Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 DEFB135-201ENST00000382208 234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-1□□□□□ -2.57
SPTAN1Q13813 MIR516B1-201ENST00000385211 90 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
SPTAN1Q13813 CALM2P2-201ENST00000428512 440 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
SPTAN1Q13813 MTND4P15-201ENST00000437913 1033 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
SPTAN1Q13813 AC004994.1-201ENST00000447057 313 ntTSL 3 BASIC-1□□□□□ -2.57
SPTAN1Q13813 SUMO2P18-201ENST00000518873 252 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
SPTAN1Q13813 AL162424.1-201ENST00000602325 221 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
SPTAN1Q13813 FRG1KP-201ENST00000623592 341 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
SPTAN1Q13813 AC093726.3-201ENST00000637588 150 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
SPTAN1Q13813 MIR517B-201ENST00000385102 67 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
SPTAN1Q13813 AL354692.1-201ENST00000423044 315 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
SPTAN1Q13813 HSPE1P23-201ENST00000509838 286 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
SPTAN1Q13813 AC021146.6-201ENST00000514659 117 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
SPTAN1Q13813 RNA5SP169-201ENST00000517268 117 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
SPTAN1Q13813 NARSP2-202ENST00000522022 349 ntTSL 3 BASIC-1.01□□□□□ -2.57
SPTAN1Q13813 AC084368.1-201ENST00000620935 65 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
SPTAN1Q13813 GLMN-201ENST00000370360 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-1.01□□□□□ -2.57
SPTAN1Q13813 RNU6-228P-201ENST00000362700 106 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
SPTAN1Q13813 Y_RNA.145-201ENST00000363527 102 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
SPTAN1Q13813 RNU6-1141P-201ENST00000364520 107 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
SPTAN1Q13813 RNA5SP95-201ENST00000410319 137 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
SPTAN1Q13813 LINC01707-201ENST00000425517 627 ntTSL 3 BASIC-1.01□□□□□ -2.57
SPTAN1Q13813 AL365184.2-201ENST00000431139 435 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
SPTAN1Q13813 AC097462.1-201ENST00000514125 324 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
SPTAN1Q13813 RNU2-53P-201ENST00000516257 147 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
SPTAN1Q13813 MIR3179-1-201ENST00000578940 84 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
SPTAN1Q13813 MIR3179-2-201ENST00000579107 84 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
SPTAN1Q13813 MIR3179-3-201ENST00000579566 84 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
SPTAN1Q13813 MIR3179-4-201ENST00000617599 84 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
SPTAN1Q13813 DLG2-AS1_1.1-201ENST00000622319 213 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
SPTAN1Q13813 Y_RNA.125-201ENST00000363371 111 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
SPTAN1Q13813 Y_RNA.283-201ENST00000364798 112 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
SPTAN1Q13813 SNORA12-201ENST00000391162 147 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
SPTAN1Q13813 MIR8485-201ENST00000401372 91 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
SPTAN1Q13813 TRIM60P10Y-201ENST00000425589 751 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
SPTAN1Q13813 LARP1BP3-201ENST00000437229 869 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
SPTAN1Q13813 AC104073.1-201ENST00000451988 151 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
SPTAN1Q13813 ART2BP-201ENST00000453501 499 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
SPTAN1Q13813 SNORA13-201ENST00000458790 133 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
SPTAN1Q13813 AC004930.1-201ENST00000470677 254 ntTSL 2 BASIC-1.02□□□□□ -2.57
SPTAN1Q13813 AC068993.2-201ENST00000546563 395 ntTSL 5 BASIC-1.02□□□□□ -2.57
SPTAN1Q13813 MIR6514-201ENST00000622549 70 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
SPTAN1Q13813 RNU5A-6P-201ENST00000384136 116 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
SPTAN1Q13813 RNU2-23P-201ENST00000410545 195 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
SPTAN1Q13813 BTBD7P2-201ENST00000441962 620 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
SPTAN1Q13813 PCNPP5-201ENST00000452246 481 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
SPTAN1Q13813 AP000870.1-201ENST00000472927 406 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
SPTAN1Q13813 MTCO3P15-201ENST00000526563 574 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
SPTAN1Q13813 SNORA81-201ENST00000408493 178 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
SPTAN1Q13813 RNU6-613P-201ENST00000410412 108 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
