Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 AP002428.1-201ENST00000527345 380 ntTSL 3 BASIC-0.13□□□□□ -2.43
RTL8BQ17RB0 AL121821.1-201ENST00000557067 530 ntTSL 3 BASIC-0.13□□□□□ -2.43
RTL8BQ17RB0 uc_338.34-201ENST00000617467 174 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
RTL8BQ17RB0 AC015726.2-201ENST00000620112 122 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
RTL8BQ17RB0 AC138649.3-201ENST00000622154 254 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
RTL8BQ17RB0 GAGE12B-201ENST00000361446 117 ntAPPRIS P1 BASIC-0.14□□□□□ -2.43
RTL8BQ17RB0 MIR18A-201ENST00000362310 71 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
RTL8BQ17RB0 SNORA42.1-201ENST00000363515 137 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.258-201ENST00000364613 105 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
RTL8BQ17RB0 AL354864.1-201ENST00000373226 539 ntTSL 2 BASIC-0.14□□□□□ -2.43
RTL8BQ17RB0 RNU6-533P-201ENST00000384144 107 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.480-201ENST00000384364 102 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
RTL8BQ17RB0 RNU6-1297P-201ENST00000384415 104 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
RTL8BQ17RB0 RNU6-1257P-201ENST00000384625 110 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.540-201ENST00000384638 111 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
RTL8BQ17RB0 MIR518A1-201ENST00000385068 85 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
RTL8BQ17RB0 MRPL42P2-201ENST00000403169 426 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
RTL8BQ17RB0 AL583859.1-201ENST00000455871 335 ntTSL 3 BASIC-0.14□□□□□ -2.43
RTL8BQ17RB0 AC093534.1-201ENST00000504977 132 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
RTL8BQ17RB0 AC010493.1-201ENST00000513479 292 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
RTL8BQ17RB0 MTATP6P9-201ENST00000515039 680 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
RTL8BQ17RB0 LINC01218-201ENST00000515150 481 ntTSL 3 BASIC-0.14□□□□□ -2.43
RTL8BQ17RB0 SCARNA16.5-201ENST00000517114 183 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
RTL8BQ17RB0 AC069113.3-201ENST00000521019 150 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
RTL8BQ17RB0 UGP2-231ENST00000627474 264 ntTSL 5 BASIC-0.14□□□□□ -2.43
RTL8BQ17RB0 RNA5SP457-201ENST00000363657 124 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
RTL8BQ17RB0 SNORD114-9-201ENST00000364370 72 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
RTL8BQ17RB0 AC105271.1-202ENST00000411417 445 ntTSL 3 BASIC-0.15□□□□□ -2.43
RTL8BQ17RB0 AC073261.1-201ENST00000429409 121 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
RTL8BQ17RB0 AL121957.1-201ENST00000441532 338 ntTSL 2 BASIC-0.15□□□□□ -2.43
RTL8BQ17RB0 HMGN1P10-201ENST00000474557 553 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
RTL8BQ17RB0 RNU4-77P-201ENST00000516692 156 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
RTL8BQ17RB0 SNORA25.17-201ENST00000517184 124 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
RTL8BQ17RB0 RNA5SP454-201ENST00000517231 127 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
RTL8BQ17RB0 AC087276.4-201ENST00000530042 444 ntTSL 3 BASIC-0.15□□□□□ -2.43
RTL8BQ17RB0 AC025449.1-201ENST00000603896 529 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
RTL8BQ17RB0 AL359999.1-201ENST00000604513 294 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
RTL8BQ17RB0 AC022418.1-201ENST00000624118 445 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
RTL8BQ17RB0 SERPINI2-207ENST00000476257 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0.15□□□□□ -2.43
RTL8BQ17RB0 MIR1-1-201ENST00000362147 71 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.336-201ENST00000365307 109 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
RTL8BQ17RB0 RNU6-815P-201ENST00000384080 113 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
RTL8BQ17RB0 AL512271.1-201ENST00000439878 434 ntTSL 3 BASIC-0.16□□□□□ -2.44
RTL8BQ17RB0 ZNF736P4Y-201ENST00000454995 1243 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
RTL8BQ17RB0 RN7SKP164-201ENST00000516138 266 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
RTL8BQ17RB0 RNU7-28P-201ENST00000516759 62 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
