Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 MTCYBP10-201ENST00000424905 650 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
ALCAMQ13740 AL353997.1-201ENST00000432936 108 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
ALCAMQ13740 RPL23AP50-201ENST00000434149 455 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
ALCAMQ13740 AC112492.4-201ENST00000456549 352 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
ALCAMQ13740 SPAG11B-206ENST00000458665 444 ntTSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
ALCAMQ13740 Y_RNA.635-201ENST00000459041 101 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
ALCAMQ13740 ATP1B3-AS1-201ENST00000492725 376 ntTSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
ALCAMQ13740 LINC02276-201ENST00000508388 138 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
ALCAMQ13740 SNORA44.1-201ENST00000517031 108 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
ALCAMQ13740 CBX3P4-201ENST00000538909 354 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
ALCAMQ13740 TRAV1-1-201ENST00000542354 392 ntAPPRIS P1 BASIC1.81□□□□□ -2.12
ALCAMQ13740 AC010999.1-201ENST00000611856 324 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
ALCAMQ13740 MIR338-201ENST00000636369 67 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
ALCAMQ13740 TPTEP1-208ENST00000636884 213 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
ALCAMQ13740 AC099654.14-201ENST00000638599 341 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
ALCAMQ13740 RNU6-661P-201ENST00000362409 107 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
ALCAMQ13740 RNU6-222P-201ENST00000362438 107 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
ALCAMQ13740 SNORD81.2-201ENST00000365153 76 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
ALCAMQ13740 Y_RNA.415-201ENST00000384012 112 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
ALCAMQ13740 MIR548B-201ENST00000385247 97 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
ALCAMQ13740 SNORA75.4-201ENST00000391278 119 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
ALCAMQ13740 RNU1-139P-201ENST00000391307 165 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
ALCAMQ13740 AL592431.2-201ENST00000422198 171 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
ALCAMQ13740 AC121342.1-201ENST00000423914 550 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
ALCAMQ13740 HMGN2P34-201ENST00000437647 269 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
ALCAMQ13740 AC098614.3-201ENST00000438957 440 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
ALCAMQ13740 RBMX2P4-201ENST00000441256 376 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
ALCAMQ13740 NDUFB4P10-201ENST00000452541 359 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
ALCAMQ13740 RNU6-221P-201ENST00000459541 99 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
ALCAMQ13740 HMGN1P13-201ENST00000505795 138 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
ALCAMQ13740 AC096711.2-201ENST00000510592 454 ntTSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
ALCAMQ13740 AC093303.1-201ENST00000514549 295 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
ALCAMQ13740 AC092490.2-202ENST00000544922 462 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
ALCAMQ13740 AC112481.1-201ENST00000549669 901 ntTSL 2 BASIC1.8□□□□□ -2.12
ALCAMQ13740 MTND5P16-201ENST00000460269 1703 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
ALCAMQ13740 PTPN22-206ENST00000525799 2118 ntTSL 1 (best) BASIC1.79□□□□□ -2.12
ALCAMQ13740 Y_RNA.404-201ENST00000383978 102 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
ALCAMQ13740 RNU6-296P-201ENST00000384608 107 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
ALCAMQ13740 RNU6-331P-201ENST00000384724 107 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
ALCAMQ13740 MIR504-201ENST00000385065 83 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
ALCAMQ13740 RN7SKP101-201ENST00000411376 320 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
ALCAMQ13740 AL356010.2-201ENST00000422844 197 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
ALCAMQ13740 AC035139.1-201ENST00000423256 273 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
ALCAMQ13740 AC245047.4-201ENST00000433189 144 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
ALCAMQ13740 AC069257.2-201ENST00000441819 155 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
ALCAMQ13740 Z68323.1-201ENST00000450365 519 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
ALCAMQ13740 RNU7-87P-201ENST00000459343 62 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
ALCAMQ13740 AC025647.1-201ENST00000517879 253 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
ALCAMQ13740 AC105029.1-201ENST00000520250 669 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
ALCAMQ13740 AC007450.1-201ENST00000536492 188 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
