Protein–RNA interactions for Protein: Q16512

PKN1, Serine/threonine-protein kinase N1, humanhuman

Predictions only

Length 942 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKN1Q16512 MIR3646-201ENST00000578301 84 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PKN1Q16512 AL078604.3-201ENST00000615580 211 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PKN1Q16512 MIR622-201ENST00000638396 96 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PKN1Q16512 ANGPTL1-201ENST00000234816 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
PKN1Q16512 NBPF20-201ENST00000369373 18760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
PKN1Q16512 NDST3-201ENST00000296499 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
PKN1Q16512 KIAA1109-203ENST00000388738 15574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
PKN1Q16512 NEB-201ENST00000172853 20634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
PKN1Q16512 SNORD115-8-201ENST00000363856 82 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PKN1Q16512 Y_RNA.229-201ENST00000364347 113 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PKN1Q16512 SNORD115-38-201ENST00000365037 82 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PKN1Q16512 SNORD58C-201ENST00000365223 64 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PKN1Q16512 DYNLT3P1-201ENST00000378574 347 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PKN1Q16512 MIR514A1-201ENST00000385133 98 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PKN1Q16512 U3.40-201ENST00000408706 208 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PKN1Q16512 TOMM22P1-201ENST00000418578 312 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PKN1Q16512 HMGN2P32-201ENST00000444648 269 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PKN1Q16512 AC010285.1-201ENST00000470580 392 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PKN1Q16512 AC010210.1-203ENST00000513905 260 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
PKN1Q16512 RNU1-61P-201ENST00000516107 151 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PKN1Q16512 RNU6-1061P-201ENST00000516530 99 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PKN1Q16512 AC002545.1-201ENST00000592511 181 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PKN1Q16512 AC008739.1-201ENST00000598137 575 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
PKN1Q16512 AC120024.3-201ENST00000603167 156 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PKN1Q16512 AC010999.1-201ENST00000611856 324 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PKN1Q16512 ST7-OT4_1.1-201ENST00000615322 200 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PKN1Q16512 AC106754.2-201ENST00000623006 233 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PKN1Q16512 AC010329.5-201ENST00000623497 2174 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PKN1Q16512 UGP2-230ENST00000626380 276 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
PKN1Q16512 SULT1B1-201ENST00000310613 7115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
PKN1Q16512 ARHGAP28-204ENST00000419673 5492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
PKN1Q16512 CENPCP1-201ENST00000533085 2578 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PKN1Q16512 HERC5-203ENST00000508159 2243 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
PKN1Q16512 KIAA0586-209ENST00000556134 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
PKN1Q16512 SLC5A3-201ENST00000381151 11576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
PKN1Q16512 MACF1-201ENST00000289893 19141 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
PKN1Q16512 RNU6-173P-201ENST00000364215 104 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PKN1Q16512 SNORA72.4-201ENST00000384174 132 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PKN1Q16512 SNORA20B-201ENST00000384220 132 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PKN1Q16512 SNORA8.3-201ENST00000384679 139 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PKN1Q16512 MIR548A3-201ENST00000385297 97 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PKN1Q16512 TRAV7-201ENST00000390429 337 ntAPPRIS P1 BASIC3.56□□□□□ -1.84
PKN1Q16512 AL606845.1-201ENST00000404881 255 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PKN1Q16512 MLLT10P1-201ENST00000418346 262 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PKN1Q16512 RPL23AP95-201ENST00000426806 265 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PKN1Q16512 AC108488.2-201ENST00000438485 421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
PKN1Q16512 AC025750.2-201ENST00000442609 450 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PKN1Q16512 AC012668.1-201ENST00000457625 228 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
PKN1Q16512 RN7SL20P-201ENST00000488827 297 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PKN1Q16512 AC008885.1-201ENST00000514930 301 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PKN1Q16512 RNU2-12P-201ENST00000517216 168 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PKN1Q16512 RNU2-60P-201ENST00000517290 128 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PKN1Q16512 AC007598.2-201ENST00000569490 539 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
PKN1Q16512 MIR4435-1-201ENST00000582552 80 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PKN1Q16512 AL031274.2-201ENST00000599419 203 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PKN1Q16512 AC004832.5-201ENST00000608677 401 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PKN1Q16512 DICER1-203ENST00000526495 10331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
PKN1Q16512 ZBTB20-201ENST00000357258 27125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
PKN1Q16512 TOPORSLP1-203ENST00000493279 2871 ntTSL 4 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PKN1Q16512 OFD1P6Y-202ENST00000451061 2724 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PKN1Q16512 Y_RNA.114-201ENST00000363265 113 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PKN1Q16512 RNU6-799P-201ENST00000363567 107 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PKN1Q16512 RNU6-727P-201ENST00000363592 107 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PKN1Q16512 RNU6-805P-201ENST00000365643 106 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PKN1Q16512 SNORA44-201ENST00000384584 132 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PKN1Q16512 SNORD15B-201ENST00000384714 146 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PKN1Q16512 AC009969.1-201ENST00000438726 172 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PKN1Q16512 AL078601.1-201ENST00000444542 271 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PKN1Q16512 MLLT10P2-201ENST00000506434 249 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PKN1Q16512 RNA5SP468-201ENST00000516782 93 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PKN1Q16512 AC136628.3-201ENST00000521868 290 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PKN1Q16512 MAL2-206ENST00000522187 547 ntTSL 4 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PKN1Q16512 AC133485.4-201ENST00000561835 220 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PKN1Q16512 AC138907.4-201ENST00000570107 226 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PKN1Q16512 MIR5571-201ENST00000577998 113 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PKN1Q16512 LINC01900-203ENST00000585185 393 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PKN1Q16512 LINC01068-202ENST00000620874 626 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PKN1Q16512 hsa-mir-548d-1.1-201ENST00000636914 97 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PKN1Q16512 PSMD5-AS1-215ENST00000640622 205 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PKN1Q16512 LRRC49-224ENST00000560691 2531 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PKN1Q16512 LATS1-201ENST00000253339 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
PKN1Q16512 CUL3-204ENST00000409777 3147 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
PKN1Q16512 GABRG2-208ENST00000638552 3710 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
PKN1Q16512 RNU6-1285P-201ENST00000363480 105 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PKN1Q16512 Y_RNA.498-201ENST00000384460 102 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PKN1Q16512 RNY1P7-201ENST00000384743 110 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PKN1Q16512 MIR34A-201ENST00000385130 110 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PKN1Q16512 TRAJ40-201ENST00000390497 61 ntAPPRIS P1 BASIC3.54□□□□□ -1.84
PKN1Q16512 TRAJ31-201ENST00000390506 57 ntAPPRIS P1 BASIC3.54□□□□□ -1.84
PKN1Q16512 SNORA75.5-201ENST00000391291 81 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PKN1Q16512 RN7SKP220-201ENST00000410611 288 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PKN1Q16512 RPL32P35-201ENST00000415214 394 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PKN1Q16512 AC096649.2-201ENST00000416186 393 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PKN1Q16512 AC112220.1-201ENST00000434628 355 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PKN1Q16512 AL121890.1-201ENST00000435457 205 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PKN1Q16512 AC009237.8-201ENST00000445492 379 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PKN1Q16512 AC125238.1-201ENST00000448842 249 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PKN1Q16512 UBL5P3-201ENST00000475112 231 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PKN1Q16512 AC025647.1-201ENST00000517879 253 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PKN1Q16512 AC007347.1-201ENST00000563879 281 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
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