Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 ANKRD36-208ENST00000639751 3090 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
PUM3Q15397 RNA5SP432-201ENST00000362480 116 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
PUM3Q15397 RNA5SP276-201ENST00000362580 94 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
PUM3Q15397 Y_RNA.197-201ENST00000364004 102 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
PUM3Q15397 RNU6-975P-201ENST00000384296 105 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
PUM3Q15397 Y_RNA.535-201ENST00000384612 99 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
PUM3Q15397 AC019129.1-201ENST00000403786 261 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
PUM3Q15397 MIR1283-2-201ENST00000408621 87 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
PUM3Q15397 Y_RNA.592-201ENST00000410274 109 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
PUM3Q15397 MTND2P29-201ENST00000438595 412 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
PUM3Q15397 AC010531.2-201ENST00000465012 153 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
PUM3Q15397 RPL23AP42-201ENST00000471152 471 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
PUM3Q15397 RPS27P21-201ENST00000486977 252 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
PUM3Q15397 HMGN1P13-201ENST00000505795 138 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
PUM3Q15397 AC067942.3-201ENST00000512025 362 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
PUM3Q15397 AP005660.1-201ENST00000522972 293 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
PUM3Q15397 AC125232.2-201ENST00000592457 143 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
PUM3Q15397 SDR42E1P4-201ENST00000620894 481 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
PUM3Q15397 DDIAS-201ENST00000329143 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
PUM3Q15397 AC005336.3-201ENST00000623833 2679 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
PUM3Q15397 THOC2-216ENST00000491737 4452 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
PUM3Q15397 RNU6-23P-201ENST00000363283 107 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
PUM3Q15397 RNU6-727P-201ENST00000363592 107 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
PUM3Q15397 Y_RNA.419-201ENST00000384041 102 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
PUM3Q15397 AL078595.1-201ENST00000404458 226 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
PUM3Q15397 Y_RNA.595-201ENST00000410403 105 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
PUM3Q15397 RNU6-1001P-201ENST00000411265 100 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
PUM3Q15397 NDUFB4P10-201ENST00000452541 359 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
PUM3Q15397 U8.22-201ENST00000459141 133 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
PUM3Q15397 RNU6-295P-201ENST00000516901 104 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
PUM3Q15397 MZT1P2-201ENST00000604387 248 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
PUM3Q15397 LINC02104-202ENST00000604954 599 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
PUM3Q15397 AL080274.1-201ENST00000605565 220 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
PUM3Q15397 AL162373.1-201ENST00000620433 407 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
PUM3Q15397 AL160413.1-201ENST00000622780 310 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
PUM3Q15397 Clostridiales-1.3-201ENST00000637703 147 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
PUM3Q15397 CCDC30-201ENST00000340612 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
PUM3Q15397 MIR340-201ENST00000362125 95 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PUM3Q15397 U3.8-201ENST00000363675 217 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PUM3Q15397 RNA5SP493-201ENST00000364115 91 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PUM3Q15397 Y_RNA.252-201ENST00000364556 101 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PUM3Q15397 RNU6-418P-201ENST00000384035 107 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PUM3Q15397 RNU6-1235P-201ENST00000384559 107 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PUM3Q15397 MIR329-1-201ENST00000385028 80 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PUM3Q15397 U3.40-201ENST00000408706 208 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PUM3Q15397 RNA5SP504-201ENST00000410676 117 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PUM3Q15397 RPS20P15-201ENST00000412792 311 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PUM3Q15397 LINC01509-202ENST00000423523 408 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
PUM3Q15397 AC092813.2-201ENST00000434540 399 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
PUM3Q15397 AL353689.1-201ENST00000438895 199 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PUM3Q15397 EHHADH-202ENST00000440662 656 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
PUM3Q15397 RNU6-498P-201ENST00000459468 107 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PUM3Q15397 Y_RNA.661-201ENST00000516003 99 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PUM3Q15397 RNU6-911P-201ENST00000516523 104 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PUM3Q15397 RN7SKP49-201ENST00000516675 260 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PUM3Q15397 AL590240.4-201ENST00000616908 390 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PUM3Q15397 AC090971.5-201ENST00000621102 293 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PUM3Q15397 ZDBF2-202ENST00000611847 9890 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
PUM3Q15397 SLCO1B3-202ENST00000381545 2805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
PUM3Q15397 SCN7A-201ENST00000409855 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
PUM3Q15397 SNORD114-6-201ENST00000364393 72 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PUM3Q15397 RNU4-42P-201ENST00000364738 142 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PUM3Q15397 RNA5SP160-201ENST00000364866 120 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PUM3Q15397 Y_RNA.415-201ENST00000384012 112 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PUM3Q15397 RNU6-1145P-201ENST00000384246 107 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PUM3Q15397 SNAP23-203ENST00000397138 477 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
PUM3Q15397 AL356379.1-201ENST00000414105 126 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PUM3Q15397 AL158823.1-201ENST00000418441 478 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PUM3Q15397 AL021397.1-201ENST00000451806 248 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PUM3Q15397 RPL23AP3-201ENST00000453844 468 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PUM3Q15397 RNU7-169P-201ENST00000459456 61 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PUM3Q15397 RNU7-57P-201ENST00000459540 60 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PUM3Q15397 AC025033.1-201ENST00000463883 194 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PUM3Q15397 AC015712.3-201ENST00000559380 164 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PUM3Q15397 AC110588.1-201ENST00000559699 137 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PUM3Q15397 SNRPGP19-201ENST00000603826 189 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PUM3Q15397 AC005034.5-201ENST00000604219 466 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PUM3Q15397 AL357054.2-201ENST00000607644 423 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
PUM3Q15397 MIR6845-201ENST00000613182 61 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PUM3Q15397 U1.36-201ENST00000620684 176 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PUM3Q15397 ANKRD20A9P-201ENST00000457997 2978 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PUM3Q15397 CYLC2-204ENST00000612124 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
PUM3Q15397 MRPL42-202ENST00000393128 1983 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
PUM3Q15397 Y_RNA.5-201ENST00000362334 102 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PUM3Q15397 SNORD87-201ENST00000364849 89 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PUM3Q15397 MIR583-201ENST00000384846 75 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PUM3Q15397 MIR597-201ENST00000384968 97 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PUM3Q15397 MIR628-201ENST00000385229 95 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PUM3Q15397 TRAJ50-201ENST00000390487 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.38□□□□□ -2.03
PUM3Q15397 SNORA26.9-201ENST00000391322 122 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PUM3Q15397 AL035415.1-201ENST00000447150 289 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
PUM3Q15397 LINC01032-201ENST00000451690 276 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
PUM3Q15397 RNA5SP233-201ENST00000459153 113 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PUM3Q15397 AC108210.2-201ENST00000503681 201 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PUM3Q15397 RNA5SP182-201ENST00000516064 82 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PUM3Q15397 MIR3169-201ENST00000578032 83 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PUM3Q15397 U2.1-201ENST00000618978 145 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PUM3Q15397 Six3os1_7.1-201ENST00000621512 201 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PUM3Q15397 AC091925.1-201ENST00000623204 462 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PUM3Q15397 SMARCAD1-201ENST00000354268 4912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
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