Protein–RNA interactions for Protein: Q15436

SEC23A, Protein transport protein Sec23A, humanhuman

Predictions only

Length 765 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23AQ15436 Y_RNA.274-201ENST00000364714 101 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SEC23AQ15436 Y_RNA.555-201ENST00000384673 110 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SEC23AQ15436 MIR586-201ENST00000385035 97 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SEC23AQ15436 MIR1294-201ENST00000408503 142 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SEC23AQ15436 SNORD88.1-201ENST00000408684 91 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SEC23AQ15436 Y_RNA.793-201ENST00000411222 111 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SEC23AQ15436 RNU6-1199P-201ENST00000411249 104 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SEC23AQ15436 MRPS10P1-201ENST00000448483 130 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SEC23AQ15436 SUMO1P2-201ENST00000452524 304 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SEC23AQ15436 RNU2-12P-201ENST00000517216 168 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SEC23AQ15436 AC006504.5-204ENST00000592404 765 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
SEC23AQ15436 AC010620.2-201ENST00000600135 313 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SEC23AQ15436 Z83818.1-201ENST00000603584 150 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SEC23AQ15436 AL355512.1-202ENST00000607952 209 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
SEC23AQ15436 AC090517.3-201ENST00000625170 141 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SEC23AQ15436 FAM214A-201ENST00000261844 4217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
SEC23AQ15436 AC007336.1-201ENST00000576365 3828 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SEC23AQ15436 Y_RNA.76-201ENST00000362931 109 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SEC23AQ15436 Y_RNA.292-201ENST00000364904 97 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SEC23AQ15436 RNY4P28-201ENST00000365281 93 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SEC23AQ15436 MIR300-201ENST00000401138 83 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SEC23AQ15436 AC074290.1-201ENST00000448883 135 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SEC23AQ15436 RPL23AP3-201ENST00000453844 468 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SEC23AQ15436 PRELID3BP1-201ENST00000457142 540 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SEC23AQ15436 Y_RNA.644-201ENST00000459006 113 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SEC23AQ15436 Y_RNA.674-201ENST00000516362 113 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SEC23AQ15436 RNU1-117P-201ENST00000517041 158 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SEC23AQ15436 MIR4672-201ENST00000583126 81 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SEC23AQ15436 AC004792.1-201ENST00000614523 137 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SEC23AQ15436 FTX_2.1-201ENST00000618816 94 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SEC23AQ15436 ZMYM2-203ENST00000382874 10139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
SEC23AQ15436 SCOC-201ENST00000338517 1864 ntTSL 4 BASIC3.07□□□□□ -1.92
SEC23AQ15436 AC135776.4-201ENST00000624300 1904 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SEC23AQ15436 Z82209.1-201ENST00000422141 2135 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SEC23AQ15436 PCDH11Y-201ENST00000215473 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
SEC23AQ15436 SNORA67.2-201ENST00000384300 149 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SEC23AQ15436 RNU6-1289P-201ENST00000384431 106 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SEC23AQ15436 FOXP2-210ENST00000403559 6415 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
SEC23AQ15436 Y_RNA.597-201ENST00000410463 100 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SEC23AQ15436 ZBED5-202ENST00000432999 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
SEC23AQ15436 AC140059.1-201ENST00000489238 361 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SEC23AQ15436 AC113383.1-204ENST00000507060 552 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
SEC23AQ15436 RNU6-191P-201ENST00000516295 94 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SEC23AQ15436 RNU5F-4P-201ENST00000516581 114 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SEC23AQ15436 RNU4ATAC17P-201ENST00000517272 120 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SEC23AQ15436 MIR3162-201ENST00000581818 82 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SEC23AQ15436 AC073349.3-201ENST00000617616 186 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SEC23AQ15436 ROCK2-203ENST00000401753 4017 ntTSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
SEC23AQ15436 RICTOR-201ENST00000296782 7505 ntTSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
