 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
ZNF548Q8NEK5 IFNA11P-201ENST00000446352 526 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
ZNF548Q8NEK5 UQCRBP2-201ENST00000447827 297 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
ZNF548Q8NEK5 RNU6-625P-201ENST00000459412 107 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
ZNF548Q8NEK5 COX6CP14-201ENST00000469580 174 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
ZNF548Q8NEK5 RNU6-966P-201ENST00000516479 104 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
ZNF548Q8NEK5 AL157911.1-202ENST00000554123 502 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
ZNF548Q8NEK5 ACTG1P17-203ENST00000561222 537 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
ZNF548Q8NEK5 AC026470.2-201ENST00000561492 181 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
ZNF548Q8NEK5 MIR5092-201ENST00000583139 88 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
ZNF548Q8NEK5 MIR4282-201ENST00000583613 67 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
ZNF548Q8NEK5 AP001178.1-201ENST00000584679 268 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
ZNF548Q8NEK5 AC011921.3-201ENST00000605540 361 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
ZNF548Q8NEK5 AC037487.3-201ENST00000606668 112 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
ZNF548Q8NEK5 AC004792.1-201ENST00000614523 137 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
ZNF548Q8NEK5 ST7-OT4_2.1-201ENST00000619089 172 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
ZNF548Q8NEK5 PARPBP-203ENST00000392911 1916 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
ZNF548Q8NEK5 PTPN22-203ENST00000460620 1794 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
ZNF548Q8NEK5 ANKRD30BP1-201ENST00000451052 2186 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
ZNF548Q8NEK5 AC011604.2-202ENST00000540229 2451 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
ZNF548Q8NEK5 TPTE2-204ENST00000400103 1652 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
ZNF548Q8NEK5 RNU6-655P-201ENST00000362858 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.122-201ENST00000363331 96 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
ZNF548Q8NEK5 RNU6-740P-201ENST00000364734 105 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.331-201ENST00000365267 102 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
ZNF548Q8NEK5 RNU6-1062P-201ENST00000383908 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
ZNF548Q8NEK5 MIR320B2-201ENST00000408479 138 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
ZNF548Q8NEK5 RNU6-1199P-201ENST00000411249 104 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
ZNF548Q8NEK5 AL358234.1-201ENST00000421132 273 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
ZNF548Q8NEK5 PIGPP3-201ENST00000425307 415 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
ZNF548Q8NEK5 LINC00459-201ENST00000431656 376 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
ZNF548Q8NEK5 MTCO1P5-201ENST00000433573 344 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
ZNF548Q8NEK5 LINC02336-201ENST00000434117 330 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
ZNF548Q8NEK5 AL121890.1-201ENST00000435457 205 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
ZNF548Q8NEK5 AC005042.3-201ENST00000453230 174 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
ZNF548Q8NEK5 RN7SKP40-201ENST00000517211 242 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.1 ms