Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 RNU7-95P-201ENST00000459222 64 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CLPPQ16740 MTND5P5-201ENST00000503764 376 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CLPPQ16740 RNU7-175P-201ENST00000515915 61 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CLPPQ16740 SNORA31.24-201ENST00000517232 57 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CLPPQ16740 CARD18-203ENST00000532895 422 ntTSL 2 BASIC1.52□□□□□ -2.17
CLPPQ16740 AC084364.2-201ENST00000546924 395 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CLPPQ16740 MIR4790-201ENST00000577799 79 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CLPPQ16740 SNORD11B-201ENST00000607707 90 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CLPPQ16740 MIR8074-201ENST00000615081 81 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CLPPQ16740 MIR7974-201ENST00000615835 79 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CLPPQ16740 AC126177.8-201ENST00000618339 1015 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CLPPQ16740 AL078596.1-201ENST00000624856 447 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CLPPQ16740 PTPN22-206ENST00000525799 2118 ntTSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
CLPPQ16740 ZNF299P-201ENST00000406845 1804 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CLPPQ16740 AP000648.3-201ENST00000623539 4507 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CLPPQ16740 XRCC4-202ENST00000338635 1579 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC1.51□□□□□ -2.17
CLPPQ16740 Y_RNA.67-201ENST00000362870 100 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CLPPQ16740 RNU5F-3P-201ENST00000363767 117 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CLPPQ16740 RNU6-595P-201ENST00000363944 107 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CLPPQ16740 Y_RNA.238-201ENST00000364441 102 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CLPPQ16740 Y_RNA.533-201ENST00000384596 114 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CLPPQ16740 AL356776.1-201ENST00000406574 447 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CLPPQ16740 RNA5SP504-201ENST00000410676 117 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CLPPQ16740 SDAD1P3-201ENST00000427380 333 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CLPPQ16740 AC009474.2-201ENST00000451383 136 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CLPPQ16740 AC025465.3-201ENST00000510570 311 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CLPPQ16740 RNU6-1146P-201ENST00000516282 102 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CLPPQ16740 Y_RNA.682-201ENST00000516457 100 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CLPPQ16740 SNORA25.14-201ENST00000516481 132 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CLPPQ16740 RNU6-358P-201ENST00000516564 75 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CLPPQ16740 AL590705.4-201ENST00000532209 134 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CLPPQ16740 AC092490.2-202ENST00000544922 462 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
CLPPQ16740 AC025030.2-201ENST00000552558 567 ntTSL 2 BASIC1.51□□□□□ -2.17
CLPPQ16740 AL121821.1-201ENST00000557067 530 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
CLPPQ16740 PLD1-217ENST00000627725 174 ntTSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
CLPPQ16740 SKIL-204ENST00000458537 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
CLPPQ16740 RNU6-280P-201ENST00000364145 104 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CLPPQ16740 SNORA63D-201ENST00000364359 132 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CLPPQ16740 RNU6-439P-201ENST00000384188 106 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CLPPQ16740 RNU6-541P-201ENST00000384709 110 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CLPPQ16740 TRAJ39-201ENST00000390498 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.5□□□□□ -2.17
CLPPQ16740 RNU6-360P-201ENST00000390944 104 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CLPPQ16740 SNAP23-203ENST00000397138 477 ntTSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
CLPPQ16740 MTND3P8-201ENST00000412909 339 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CLPPQ16740 AL359081.1-201ENST00000432083 615 ntTSL 2 BASIC1.5□□□□□ -2.17
CLPPQ16740 MTCO3P29-201ENST00000432119 779 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CLPPQ16740 AC069257.2-201ENST00000441819 155 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CLPPQ16740 NDUFB4P10-201ENST00000452541 359 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CLPPQ16740 NDUFAF4P4-201ENST00000454883 502 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CLPPQ16740 AC069439.1-201ENST00000494739 167 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CLPPQ16740 HMGN1P13-201ENST00000505795 138 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CLPPQ16740 AC134698.4-201ENST00000523451 826 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CLPPQ16740 AC087518.1-201ENST00000524098 187 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
CLPPQ16740 MIR4742-201ENST00000581069 85 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CLPPQ16740 AC060780.3-201ENST00000589464 80 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CLPPQ16740 Six3os1_7.1-201ENST00000621512 201 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CLPPQ16740 AC098679.4-201ENST00000624241 654 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CLPPQ16740 snoZ196.1-201ENST00000625269 89 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CLPPQ16740 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
CLPPQ16740 MTND4P12-201ENST00000498999 1377 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CLPPQ16740 snoU2-30.2-201ENST00000362805 70 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CLPPQ16740 RNU6-1059P-201ENST00000363752 98 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CLPPQ16740 RNU6-873P-201ENST00000363833 107 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CLPPQ16740 RNU6-842P-201ENST00000384269 107 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CLPPQ16740 RNU6-57P-201ENST00000411348 103 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CLPPQ16740 AC073323.1-201ENST00000419832 451 ntTSL 2 BASIC1.49□□□□□ -2.17
CLPPQ16740 AC007098.1-201ENST00000420122 367 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CLPPQ16740 HSPE1P9-201ENST00000440046 311 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CLPPQ16740 AL357873.1-201ENST00000449215 282 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
CLPPQ16740 LINC02514-201ENST00000509058 498 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
CLPPQ16740 TRMT112P2-201ENST00000512910 132 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CLPPQ16740 RNU1-117P-201ENST00000517041 158 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CLPPQ16740 CR936218.1-201ENST00000570454 304 ntTSL 2 BASIC1.49□□□□□ -2.17
CLPPQ16740 MIR4422-201ENST00000581938 83 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CLPPQ16740 MIR4781-201ENST00000585250 76 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CLPPQ16740 AP001485.1-201ENST00000604799 199 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CLPPQ16740 UBE2E2-206ENST00000613545 282 ntTSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
CLPPQ16740 BRCA1-202ENST00000354071 4497 ntTSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
CLPPQ16740 ZNF209P-201ENST00000593450 2304 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CLPPQ16740 Y_RNA.72-201ENST00000362894 103 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CLPPQ16740 U3.8-201ENST00000363675 217 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CLPPQ16740 RNU1-42P-201ENST00000364033 160 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CLPPQ16740 RNU6-593P-201ENST00000364716 112 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CLPPQ16740 Y_RNA.405-201ENST00000383979 100 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CLPPQ16740 Y_RNA.451-201ENST00000384200 100 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CLPPQ16740 Y_RNA.524-201ENST00000384564 100 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CLPPQ16740 Y_RNA.561-201ENST00000384694 100 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CLPPQ16740 MIR515-2-201ENST00000384883 83 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CLPPQ16740 MIR515-1-201ENST00000384884 83 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CLPPQ16740 MIR548K-201ENST00000408406 116 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CLPPQ16740 RNU2-7P-201ENST00000410794 178 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CLPPQ16740 RPL30P16-201ENST00000419341 429 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CLPPQ16740 AL592431.2-201ENST00000422198 171 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
CLPPQ16740 AP000235.1-201ENST00000424017 479 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
CLPPQ16740 USMG5P1-201ENST00000425964 177 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CLPPQ16740 FTH1P12-201ENST00000432137 551 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CLPPQ16740 HMGN2P34-201ENST00000437647 269 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CLPPQ16740 Z68323.1-201ENST00000450365 519 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
CLPPQ16740 RNU6-221P-201ENST00000459541 99 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CLPPQ16740 RPL26P26-201ENST00000480251 434 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
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