Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 RNU6-1019P-201ENST00000364424 107 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
BRD3Q15059 RNU6-1240P-201ENST00000365155 104 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
BRD3Q15059 Y_RNA.500-201ENST00000384466 111 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
BRD3Q15059 RNU6-296P-201ENST00000384608 107 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
BRD3Q15059 SNORA69.1-201ENST00000390904 137 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
BRD3Q15059 AC114482.1-201ENST00000418010 247 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
BRD3Q15059 AL592431.2-201ENST00000422198 171 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
BRD3Q15059 FAR2P3-204ENST00000434661 444 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
BRD3Q15059 LINC01032-201ENST00000451690 276 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
BRD3Q15059 SNORD19B-201ENST00000459623 84 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
BRD3Q15059 RN7SKP49-201ENST00000516675 260 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
BRD3Q15059 AC099850.3-201ENST00000577678 321 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
BRD3Q15059 MIR3935-201ENST00000583472 104 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
BRD3Q15059 AL357075.2-201ENST00000614906 189 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
BRD3Q15059 AC084781.2-201ENST00000615568 161 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
BRD3Q15059 AC009831.4-201ENST00000620744 325 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
BRD3Q15059 hsa-mir-548d-1.1-201ENST00000636914 97 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
BRD3Q15059 FGF7-206ENST00000614567 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
BRD3Q15059 AC131280.1-202ENST00000624067 4211 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
BRD3Q15059 Y_RNA.287-201ENST00000364853 94 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
BRD3Q15059 RNA5SP160-201ENST00000364866 120 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
BRD3Q15059 RNU6-1040P-201ENST00000383974 107 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
BRD3Q15059 RNU6-318P-201ENST00000384283 103 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
BRD3Q15059 RNU6-417P-201ENST00000384712 107 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
BRD3Q15059 MIR559-201ENST00000385188 96 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
BRD3Q15059 MRPS18CP6-201ENST00000423587 223 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
BRD3Q15059 TOMM22P2-201ENST00000430735 237 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
BRD3Q15059 RNU7-152P-201ENST00000458982 64 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
BRD3Q15059 RNU7-4P-201ENST00000516961 62 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
BRD3Q15059 MIR2355-201ENST00000517199 87 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
BRD3Q15059 AC103794.1-201ENST00000531763 197 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
BRD3Q15059 ZBBX-205ENST00000455345 3185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
BRD3Q15059 RNU6-1301P-201ENST00000362724 104 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
BRD3Q15059 RNU6-1266P-201ENST00000362794 105 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
BRD3Q15059 RNU6-490P-201ENST00000362985 107 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
BRD3Q15059 SNORA33-201ENST00000363664 130 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
BRD3Q15059 XGY1-201ENST00000381172 446 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
BRD3Q15059 TRAJ23-201ENST00000390514 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.29□□□□□ -2.04
BRD3Q15059 Y_RNA.592-201ENST00000410274 109 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
BRD3Q15059 MTND3P22-201ENST00000510932 243 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
BRD3Q15059 AC008892.1-201ENST00000511861 384 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
BRD3Q15059 AC008413.1-201ENST00000511864 177 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
BRD3Q15059 RNA5SP24-201ENST00000516478 95 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
BRD3Q15059 RNA5SP281-201ENST00000516504 135 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
BRD3Q15059 RNA5SP364-201ENST00000516938 78 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
BRD3Q15059 AC084364.2-201ENST00000546924 395 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
BRD3Q15059 AC116312.1-201ENST00000606841 314 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
BRD3Q15059 AC103810.8-201ENST00000607347 118 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
BRD3Q15059 PLD1-217ENST00000627725 174 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
BRD3Q15059 ZNF658B-202ENST00000615961 3375 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
BRD3Q15059 MTND5P10-201ENST00000603719 1809 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
BRD3Q15059 AC010615.1-201ENST00000594254 1764 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
BRD3Q15059 SNORA72.2-201ENST00000365028 127 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
BRD3Q15059 RNU6-1264P-201ENST00000383891 107 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
BRD3Q15059 MIR520A-201ENST00000384862 85 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
BRD3Q15059 MIR515-2-201ENST00000384883 83 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
BRD3Q15059 MIR515-1-201ENST00000384884 83 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
BRD3Q15059 SNORA48.3-201ENST00000391081 134 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
BRD3Q15059 ELOCP21-201ENST00000412558 336 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
BRD3Q15059 AL589935.1-209ENST00000432050 418 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
BRD3Q15059 LINC02545-201ENST00000525381 306 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
BRD3Q15059 AP001825.1-201ENST00000534275 351 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
BRD3Q15059 GNAI2P1-201ENST00000541815 315 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
BRD3Q15059 AL160408.5-201ENST00000607759 526 ntTSL 4 BASIC2.28□□□□□ -2.04
BRD3Q15059 uc_338.20-201ENST00000621563 178 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
BRD3Q15059 PTPN22-206ENST00000525799 2118 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
BRD3Q15059 MT-TD-201ENST00000387419 68 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
BRD3Q15059 MTND4P28-201ENST00000426217 387 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
BRD3Q15059 AC236972.2-201ENST00000434979 310 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
BRD3Q15059 PCNPP5-201ENST00000452246 481 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
BRD3Q15059 RPL23AP63-201ENST00000498752 471 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
BRD3Q15059 AC074133.1-201ENST00000515696 183 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
BRD3Q15059 AC144568.1-201ENST00000520139 137 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
BRD3Q15059 LARP7P1-201ENST00000605576 316 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
BRD3Q15059 XRCC4-202ENST00000338635 1579 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
BRD3Q15059 SI-201ENST00000264382 6011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
BRD3Q15059 Y_RNA.58-201ENST00000362807 102 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
BRD3Q15059 RNU4-73P-201ENST00000363164 141 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
BRD3Q15059 Y_RNA.154-201ENST00000363624 102 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
BRD3Q15059 SNORA63D-201ENST00000364359 132 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
BRD3Q15059 RNY3P1-201ENST00000365085 102 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
BRD3Q15059 RNY3-201ENST00000365484 102 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
BRD3Q15059 SUMO2P12-201ENST00000405924 140 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
BRD3Q15059 CEP57L1P1-201ENST00000430943 1201 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
BRD3Q15059 AC099799.1-201ENST00000439809 192 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
BRD3Q15059 AC069257.2-201ENST00000441819 155 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
BRD3Q15059 RNU6-699P-201ENST00000517081 110 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
BRD3Q15059 RNA5SP437-201ENST00000517249 129 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
BRD3Q15059 AC022432.1-201ENST00000595739 310 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
BRD3Q15059 CENPF-206ENST00000614578 528 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
BRD3Q15059 XIRP2-201ENST00000295237 5246 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
BRD3Q15059 ANKRD30BP1-201ENST00000451052 2186 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
BRD3Q15059 TBL1XR1-208ENST00000430069 7948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
BRD3Q15059 AL356292.1-201ENST00000283110 373 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
BRD3Q15059 Y_RNA.187-201ENST00000363918 113 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
BRD3Q15059 RNY3P11-201ENST00000364153 102 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
BRD3Q15059 Y_RNA.314-201ENST00000365114 102 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
BRD3Q15059 RNU6-439P-201ENST00000384188 106 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
BRD3Q15059 SNORA67.4-201ENST00000384688 142 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
BRD3Q15059 RNA5SP467-201ENST00000391274 118 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115 ms