| PTPN21 | Q16825 | AC107886.1-201 | ENST00000526935 | 516 nt | TSL 3 BASIC | 2.81 | □□□□□ -1.96 | | |
| PTPN21 | Q16825 | AP003715.1-201 | ENST00000532109 | 435 nt | TSL 3 BASIC | 2.81 | □□□□□ -1.96 | | |
| PTPN21 | Q16825 | CENPF-206 | ENST00000614578 | 528 nt | TSL 5 BASIC | 2.81 | □□□□□ -1.96 | | |
| PTPN21 | Q16825 | AC011476.5-201 | ENST00000615594 | 130 nt | BASIC | 2.81 | □□□□□ -1.96 | | |
| PTPN21 | Q16825 | ANKRD30BP1-201 | ENST00000451052 | 2186 nt | BASIC | 2.81 | □□□□□ -1.96 | | |
| PTPN21 | Q16825 | MIR410-201 | ENST00000362222 | 80 nt | BASIC | 2.8 | □□□□□ -1.96 | | |
| PTPN21 | Q16825 | Y_RNA.99-201 | ENST00000363138 | 105 nt | BASIC | 2.8 | □□□□□ -1.96 | | |
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| PTPN21 | Q16825 | RNU6-482P-201 | ENST00000391068 | 107 nt | BASIC | 2.8 | □□□□□ -1.96 | | |
| PTPN21 | Q16825 | RNU4ATAC16P-201 | ENST00000408512 | 126 nt | BASIC | 2.8 | □□□□□ -1.96 | | |
| PTPN21 | Q16825 | RNA5SP425-201 | ENST00000410336 | 112 nt | BASIC | 2.8 | □□□□□ -1.96 | | |
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| PTPN21 | Q16825 | RNU6-408P-201 | ENST00000515910 | 100 nt | BASIC | 2.8 | □□□□□ -1.96 | | |
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| PTPN21 | Q16825 | PIK3C2G-203 | ENST00000535651 | 2497 nt | TSL 5 BASIC | 2.8 | □□□□□ -1.96 | | |
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| PTPN21 | Q16825 | AC245102.2-201 | ENST00000448956 | 180 nt | BASIC | 2.79 | □□□□□ -1.96 | | |
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| PTPN21 | Q16825 | AC025754.2-201 | ENST00000606491 | 432 nt | BASIC | 2.79 | □□□□□ -1.96 | | |
| PTPN21 | Q16825 | Z82195.2-201 | ENST00000612348 | 18351 nt | BASIC | 2.79 | □□□□□ -1.96 | | |
| PTPN21 | Q16825 | FGF14-201 | ENST00000376131 | 12882 nt | TSL 1 (best) BASIC | 2.79 | □□□□□ -1.96 | | |
| PTPN21 | Q16825 | AKAP9-203 | ENST00000359028 | 12247 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 2.79 | □□□□□ -1.96 | | |
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| PTPN21 | Q16825 | Y_RNA.183-201 | ENST00000363882 | 113 nt | BASIC | 2.78 | □□□□□ -1.96 | | |
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| PTPN21 | Q16825 | RNU6-1310P-201 | ENST00000384153 | 107 nt | BASIC | 2.78 | □□□□□ -1.96 | | |
| PTPN21 | Q16825 | SNAP23-203 | ENST00000397138 | 477 nt | TSL 1 (best) BASIC | 2.78 | □□□□□ -1.96 | | |
| PTPN21 | Q16825 | AL079342.1-201 | ENST00000401460 | 267 nt | BASIC | 2.78 | □□□□□ -1.96 | | |
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| PTPN21 | Q16825 | RNU6-948P-201 | ENST00000516374 | 107 nt | BASIC | 2.78 | □□□□□ -1.96 | | |
| PTPN21 | Q16825 | AC087441.2-201 | ENST00000529141 | 262 nt | BASIC | 2.78 | □□□□□ -1.96 | | |
| PTPN21 | Q16825 | AP003128.1-201 | ENST00000531414 | 448 nt | TSL 2 BASIC | 2.78 | □□□□□ -1.96 | | |
| PTPN21 | Q16825 | NKAIN2-205 | ENST00000546092 | 148 nt | TSL 5 BASIC | 2.78 | □□□□□ -1.96 | | |
| PTPN21 | Q16825 | AC007598.1-202 | ENST00000561528 | 435 nt | TSL 3 BASIC | 2.78 | □□□□□ -1.96 | | |
| PTPN21 | Q16825 | MIR3126-201 | ENST00000577443 | 74 nt | BASIC | 2.78 | □□□□□ -1.96 | | |
| PTPN21 | Q16825 | AC245748.3-201 | ENST00000588710 | 241 nt | TSL 3 BASIC | 2.78 | □□□□□ -1.96 | | |
| PTPN21 | Q16825 | RAC1P9-201 | ENST00000604990 | 392 nt | BASIC | 2.78 | □□□□□ -1.96 | | |
| PTPN21 | Q16825 | SACS-201 | ENST00000382292 | 15324 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 2.77 | □□□□□ -1.97 | | |
| PTPN21 | Q16825 | RNA5SP289-201 | ENST00000362332 | 137 nt | BASIC | 2.77 | □□□□□ -1.97 | | |
