Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 SNRPGP20-201ENST00000604477 205 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CHD4Q14839 RPL17P51-201ENST00000605218 238 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CHD4Q14839 MIR6128-201ENST00000615528 109 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CHD4Q14839 HOXA11-AS1_4.1-201ENST00000620901 233 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CHD4Q14839 AL807742.1-203ENST00000637444 759 ntTSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
CHD4Q14839 GLMN-201ENST00000370360 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.61□□□□□ -2.15
CHD4Q14839 ZNF299P-201ENST00000406845 1804 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CHD4Q14839 JMJD1C-212ENST00000639129 7901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
CHD4Q14839 KTN1-214ENST00000554507 2057 ntTSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
CHD4Q14839 MTND4P12-201ENST00000498999 1377 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CHD4Q14839 RNU1-58P-201ENST00000362413 163 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CHD4Q14839 Y_RNA.132-201ENST00000363421 102 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CHD4Q14839 SNORD115-32-201ENST00000364079 82 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CHD4Q14839 AC007098.1-201ENST00000420122 367 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CHD4Q14839 HYDIN2-201ENST00000493714 554 ntTSL 4 BASIC1.6□□□□□ -2.15
CHD4Q14839 AC026782.1-201ENST00000512952 449 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CHD4Q14839 RNU6-1016P-201ENST00000516689 94 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CHD4Q14839 RNU6-965P-201ENST00000516721 96 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CHD4Q14839 AL590705.4-201ENST00000532209 134 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CHD4Q14839 AC084364.2-201ENST00000546924 395 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CHD4Q14839 EIF4A1P12-201ENST00000551910 141 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CHD4Q14839 hsa-mir-3119-1.1-201ENST00000577602 85 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CHD4Q14839 AL117336.2-201ENST00000602435 335 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CHD4Q14839 AL008636.1-201ENST00000625038 1018 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CHD4Q14839 SNORA43.4-201ENST00000629559 138 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CHD4Q14839 MT-ND1-201ENST00000361390 956 ntAPPRIS P1 BASIC1.6□□□□□ -2.15
CHD4Q14839 SNORD81.2-201ENST00000365153 76 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CHD4Q14839 RNU6-1283P-201ENST00000365314 105 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
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CHD4Q14839 MTND3P23-201ENST00000431980 347 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CHD4Q14839 AC093019.1-201ENST00000443135 252 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CHD4Q14839 AC007215.1-201ENST00000464893 276 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CHD4Q14839 AC093893.1-201ENST00000505781 510 ntTSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
CHD4Q14839 AC074133.1-201ENST00000515696 183 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
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CHD4Q14839 AC092794.2-201ENST00000620933 563 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CHD4Q14839 LINC02555-201ENST00000563933 1951 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
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CHD4Q14839 AL356432.1-201ENST00000405809 419 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CHD4Q14839 AC245102.2-201ENST00000448956 180 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CHD4Q14839 AC107399.1-201ENST00000451226 265 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
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CHD4Q14839 AP003174.2-201ENST00000544663 294 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
CHD4Q14839 CYP2C61P-201ENST00000604072 290 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CHD4Q14839 DLEU2_5.1-201ENST00000615567 84 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CHD4Q14839 ZEB2_AS1_1.1-201ENST00000621504 128 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
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CHD4Q14839 AC068338.1-201ENST00000565567 176 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
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CHD4Q14839 AC100810.6-201ENST00000638068 285 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
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CHD4Q14839 ACTG1P17-203ENST00000561222 537 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
CHD4Q14839 AC009754.1-201ENST00000566282 540 ntTSL 4 BASIC1.58□□□□□ -2.16
CHD4Q14839 MIR5006-201ENST00000583027 110 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CHD4Q14839 BX322639.1-202ENST00000423987 2213 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CHD4Q14839 Y_RNA.86-201ENST00000363020 111 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CHD4Q14839 SNORA3A-201ENST00000364113 130 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CHD4Q14839 AL365434.1-201ENST00000412362 380 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
CHD4Q14839 EIF4EP2-201ENST00000422816 654 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CHD4Q14839 AL590632.1-201ENST00000424289 371 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
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CHD4Q14839 LINC01564-201ENST00000448327 566 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
CHD4Q14839 SPIN4-AS1-201ENST00000451979 426 ntTSL 2 BASIC1.57□□□□□ -2.16
CHD4Q14839 LINC01755-201ENST00000455010 453 ntTSL 2 BASIC1.57□□□□□ -2.16
CHD4Q14839 Y_RNA.653-201ENST00000459091 95 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CHD4Q14839 RNU6-1132P-201ENST00000459214 107 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CHD4Q14839 FO393415.2-201ENST00000480085 343 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CHD4Q14839 ATP1B3-AS1-201ENST00000492725 376 ntTSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
CHD4Q14839 AC097501.2-201ENST00000502668 305 ntTSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
CHD4Q14839 MRPS17P9-201ENST00000511924 393 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CHD4Q14839 AC027288.2-201ENST00000553028 243 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CHD4Q14839 MIR3126-201ENST00000577443 74 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CHD4Q14839 CYLC2-204ENST00000612124 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
CHD4Q14839 MIR373-201ENST00000362273 69 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CHD4Q14839 Y_RNA.258-201ENST00000364613 105 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CHD4Q14839 Y_RNA.474-201ENST00000384341 102 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
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