SEC23AQ15436 OR5V1-217ENST00000641768 2763 ntAPPRIS P1 BASIC3.05□□□□□ -1.92
SEC23AQ15436 MIR411-201ENST00000362239 96 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SEC23AQ15436 SNORA40.19-201ENST00000390846 128 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SEC23AQ15436 SNORA12-201ENST00000391162 147 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SEC23AQ15436 AL603908.1-201ENST00000406098 201 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SEC23AQ15436 U3.40-201ENST00000408706 208 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SEC23AQ15436 RNA5SP504-201ENST00000410676 117 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SEC23AQ15436 AC093423.2-201ENST00000429074 437 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
SEC23AQ15436 SNORD2.1-201ENST00000458762 69 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SEC23AQ15436 Y_RNA.638-201ENST00000459374 113 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SEC23AQ15436 AC096725.1-201ENST00000514266 313 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SEC23AQ15436 RN7SKP282-201ENST00000516824 299 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SEC23AQ15436 SCARNA3-201ENST00000517097 143 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SEC23AQ15436 RN7SKP40-201ENST00000517211 242 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SEC23AQ15436 RNU6-586P-201ENST00000517265 104 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SEC23AQ15436 AP002001.1-203ENST00000534002 267 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SEC23AQ15436 AC018630.3-201ENST00000542637 96 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SEC23AQ15436 RPL21P9-201ENST00000556149 474 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SEC23AQ15436 HMHB1-202ENST00000638299 126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
SEC23AQ15436 LCOR-205ENST00000421806 16004 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
SEC23AQ15436 PRKG1-205ENST00000401604 5922 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
SEC23AQ15436 CHD9-218ENST00000566029 13110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
SEC23AQ15436 AC114316.2-202ENST00000502934 2957 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
SEC23AQ15436 Y_RNA.217-201ENST00000364214 105 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SEC23AQ15436 SNORA68.1-201ENST00000364537 132 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SEC23AQ15436 Y_RNA.270-201ENST00000364693 104 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SEC23AQ15436 SNORD87-201ENST00000364849 89 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SEC23AQ15436 MIR634-201ENST00000385208 97 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SEC23AQ15436 Y_RNA.626-201ENST00000411288 95 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SEC23AQ15436 AC097662.1-205ENST00000433324 241 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
SEC23AQ15436 Y_RNA.641-201ENST00000459414 105 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SEC23AQ15436 AC080013.2-201ENST00000460866 323 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SEC23AQ15436 AC114982.1-201ENST00000469402 321 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SEC23AQ15436 AP005660.1-201ENST00000522972 293 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SEC23AQ15436 CBX3P4-201ENST00000538909 354 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SEC23AQ15436 MIR7515-201ENST00000637837 67 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SEC23AQ15436 OR4K2-204ENST00000641885 8681 ntAPPRIS P1 BASIC3.04□□□□□ -1.92
SEC23AQ15436 RFESD-202ENST00000380005 2587 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
SEC23AQ15436 RNU4-80P-201ENST00000363200 141 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SEC23AQ15436 RNU6-1062P-201ENST00000383908 107 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SEC23AQ15436 RNU6-710P-201ENST00000410424 105 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SEC23AQ15436 RN7SKP123-201ENST00000410732 291 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SEC23AQ15436 AL513477.1-202ENST00000417061 214 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SEC23AQ15436 TMEM132D-AS1-202ENST00000510001 293 ntTSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
SEC23AQ15436 AC010210.1-203ENST00000513905 260 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
SEC23AQ15436 RNU6-436P-201ENST00000516171 114 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SEC23AQ15436 AC068992.1-202ENST00000519280 270 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
SEC23AQ15436 AC006023.1-201ENST00000603944 259 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SEC23AQ15436 AC069294.1-201ENST00000608397 350 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SEC23AQ15436 AC138915.1-201ENST00000565427 1685 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SEC23AQ15436 ZNF644-212ENST00000621077 2056 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
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