Protein–RNA interactions for Protein: Q16825

PTPN21, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 21, humanhuman

Predictions only

Length 1,174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN21Q16825 AC107886.1-201ENST00000526935 516 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
PTPN21Q16825 AP003715.1-201ENST00000532109 435 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
PTPN21Q16825 CENPF-206ENST00000614578 528 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
PTPN21Q16825 AC011476.5-201ENST00000615594 130 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PTPN21Q16825 ANKRD30BP1-201ENST00000451052 2186 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PTPN21Q16825 MIR410-201ENST00000362222 80 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PTPN21Q16825 Y_RNA.99-201ENST00000363138 105 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PTPN21Q16825 Y_RNA.276-201ENST00000364732 109 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PTPN21Q16825 RNU6-482P-201ENST00000391068 107 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PTPN21Q16825 RNU4ATAC16P-201ENST00000408512 126 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PTPN21Q16825 RNA5SP425-201ENST00000410336 112 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PTPN21Q16825 MAGEA8-AS1-201ENST00000427671 476 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
PTPN21Q16825 RNU6-408P-201ENST00000515910 100 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PTPN21Q16825 AC131281.1-201ENST00000522984 164 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PTPN21Q16825 AC009107.1-201ENST00000561923 330 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
PTPN21Q16825 AC026271.5-201ENST00000577873 130 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PTPN21Q16825 MIR3670-2-201ENST00000582974 65 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PTPN21Q16825 MIR3670-1-201ENST00000584160 65 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PTPN21Q16825 MIR3670-3-201ENST00000584855 65 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PTPN21Q16825 LINC01533-205ENST00000593056 607 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
PTPN21Q16825 AC136443.5-201ENST00000603741 370 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PTPN21Q16825 ST7-AS1_1.1-201ENST00000611142 116 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PTPN21Q16825 MIR3670-4-201ENST00000612260 65 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PTPN21Q16825 AC068631.1-220ENST00000630726 256 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
PTPN21Q16825 ZBTB6-201ENST00000373659 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
PTPN21Q16825 PIK3C2G-203ENST00000535651 2497 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
PTPN21Q16825 RNU6-1264P-201ENST00000383891 107 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PTPN21Q16825 RNU6-975P-201ENST00000384296 105 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PTPN21Q16825 MIR764-201ENST00000390811 85 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PTPN21Q16825 RNA5SP181-201ENST00000410246 98 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PTPN21Q16825 AL157709.1-201ENST00000412695 424 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
PTPN21Q16825 AL135786.1-201ENST00000415892 214 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PTPN21Q16825 AL591806.2-201ENST00000433122 173 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PTPN21Q16825 AC245102.2-201ENST00000448956 180 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PTPN21Q16825 RNU2-34P-201ENST00000516534 121 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PTPN21Q16825 RNU6-826P-201ENST00000516827 104 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PTPN21Q16825 AK6P2-201ENST00000549020 471 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PTPN21Q16825 MIR4648-201ENST00000580107 72 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PTPN21Q16825 AC025754.2-201ENST00000606491 432 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PTPN21Q16825 Z82195.2-201ENST00000612348 18351 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PTPN21Q16825 FGF14-201ENST00000376131 12882 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
PTPN21Q16825 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
PTPN21Q16825 SLC4A7-201ENST00000295736 7757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
PTPN21Q16825 Y_RNA.183-201ENST00000363882 113 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PTPN21Q16825 RNU6-961P-201ENST00000363893 105 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PTPN21Q16825 RNU6-1310P-201ENST00000384153 107 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PTPN21Q16825 SNAP23-203ENST00000397138 477 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
PTPN21Q16825 AL079342.1-201ENST00000401460 267 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PTPN21Q16825 RNU4-53P-201ENST00000410828 140 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PTPN21Q16825 RNU6-130P-201ENST00000411112 103 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PTPN21Q16825 DPH3P2-201ENST00000422618 250 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PTPN21Q16825 RAB28P5-201ENST00000427490 651 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PTPN21Q16825 TOMM22P2-201ENST00000430735 237 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PTPN21Q16825 AC004052.1-202ENST00000505680 516 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
PTPN21Q16825 Y_RNA.673-201ENST00000516306 88 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PTPN21Q16825 RNU6-948P-201ENST00000516374 107 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PTPN21Q16825 AC087441.2-201ENST00000529141 262 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PTPN21Q16825 AP003128.1-201ENST00000531414 448 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
PTPN21Q16825 NKAIN2-205ENST00000546092 148 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
PTPN21Q16825 AC007598.1-202ENST00000561528 435 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
PTPN21Q16825 MIR3126-201ENST00000577443 74 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PTPN21Q16825 AC245748.3-201ENST00000588710 241 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
PTPN21Q16825 RAC1P9-201ENST00000604990 392 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PTPN21Q16825 SACS-201ENST00000382292 15324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
PTPN21Q16825 RNA5SP289-201ENST00000362332 137 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PTPN21Q16825 RNU1-91P-201ENST00000364746 163 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PTPN21Q16825 Y_RNA.459-201ENST00000384251 102 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PTPN21Q16825 Y_RNA.462-201ENST00000384268 102 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PTPN21Q16825 MIR548B-201ENST00000385247 97 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PTPN21Q16825 AL357134.1-201ENST00000445848 426 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PTPN21Q16825 RNU7-57P-201ENST00000459540 60 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PTPN21Q16825 AC010655.3-201ENST00000478818 450 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PTPN21Q16825 RNU6-107P-201ENST00000516643 102 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PTPN21Q16825 AC005034.5-201ENST00000604219 466 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PTPN21Q16825 AC010297.1-201ENST00000623948 149 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PTPN21Q16825 ANKRD20A9P-201ENST00000457997 2978 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PTPN21Q16825 CHORDC1-205ENST00000529726 4805 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
PTPN21Q16825 RNU6-626P-201ENST00000363354 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPN21Q16825 Y_RNA.210-201ENST00000364161 110 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPN21Q16825 Y_RNA.230-201ENST00000364348 109 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPN21Q16825 MIR1262-201ENST00000408276 93 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPN21Q16825 MIR1289-2-201ENST00000408360 111 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPN21Q16825 MTCO1P44-201ENST00000441935 243 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPN21Q16825 LINC01203-202ENST00000456091 476 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPN21Q16825 MRPS35P2-201ENST00000508242 191 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPN21Q16825 VCAN-AS1-202ENST00000513899 453 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPN21Q16825 RNA5SP137-201ENST00000516833 135 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPN21Q16825 RNU6-897P-201ENST00000517135 105 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPN21Q16825 AC021785.1-201ENST00000520780 453 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPN21Q16825 Six3os1_7.1-201ENST00000621512 201 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPN21Q16825 WARS-244ENST00000627608 123 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPN21Q16825 MIR3674-201ENST00000636576 68 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPN21Q16825 TAB2-201ENST00000367456 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPN21Q16825 RTL4-201ENST00000340433 2613 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPN21Q16825 CYSLTR1-201ENST00000373304 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
PTPN21Q16825 CAPS2-203ENST00000393284 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
PTPN21Q16825 MIR21-201ENST00000362134 72 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PTPN21Q16825 RNU6-20P-201ENST00000384106 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PTPN21Q16825 SNORD14D-201ENST00000384390 87 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PTPN21Q16825 RNU6-1235P-201ENST00000384559 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
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