ALCAMQ13740 AC084364.2-201ENST00000546924 395 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
ALCAMQ13740 AC090617.3-201ENST00000573670 475 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
ALCAMQ13740 MIR3122-201ENST00000577243 73 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
ALCAMQ13740 MIR8081-201ENST00000611533 95 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
ALCAMQ13740 SNORA72.2-201ENST00000365028 127 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
ALCAMQ13740 RNU6-1240P-201ENST00000365155 104 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
ALCAMQ13740 Y_RNA.364-201ENST00000365532 101 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
ALCAMQ13740 RNU6-281P-201ENST00000384212 103 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
ALCAMQ13740 MIR515-2-201ENST00000384883 83 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
ALCAMQ13740 MIR515-1-201ENST00000384884 83 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
ALCAMQ13740 AC138393.2-201ENST00000414742 246 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
ALCAMQ13740 CYCSP49-201ENST00000420810 319 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
ALCAMQ13740 AC116666.1-201ENST00000453915 551 ntTSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.12
ALCAMQ13740 MTND4P17-201ENST00000470444 350 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
ALCAMQ13740 RPL36AP21-201ENST00000490372 323 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
ALCAMQ13740 Y_RNA.683-201ENST00000516508 93 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
ALCAMQ13740 SCARNA16.2-201ENST00000516520 172 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
ALCAMQ13740 SNORA20.3-201ENST00000516880 132 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
ALCAMQ13740 AC093023.1-201ENST00000547375 507 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
ALCAMQ13740 AC090510.1-201ENST00000567456 425 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
ALCAMQ13740 hsa-mir-3119-1.1-201ENST00000577602 85 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
ALCAMQ13740 MZT1P2-201ENST00000604387 248 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
ALCAMQ13740 AL669831.3-213ENST00000636676 183 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
ALCAMQ13740 MTND5P35-201ENST00000557537 1720 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
ALCAMQ13740 AC007370.2-201ENST00000506899 2694 ntTSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
ALCAMQ13740 RNU6-417P-201ENST00000384712 107 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
ALCAMQ13740 MIR30A-201ENST00000385092 71 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
ALCAMQ13740 MIR1185-2-201ENST00000408687 86 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
ALCAMQ13740 HMGB3P17-201ENST00000504195 649 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
ALCAMQ13740 TMEM132D-AS1-202ENST00000510001 293 ntTSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
ALCAMQ13740 AC108037.1-201ENST00000514103 423 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
ALCAMQ13740 RNU6-548P-201ENST00000517083 115 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
ALCAMQ13740 AC016727.1-205ENST00000605437 569 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
ALCAMQ13740 AC092794.2-201ENST00000620933 563 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
ALCAMQ13740 PLD1-217ENST00000627725 174 ntTSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
ALCAMQ13740 XRCC4-202ENST00000338635 1579 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC1.76□□□□□ -2.13
ALCAMQ13740 RNU6-1266P-201ENST00000362794 105 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
ALCAMQ13740 RNU6-439P-201ENST00000384188 106 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
ALCAMQ13740 TRAJ39-201ENST00000390498 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.76□□□□□ -2.13
ALCAMQ13740 AC016909.1-201ENST00000415916 166 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
ALCAMQ13740 AC092423.1-201ENST00000430165 186 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
ALCAMQ13740 UBE2V1P7-201ENST00000446395 340 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
ALCAMQ13740 HMGN1P12-201ENST00000499125 195 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
ALCAMQ13740 AC025465.3-201ENST00000510570 311 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
ALCAMQ13740 AC110009.1-201ENST00000512965 451 ntTSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
ALCAMQ13740 AC096721.1-201ENST00000513540 552 ntTSL 4 BASIC1.76□□□□□ -2.13
ALCAMQ13740 RNA5SP481-201ENST00000516814 122 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
ALCAMQ13740 AK6P2-201ENST00000549020 471 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
ALCAMQ13740 AC079907.1-201ENST00000552707 374 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
ALCAMQ13740 AC004584.2-201ENST00000570407 410 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
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