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| PTPN21 | Q16825 | Y_RNA.459-201 | ENST00000384251 | 102 nt | BASIC | 2.77 | □□□□□ -1.97 | | |
| PTPN21 | Q16825 | Y_RNA.462-201 | ENST00000384268 | 102 nt | BASIC | 2.77 | □□□□□ -1.97 | | |
| PTPN21 | Q16825 | MIR548B-201 | ENST00000385247 | 97 nt | BASIC | 2.77 | □□□□□ -1.97 | | |
| PTPN21 | Q16825 | AL357134.1-201 | ENST00000445848 | 426 nt | BASIC | 2.77 | □□□□□ -1.97 | | |
| PTPN21 | Q16825 | RNU7-57P-201 | ENST00000459540 | 60 nt | BASIC | 2.77 | □□□□□ -1.97 | | |
| PTPN21 | Q16825 | AC010655.3-201 | ENST00000478818 | 450 nt | BASIC | 2.77 | □□□□□ -1.97 | | |
| PTPN21 | Q16825 | RNU6-107P-201 | ENST00000516643 | 102 nt | BASIC | 2.77 | □□□□□ -1.97 | | |
| PTPN21 | Q16825 | AC005034.5-201 | ENST00000604219 | 466 nt | BASIC | 2.77 | □□□□□ -1.97 | | |
| PTPN21 | Q16825 | AC010297.1-201 | ENST00000623948 | 149 nt | BASIC | 2.77 | □□□□□ -1.97 | | |
| PTPN21 | Q16825 | ANKRD20A9P-201 | ENST00000457997 | 2978 nt | BASIC | 2.77 | □□□□□ -1.97 | | |
| PTPN21 | Q16825 | CHORDC1-205 | ENST00000529726 | 4805 nt | TSL 2 BASIC | 2.77 | □□□□□ -1.97 | | |
| PTPN21 | Q16825 | RNU6-626P-201 | ENST00000363354 | 107 nt | BASIC | 2.76 | □□□□□ -1.97 | | |
| PTPN21 | Q16825 | Y_RNA.210-201 | ENST00000364161 | 110 nt | BASIC | 2.76 | □□□□□ -1.97 | | |
| PTPN21 | Q16825 | Y_RNA.230-201 | ENST00000364348 | 109 nt | BASIC | 2.76 | □□□□□ -1.97 | | |
| PTPN21 | Q16825 | MIR1262-201 | ENST00000408276 | 93 nt | BASIC | 2.76 | □□□□□ -1.97 | | |
| PTPN21 | Q16825 | MIR1289-2-201 | ENST00000408360 | 111 nt | BASIC | 2.76 | □□□□□ -1.97 | | |
| PTPN21 | Q16825 | MTCO1P44-201 | ENST00000441935 | 243 nt | BASIC | 2.76 | □□□□□ -1.97 | | |
| PTPN21 | Q16825 | LINC01203-202 | ENST00000456091 | 476 nt | TSL 3 BASIC | 2.76 | □□□□□ -1.97 | | |
| PTPN21 | Q16825 | MRPS35P2-201 | ENST00000508242 | 191 nt | BASIC | 2.76 | □□□□□ -1.97 | | |
| PTPN21 | Q16825 | VCAN-AS1-202 | ENST00000513899 | 453 nt | TSL 3 BASIC | 2.76 | □□□□□ -1.97 | | |
| PTPN21 | Q16825 | RNA5SP137-201 | ENST00000516833 | 135 nt | BASIC | 2.76 | □□□□□ -1.97 | | |
| PTPN21 | Q16825 | RNU6-897P-201 | ENST00000517135 | 105 nt | BASIC | 2.76 | □□□□□ -1.97 | | |
| PTPN21 | Q16825 | AC021785.1-201 | ENST00000520780 | 453 nt | TSL 3 BASIC | 2.76 | □□□□□ -1.97 | | |
| PTPN21 | Q16825 | Six3os1_7.1-201 | ENST00000621512 | 201 nt | BASIC | 2.76 | □□□□□ -1.97 | | |
| PTPN21 | Q16825 | WARS-244 | ENST00000627608 | 123 nt | TSL 5 BASIC | 2.76 | □□□□□ -1.97 | | |
| PTPN21 | Q16825 | MIR3674-201 | ENST00000636576 | 68 nt | BASIC | 2.76 | □□□□□ -1.97 | | |
| PTPN21 | Q16825 | TAB2-201 | ENST00000367456 | 4553 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 2.76 | □□□□□ -1.97 | | |
| PTPN21 | Q16825 | RTL4-201 | ENST00000340433 | 2613 nt | APPRIS P1 BASIC | 2.76 | □□□□□ -1.97 | | |
| PTPN21 | Q16825 | CYSLTR1-201 | ENST00000373304 | 2576 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.75 | □□□□□ -1.97 | | |
| PTPN21 | Q16825 | CAPS2-203 | ENST00000393284 | 3430 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.75 | □□□□□ -1.97 | | |
| PTPN21 | Q16825 | MIR21-201 | ENST00000362134 | 72 nt | BASIC | 2.75 | □□□□□ -1.97 | | |
| PTPN21 | Q16825 | RNU6-20P-201 | ENST00000384106 | 107 nt | BASIC | 2.75 | □□□□□ -1.97 | | |
| PTPN21 | Q16825 | SNORD14D-201 | ENST00000384390 | 87 nt | BASIC | 2.75 | □□□□□ -1.97 | | |
| PTPN21 | Q16825 | RNU6-1235P-201 | ENST00000384559 | 107 nt | BASIC | 2.75 | □□□□□ -1.97 | | |