Protein–RNA interactions for Protein: Q15036

SNX17, Sorting nexin-17, humanhuman

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Length 470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX17Q15036 RNU2-12P-201ENST00000517216 168 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SNX17Q15036 AP003465.1-201ENST00000520575 382 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
SNX17Q15036 AC022616.8-201ENST00000533569 253 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SNX17Q15036 CR936218.1-201ENST00000570454 304 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
SNX17Q15036 SNRPGP20-201ENST00000604477 205 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SNX17Q15036 AC069294.1-201ENST00000608397 350 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SNX17Q15036 MIR3658-201ENST00000636291 56 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SNX17Q15036 OFD1P6Y-202ENST00000451061 2724 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SNX17Q15036 RICTOR-201ENST00000296782 7505 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
SNX17Q15036 EYS-204ENST00000370621 10485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
SNX17Q15036 RNU6-529P-201ENST00000363383 104 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SNX17Q15036 AP002088.1-201ENST00000382740 395 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SNX17Q15036 SNORA40-201ENST00000388090 126 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SNX17Q15036 MIR320B2-201ENST00000408479 138 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SNX17Q15036 AL358234.1-201ENST00000421132 273 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
SNX17Q15036 AL161651.1-201ENST00000440882 223 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SNX17Q15036 RNU6-1211P-201ENST00000459179 105 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SNX17Q15036 RN7SL442P-201ENST00000473804 320 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SNX17Q15036 RPL31P41-201ENST00000477967 372 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SNX17Q15036 AC025281.1-201ENST00000567026 265 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SNX17Q15036 MIR3923-201ENST00000579521 83 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SNX17Q15036 CENPQ-201ENST00000335783 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
SNX17Q15036 PIK3C2G-201ENST00000266497 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
SNX17Q15036 WDFY3-AS2-202ENST00000451762 5814 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
SNX17Q15036 Y_RNA.24-201ENST00000362508 103 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SNX17Q15036 MIR767-201ENST00000390228 109 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SNX17Q15036 RNU6-578P-201ENST00000390980 103 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SNX17Q15036 RNA5SP293-201ENST00000410527 113 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SNX17Q15036 AC004866.1-201ENST00000411748 78 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SNX17Q15036 MTND4LP9-201ENST00000427694 174 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SNX17Q15036 AC027124.2-201ENST00000428249 105 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SNX17Q15036 AC108488.2-201ENST00000438485 421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
SNX17Q15036 DIP2A-IT1-201ENST00000442434 428 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
SNX17Q15036 AL109933.2-201ENST00000452651 260 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SNX17Q15036 RPS27P29-201ENST00000463110 252 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SNX17Q15036 RNU6-453P-201ENST00000516819 85 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SNX17Q15036 RNU6-1234P-201ENST00000516877 103 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SNX17Q15036 RNU1-117P-201ENST00000517041 158 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SNX17Q15036 AC115990.1-201ENST00000526957 301 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SNX17Q15036 AL157911.1-202ENST00000554123 502 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
SNX17Q15036 AC092138.2-201ENST00000563811 428 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
SNX17Q15036 MIR4744-201ENST00000581563 82 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SNX17Q15036 5S_rRNA.12-201ENST00000617631 107 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SNX17Q15036 OXR1-207ENST00000497705 2007 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
SNX17Q15036 OR51L1-203ENST00000641819 7300 ntAPPRIS P1 BASIC3.42□□□□□ -1.86
SNX17Q15036 C6orf10-202ENST00000375015 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
SNX17Q15036 AL391516.1-201ENST00000554380 2449 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SNX17Q15036 ANKAR-201ENST00000313581 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
SNX17Q15036 AC010329.5-201ENST00000623497 2174 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SNX17Q15036 RNU6-44P-201ENST00000384045 107 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SNX17Q15036 EBAG9P1-201ENST00000418955 543 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SNX17Q15036 LINC01402-201ENST00000422226 279 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
SNX17Q15036 AL137159.1-201ENST00000452808 512 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SNX17Q15036 AL441985.1-201ENST00000457727 251 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SNX17Q15036 AC146507.2-201ENST00000460608 476 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SNX17Q15036 AC114982.1-201ENST00000469402 321 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SNX17Q15036 AC083906.5-201ENST00000503722 328 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SNX17Q15036 RNU6-1333P-201ENST00000516162 93 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SNX17Q15036 AC136628.3-201ENST00000521868 290 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SNX17Q15036 AC012435.2-201ENST00000562869 361 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
SNX17Q15036 MIR4431-201ENST00000579990 94 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SNX17Q15036 AL359881.1-201ENST00000602916 267 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SNX17Q15036 AL356575.1-201ENST00000603008 283 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SNX17Q15036 AC013791.1-201ENST00000616619 62 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SNX17Q15036 SERPINI2-207ENST00000476257 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
SNX17Q15036 MCF2-208ENST00000519895 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
SNX17Q15036 AC002543.1-201ENST00000299783 1954 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SNX17Q15036 GABRG2-215ENST00000639213 9960 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
SNX17Q15036 CEP57L1-223ENST00000523787 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.86
SNX17Q15036 ROS1-202ENST00000368508 7435 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
SNX17Q15036 MIR22-201ENST00000362190 85 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SNX17Q15036 Y_RNA.71-201ENST00000362892 104 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SNX17Q15036 Y_RNA.218-201ENST00000364218 104 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SNX17Q15036 RNA5SP139-201ENST00000364340 117 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SNX17Q15036 RNA5SP205-201ENST00000364653 136 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SNX17Q15036 Y_RNA.353-201ENST00000365440 108 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SNX17Q15036 RNU6-1264P-201ENST00000383891 107 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SNX17Q15036 MIR513C-201ENST00000401352 84 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SNX17Q15036 MIR1261-201ENST00000408659 82 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SNX17Q15036 RNU2-49P-201ENST00000410666 184 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SNX17Q15036 AC023141.4-201ENST00000412031 328 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SNX17Q15036 AC004386.2-201ENST00000441858 148 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SNX17Q15036 ZNF680-202ENST00000447137 2159 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
SNX17Q15036 SCARNA8-201ENST00000515924 131 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SNX17Q15036 RNU6-1007P-201ENST00000516586 107 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SNX17Q15036 RNU7-121P-201ENST00000516604 62 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SNX17Q15036 AC012413.1-201ENST00000521294 519 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
SNX17Q15036 AC105137.2-201ENST00000569073 466 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SNX17Q15036 MIR3136-201ENST00000583498 78 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SNX17Q15036 AC008739.1-201ENST00000598137 575 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
SNX17Q15036 AL034555.1-201ENST00000604816 211 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SNX17Q15036 AC107294.3-201ENST00000609211 526 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SNX17Q15036 SNORA50A-202ENST00000629536 136 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SNX17Q15036 PLS1-201ENST00000337777 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
SNX17Q15036 AC100800.1-201ENST00000524252 2054 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
SNX17Q15036 Y_RNA.40-201ENST00000362645 93 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SNX17Q15036 RNA5SP383-201ENST00000362934 120 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SNX17Q15036 RNU6-487P-201ENST00000365430 104 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SNX17Q15036 RNU6-19P-201ENST00000384718 107 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SNX17Q15036 MIR626-201ENST00000385032 94 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
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