SPTAN1Q13813 AC007000.2-201ENST00000442564 487 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
SPTAN1Q13813 AL354949.1-201ENST00000446438 170 ntTSL 2 BASIC-1.03□□□□□ -2.57
SPTAN1Q13813 AL392103.1-201ENST00000447000 198 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
SPTAN1Q13813 AC113347.3-201ENST00000509113 148 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
SPTAN1Q13813 AC018448.1-201ENST00000552843 316 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
SPTAN1Q13813 MIR3192-201ENST00000584920 77 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
SPTAN1Q13813 AL117336.2-201ENST00000602435 335 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
SPTAN1Q13813 MIR6507-201ENST00000613630 70 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
SPTAN1Q13813 TTK-211ENST00000627129 240 ntTSL 5 BASIC-1.03□□□□□ -2.57
SPTAN1Q13813 RNU6-1094P-201ENST00000362416 104 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
SPTAN1Q13813 Y_RNA.225-201ENST00000364326 97 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
SPTAN1Q13813 Y_RNA.263-201ENST00000364659 114 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
SPTAN1Q13813 Y_RNA.426-201ENST00000384068 113 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
SPTAN1Q13813 RNU6-441P-201ENST00000384545 106 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
SPTAN1Q13813 MIR204-201ENST00000385200 110 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
SPTAN1Q13813 RNU6-721P-201ENST00000410155 105 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
SPTAN1Q13813 RNU6-1133P-201ENST00000410963 100 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
SPTAN1Q13813 MCFD2P1-201ENST00000417812 300 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
SPTAN1Q13813 AL451054.2-201ENST00000420896 202 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
SPTAN1Q13813 USP9YP16-201ENST00000430287 407 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
SPTAN1Q13813 MTND2P7-201ENST00000521337 640 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
SPTAN1Q13813 MRPS36P5-201ENST00000551909 298 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
SPTAN1Q13813 AC135803.1-201ENST00000608748 565 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
SPTAN1Q13813 AL159972.1-201ENST00000625150 448 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
SPTAN1Q13813 RNU6-502P-201ENST00000362419 108 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
SPTAN1Q13813 SNORD114-19-201ENST00000363072 75 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
SPTAN1Q13813 AC016831.2-201ENST00000417179 352 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
SPTAN1Q13813 AHI1-208ENST00000488690 712 ntTSL 5 BASIC-1.04□□□□□ -2.58
SPTAN1Q13813 AC105417.1-201ENST00000514691 285 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
SPTAN1Q13813 AC091135.1-201ENST00000585943 307 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
SPTAN1Q13813 AL353803.5-201ENST00000599815 141 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
SPTAN1Q13813 AC022217.4-201ENST00000604389 163 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
SPTAN1Q13813 AL442067.1-201ENST00000613261 223 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
SPTAN1Q13813 E2F5-208ENST00000521429 1551 ntTSL 5 BASIC-1.04□□□□□ -2.58
SPTAN1Q13813 U8.6-201ENST00000364939 135 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
SPTAN1Q13813 Y_RNA.494-201ENST00000384432 111 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
SPTAN1Q13813 SNORA12.2-201ENST00000391040 156 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
SPTAN1Q13813 AC009299.3-201ENST00000421122 1072 ntTSL 3 BASIC-1.05□□□□□ -2.58
SPTAN1Q13813 AL157387.1-201ENST00000436077 335 ntTSL 2 BASIC-1.05□□□□□ -2.58
SPTAN1Q13813 AL606517.2-201ENST00000442855 241 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
SPTAN1Q13813 AC023512.1-201ENST00000444513 499 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
SPTAN1Q13813 RPL23AP75-201ENST00000491601 451 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
SPTAN1Q13813 RNU6-488P-201ENST00000515918 99 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
SPTAN1Q13813 RNU6-479P-201ENST00000516348 105 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
SPTAN1Q13813 LINC01609-201ENST00000519506 424 ntTSL 3 BASIC-1.05□□□□□ -2.58
SPTAN1Q13813 MIR3139-201ENST00000579145 76 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
SPTAN1Q13813 MIR4280-201ENST00000582178 76 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
SPTAN1Q13813 VTRNA2-1-201ENST00000602301 127 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
SPTAN1Q13813 AL390123.1-201ENST00000603216 237 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
SPTAN1Q13813 AL355598.1-201ENST00000604169 202 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
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