Protein–RNA interactions for Protein: Q13939

CCIN, Calicin, humanhuman

Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCINQ13939 RNU6-1299P-201ENST00000516316 100 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CCINQ13939 SNORA31.21-201ENST00000517180 77 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CCINQ13939 LINC02309-201ENST00000553679 207 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
CCINQ13939 AC133485.4-201ENST00000561835 220 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CCINQ13939 AC138907.4-201ENST00000570107 226 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CCINQ13939 AC138915.1-201ENST00000565427 1685 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CCINQ13939 WDR49-201ENST00000308378 2594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
CCINQ13939 EVI5-208ENST00000540033 7436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
CCINQ13939 SULT1B1-201ENST00000310613 7115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
CCINQ13939 CFAP44-202ENST00000393845 7069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
CCINQ13939 MMS22L-202ENST00000369251 3949 ntTSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
CCINQ13939 RNU6-147P-201ENST00000383983 107 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CCINQ13939 RNU6-975P-201ENST00000384296 105 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CCINQ13939 RNU6ATAC10P-201ENST00000408635 111 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CCINQ13939 RNU6-57P-201ENST00000411348 103 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CCINQ13939 MLLT10P1-201ENST00000418346 262 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CCINQ13939 AL353705.1-201ENST00000433468 480 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CCINQ13939 AC006445.1-201ENST00000491925 405 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CCINQ13939 RNU6-1061P-201ENST00000516530 99 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CCINQ13939 SNORA70.18-201ENST00000516696 98 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CCINQ13939 AL160236.1-201ENST00000556317 195 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CCINQ13939 AC120045.1-201ENST00000563502 251 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
CCINQ13939 AC139426.2-201ENST00000568289 251 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
CCINQ13939 YPEL5P2-201ENST00000605553 359 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CCINQ13939 5S_rRNA.13-201ENST00000622298 123 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CCINQ13939 C5orf51-201ENST00000381647 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
CCINQ13939 ZNF439-201ENST00000304030 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
CCINQ13939 STEAP4-202ENST00000380079 9988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
CCINQ13939 AC018555.1-201ENST00000567548 1980 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CCINQ13939 DST-201ENST00000244364 16742 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
CCINQ13939 KIAA0586-215ENST00000619722 5597 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CCINQ13939 PIK3C2G-203ENST00000535651 2497 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CCINQ13939 RNF6-201ENST00000346166 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
CCINQ13939 ZNF732-201ENST00000419098 2193 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CCINQ13939 GLCE-202ENST00000559420 4840 ntTSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
CCINQ13939 ERBIN-212ENST00000508515 4374 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CCINQ13939 ERBIN-214ENST00000511297 4257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CCINQ13939 MIR423-201ENST00000362201 94 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CCINQ13939 Y_RNA.114-201ENST00000363265 113 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CCINQ13939 MIR181A2-201ENST00000384863 110 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CCINQ13939 SNORA48.2-201ENST00000390926 124 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CCINQ13939 MIR1294-201ENST00000408503 142 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CCINQ13939 RNA5SP511-201ENST00000410487 115 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CCINQ13939 Y_RNA.630-201ENST00000411370 108 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CCINQ13939 AC016717.1-201ENST00000448918 286 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CCINQ13939 RPL21P10-201ENST00000463521 490 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CCINQ13939 RNU2-27P-201ENST00000516185 142 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CCINQ13939 SNORD33.1-201ENST00000516213 88 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CCINQ13939 AC008011.1-201ENST00000545989 227 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CCINQ13939 AC007598.2-201ENST00000569490 539 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CCINQ13939 MIR3186-201ENST00000577404 85 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CCINQ13939 FIGNL1-203ENST00000419119 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
CCINQ13939 RTN4-208ENST00000404909 4102 ntTSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
CCINQ13939 MUC19-205ENST00000454784 24775 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CCINQ13939 HEATR5B-201ENST00000233099 6905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
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CCINQ13939 AGTR1-204ENST00000418473 2071 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
CCINQ13939 XIRP2-204ENST00000409273 12269 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
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CCINQ13939 AC131055.1-201ENST00000584626 316 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
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CCINQ13939 CEP170P1-201ENST00000502249 4587 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CCINQ13939 PLOD2-204ENST00000461497 3043 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
CCINQ13939 BAZ2B-202ENST00000343439 2364 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
CCINQ13939 MGA-211ENST00000570161 11859 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
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CCINQ13939 WNK3-205ENST00000620763 5400 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CCINQ13939 RNU4-35P-201ENST00000362588 141 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CCINQ13939 HMGN2P8-201ENST00000391458 268 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
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CCINQ13939 MIR4679-1-201ENST00000637619 75 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CCINQ13939 RBMS2-209ENST00000639027 192 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CCINQ13939 FZD3-201ENST00000240093 13736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
CCINQ13939 KIAA1107-203ENST00000637221 4337 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
CCINQ13939 AC108866.1-201ENST00000503073 2339 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CCINQ13939 RNF17-201ENST00000255324 5119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CCINQ13939 ZBTB37-201ENST00000367701 19128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
CCINQ13939 LTN1-207ENST00000614971 7756 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
CCINQ13939 FOXP2-224ENST00000635534 4290 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CCINQ13939 DBIP2-201ENST00000419076 262 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CCINQ13939 AL513185.1-201ENST00000431638 162 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CCINQ13939 ATP5EP1-201ENST00000510257 156 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CCINQ13939 AC109329.2-201ENST00000519658 482 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CCINQ13939 AC103810.1-201ENST00000579873 453 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CCINQ13939 AL929325.1-201ENST00000603096 117 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CCINQ13939 ZNF483-201ENST00000309235 3655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
CCINQ13939 SYNE1-207ENST00000367255 27748 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
CCINQ13939 C6orf10-204ENST00000447241 2148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CCINQ13939 SLC39A10-202ENST00000409086 5432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
CCINQ13939 IDE-202ENST00000371581 4480 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
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