RTL8BQ17RB0 AC022616.3-201ENST00000523940 148 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
RTL8BQ17RB0 LINC02442-201ENST00000537732 343 ntTSL 3 BASIC-0.16□□□□□ -2.44
RTL8BQ17RB0 AC068790.2-201ENST00000602601 557 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
RTL8BQ17RB0 MIR6779-201ENST00000617283 64 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
RTL8BQ17RB0 AL109933.3-201ENST00000619095 188 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
RTL8BQ17RB0 AC078938.1-201ENST00000620993 318 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
RTL8BQ17RB0 RNU6-1287P-201ENST00000362914 107 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
RTL8BQ17RB0 RNA5SP214-201ENST00000363378 118 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
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RTL8BQ17RB0 SNORD113.3-201ENST00000364630 78 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
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RTL8BQ17RB0 RNU6-1060P-201ENST00000384664 107 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
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RTL8BQ17RB0 SNORD71-201ENST00000411292 86 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
RTL8BQ17RB0 MTND1P20-201ENST00000430341 950 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
RTL8BQ17RB0 AL135908.1-201ENST00000431394 446 ntTSL 3 BASIC-0.17□□□□□ -2.44
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RTL8BQ17RB0 AC004054.1-201ENST00000515111 270 ntTSL 3 BASIC-0.17□□□□□ -2.44
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RTL8BQ17RB0 SNORA25.12-201ENST00000516202 82 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
RTL8BQ17RB0 SCARNA24.1-201ENST00000516465 137 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
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RTL8BQ17RB0 MTND5P17-201ENST00000418405 1603 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
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RTL8BQ17RB0 RNU6V-201ENST00000384105 107 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
RTL8BQ17RB0 SNORA40.8-201ENST00000411034 126 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
RTL8BQ17RB0 LINC01674-201ENST00000427446 504 ntTSL 3 BASIC-0.18□□□□□ -2.44
RTL8BQ17RB0 AL513185.1-201ENST00000431638 162 ntTSL 5 BASIC-0.18□□□□□ -2.44
RTL8BQ17RB0 AL355997.1-202ENST00000454361 610 ntTSL 3 BASIC-0.18□□□□□ -2.44
RTL8BQ17RB0 AC007215.1-201ENST00000464893 276 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
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RTL8BQ17RB0 OCIAD1-AS1-201ENST00000513576 265 ntTSL 3 BASIC-0.18□□□□□ -2.44
RTL8BQ17RB0 RNU2-56P-201ENST00000516826 190 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
RTL8BQ17RB0 RNU6-1220P-201ENST00000517126 108 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
RTL8BQ17RB0 NDUFAF4P1-201ENST00000559425 519 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
RTL8BQ17RB0 AC002044.1-201ENST00000606707 158 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
RTL8BQ17RB0 AC007684.1-201ENST00000609671 477 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
RTL8BQ17RB0 AC104010.1-201ENST00000616889 150 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
RTL8BQ17RB0 AC011155.2-201ENST00000623202 216 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
RTL8BQ17RB0 OR5AK4P-201ENST00000635912 903 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
RTL8BQ17RB0 AC005592.1-201ENST00000566527 1640 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
RTL8BQ17RB0 MIR7-2-201ENST00000384970 110 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.608-201ENST00000410647 95 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
RTL8BQ17RB0 RNA5SP494-201ENST00000410653 129 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
RTL8BQ17RB0 ELOCP24-201ENST00000456370 334 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
RTL8BQ17RB0 AC079140.5-201ENST00000507882 310 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
RTL8BQ17RB0 RNU6-344P-201ENST00000516635 111 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
RTL8BQ17RB0 RNU1-117P-201ENST00000517041 158 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
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