Protein–RNA interactions for Protein: Q16473

TNXA, Putative tenascin-XA, humanhuman

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Length 311 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNXAQ16473 AC083904.1-201ENST00000487828 231 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
TNXAQ16473 HMGB1P29-201ENST00000505659 499 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
TNXAQ16473 LINC02233-201ENST00000513718 358 ntTSL 3 BASIC0.69□□□□□ -2.3
TNXAQ16473 SNORA19.2-201ENST00000516013 114 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
TNXAQ16473 SNORD79.1-201ENST00000516069 84 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
TNXAQ16473 RNU6-197P-201ENST00000516680 100 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
TNXAQ16473 RNA5SP454-201ENST00000517231 127 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
TNXAQ16473 AC025580.2-205ENST00000559960 552 ntTSL 4 BASIC0.69□□□□□ -2.3
TNXAQ16473 AC007495.2-202ENST00000564102 535 ntTSL 4 BASIC0.69□□□□□ -2.3
TNXAQ16473 AC092071.1-201ENST00000597260 549 ntTSL 5 BASIC0.69□□□□□ -2.3
TNXAQ16473 AL162424.1-201ENST00000602325 221 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
TNXAQ16473 AC068790.6-201ENST00000602558 258 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
TNXAQ16473 AC121247.2-201ENST00000604776 136 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
TNXAQ16473 AC068792.1-201ENST00000621354 417 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
TNXAQ16473 Six3os1_7.1-201ENST00000621512 201 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
TNXAQ16473 AC008873.1-201ENST00000625051 138 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
TNXAQ16473 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC0.69□□□□□ -2.3
TNXAQ16473 AC018630.2-201ENST00000534866 2403 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
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TNXAQ16473 SNORA69-201ENST00000383895 132 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
TNXAQ16473 MIR100-201ENST00000385259 80 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
TNXAQ16473 RNU6-440P-201ENST00000390882 105 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
TNXAQ16473 AL034345.1-201ENST00000407768 123 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
TNXAQ16473 RNU6-1186P-201ENST00000410429 97 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
TNXAQ16473 RNU4-55P-201ENST00000410731 137 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
TNXAQ16473 AC006159.2-201ENST00000421965 692 ntTSL 2 BASIC0.68□□□□□ -2.3
TNXAQ16473 AC019155.3-201ENST00000454957 600 ntTSL 2 BASIC0.68□□□□□ -2.3
TNXAQ16473 RNU7-187P-201ENST00000458985 68 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
TNXAQ16473 RNU6-1208P-201ENST00000459588 107 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
TNXAQ16473 AC048334.1-201ENST00000477975 159 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
TNXAQ16473 Y_RNA.654-201ENST00000497848 106 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
TNXAQ16473 AC105758.1-201ENST00000506038 399 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
TNXAQ16473 AC091133.4-201ENST00000511142 308 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
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TNXAQ16473 AC100807.1-201ENST00000517640 552 ntTSL 5 BASIC0.68□□□□□ -2.3
TNXAQ16473 AC090142.3-201ENST00000519012 385 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
TNXAQ16473 AC104383.1-201ENST00000530297 370 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
TNXAQ16473 MIR4698-201ENST00000577795 80 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
TNXAQ16473 SNORD3E-202ENST00000627253 216 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
TNXAQ16473 TEX15-201ENST00000256246 10110 ntTSL 1 (best) BASIC0.68□□□□□ -2.3
TNXAQ16473 RNU4-76P-201ENST00000364509 141 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
TNXAQ16473 Y_RNA.363-201ENST00000365529 113 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
TNXAQ16473 Y_RNA.372-201ENST00000365599 102 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
TNXAQ16473 RNU6-1080P-201ENST00000383982 107 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
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TNXAQ16473 Y_RNA.553-201ENST00000384670 102 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
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TNXAQ16473 MRPL42P3-201ENST00000401492 326 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
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TNXAQ16473 AL606490.4-201ENST00000423117 127 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
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TNXAQ16473 RN7SKP298-201ENST00000515950 94 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
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TNXAQ16473 AC007834.2-201ENST00000536310 343 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
TNXAQ16473 AC006362.1-201ENST00000567392 174 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
TNXAQ16473 FAM71BP1-201ENST00000604431 523 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
TNXAQ16473 AC073349.3-201ENST00000617616 186 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
TNXAQ16473 BCL2L11-225ENST00000640419 249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.66□□□□□ -2.3
TNXAQ16473 OR4G1P-203ENST00000641984 1631 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
TNXAQ16473 Y_RNA.100-201ENST00000363141 102 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
TNXAQ16473 RNY1P10-201ENST00000363268 113 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
TNXAQ16473 RNU6-522P-201ENST00000364497 107 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
TNXAQ16473 Y_RNA.415-201ENST00000384012 112 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
TNXAQ16473 RNU6-214P-201ENST00000384130 107 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
TNXAQ16473 MIR32-201ENST00000384965 70 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
TNXAQ16473 MIR514A2-201ENST00000385131 88 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
TNXAQ16473 MIR514A3-201ENST00000385132 88 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
TNXAQ16473 EIF4E2P1-201ENST00000393781 255 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
TNXAQ16473 DEFB108C-201ENST00000400154 252 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
TNXAQ16473 AL590002.1-201ENST00000406554 418 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
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