Protein–RNA interactions for Protein: Q13421

MSLN, Mesothelin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSLNQ13421 AC243428.1-201ENST00000421099 264 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
MSLNQ13421 AC098614.3-201ENST00000438957 440 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
MSLNQ13421 snoU13.23-201ENST00000458863 104 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
MSLNQ13421 RNU7-57P-201ENST00000459540 60 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
MSLNQ13421 MTND4P17-201ENST00000470444 350 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
MSLNQ13421 AC010409.1-201ENST00000487382 476 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
MSLNQ13421 Y_RNA.706-201ENST00000516933 99 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
MSLNQ13421 RNU1-117P-201ENST00000517041 158 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
MSLNQ13421 AC112481.1-201ENST00000549669 901 ntTSL 2 BASIC1.58□□□□□ -2.16
MSLNQ13421 AC022035.1-201ENST00000579923 302 ntTSL 2 BASIC1.58□□□□□ -2.16
MSLNQ13421 AC103810.8-201ENST00000607347 118 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
MSLNQ13421 MIR8074-201ENST00000615081 81 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
MSLNQ13421 TPTEP1-208ENST00000636884 213 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
MSLNQ13421 SEMG2-201ENST00000372769 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
MSLNQ13421 AC006026.1-201ENST00000444025 1803 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
MSLNQ13421 PTPN22-206ENST00000525799 2118 ntTSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
MSLNQ13421 Y_RNA.2-201ENST00000362330 96 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
MSLNQ13421 RNU6-862P-201ENST00000362804 105 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
MSLNQ13421 RNU6-112P-201ENST00000363599 104 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
MSLNQ13421 RNU6-439P-201ENST00000384188 106 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
MSLNQ13421 RNU6-17P-201ENST00000384245 107 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
MSLNQ13421 RNU6-18P-201ENST00000384527 107 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
MSLNQ13421 MIR764-201ENST00000390811 85 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
MSLNQ13421 Y_RNA.594-201ENST00000410373 140 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
MSLNQ13421 RNU6-1050P-201ENST00000410388 107 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
MSLNQ13421 AC004866.1-201ENST00000411748 78 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
MSLNQ13421 HSPE1P24-201ENST00000450782 238 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
MSLNQ13421 HMGN2P23-201ENST00000456759 269 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
MSLNQ13421 Y_RNA.670-201ENST00000516255 105 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
MSLNQ13421 Y_RNA.708-201ENST00000516950 96 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
MSLNQ13421 RNU6-58P-201ENST00000517143 103 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
MSLNQ13421 AC023200.1-201ENST00000519660 651 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
MSLNQ13421 IGLVVI-22-1-201ENST00000521183 211 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
MSLNQ13421 AC104984.5-201ENST00000586878 94 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
MSLNQ13421 AC100812.1-201ENST00000607622 580 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
MSLNQ13421 MIR6715A-201ENST00000615929 79 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
MSLNQ13421 Six3os1_7.1-201ENST00000621512 201 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
MSLNQ13421 snoZ196.1-201ENST00000625269 89 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
MSLNQ13421 AC068205.3-201ENST00000636385 468 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
MSLNQ13421 HIF1A-212ENST00000557538 3468 ntTSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
MSLNQ13421 AC010615.1-201ENST00000594254 1764 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
MSLNQ13421 ZNF404-202ENST00000587539 1851 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
MSLNQ13421 DEUP1-202ENST00000525646 1920 ntTSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
MSLNQ13421 Y_RNA.48-201ENST00000362710 103 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
MSLNQ13421 RNU6-1266P-201ENST00000362794 105 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
MSLNQ13421 snoU2-30.2-201ENST00000362805 70 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
MSLNQ13421 SNORA72.1-201ENST00000363485 129 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
MSLNQ13421 RNU6-595P-201ENST00000363944 107 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
MSLNQ13421 RNA5SP190-201ENST00000365222 118 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
MSLNQ13421 Y_RNA.474-201ENST00000384341 102 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
MSLNQ13421 Y_RNA.482-201ENST00000384377 111 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
MSLNQ13421 MIR320A-201ENST00000385302 82 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
MSLNQ13421 RNU6-57P-201ENST00000411348 103 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
MSLNQ13421 AC016717.1-201ENST00000448918 286 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
MSLNQ13421 AC009468.2-201ENST00000457372 366 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
MSLNQ13421 AC108752.1-201ENST00000484679 576 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
MSLNQ13421 RPL30P10-201ENST00000488148 337 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
MSLNQ13421 ATP1B3-AS1-201ENST00000492725 376 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
MSLNQ13421 AC007991.3-201ENST00000517623 502 ntTSL 4 BASIC1.56□□□□□ -2.16
MSLNQ13421 AC005730.3-201ENST00000583067 366 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
MSLNQ13421 WT1-AS_8.1-201ENST00000615200 275 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
MSLNQ13421 PISRT1.1-201ENST00000616930 107 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
MSLNQ13421 FANCD2-213ENST00000625535 117 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
MSLNQ13421 AC099654.5-201ENST00000636479 350 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
MSLNQ13421 RBMS2-209ENST00000639027 192 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
MSLNQ13421 XRCC4-202ENST00000338635 1579 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC1.55□□□□□ -2.16
MSLNQ13421 BRCA1-202ENST00000354071 4497 ntTSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
MSLNQ13421 MIR126-201ENST00000362291 85 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
MSLNQ13421 RNY3P14-201ENST00000384309 102 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
MSLNQ13421 TRAJ39-201ENST00000390498 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.55□□□□□ -2.16
MSLNQ13421 MIR1323-201ENST00000408090 73 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
MSLNQ13421 HMGN2P34-201ENST00000437647 269 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
MSLNQ13421 MTND3P10-201ENST00000450967 341 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
MSLNQ13421 NDUFB4P10-201ENST00000452541 359 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
MSLNQ13421 SNORD13-201ENST00000459299 104 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
MSLNQ13421 AC108210.2-201ENST00000503681 201 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
MSLNQ13421 SRP72-202ENST00000504757 745 ntTSL 2 BASIC1.55□□□□□ -2.16
MSLNQ13421 RNU6-307P-201ENST00000516743 106 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
MSLNQ13421 CBX3P8-201ENST00000532412 525 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
MSLNQ13421 AC027288.2-201ENST00000553028 243 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
MSLNQ13421 hsa-mir-3119-1.1-201ENST00000577602 85 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
MSLNQ13421 AC009229.3-201ENST00000608056 282 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
MSLNQ13421 Hammerhead_HH9.1-201ENST00000616606 77 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
MSLNQ13421 PLD1-217ENST00000627725 174 ntTSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
MSLNQ13421 MTND4P12-201ENST00000498999 1377 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
MSLNQ13421 RNU6-873P-201ENST00000363833 107 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
MSLNQ13421 RNU4-13P-201ENST00000364019 141 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
MSLNQ13421 Y_RNA.404-201ENST00000383978 102 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
MSLNQ13421 Y_RNA.405-201ENST00000383979 100 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
MSLNQ13421 Y_RNA.451-201ENST00000384200 100 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
MSLNQ13421 RNU6-793P-201ENST00000384233 104 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
MSLNQ13421 Y_RNA.524-201ENST00000384564 100 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
MSLNQ13421 Y_RNA.561-201ENST00000384694 100 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
MSLNQ13421 RNU6-360P-201ENST00000390944 104 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
MSLNQ13421 RNU6-700P-201ENST00000391043 107 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
MSLNQ13421 MIR1267-201ENST00000408723 78 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
MSLNQ13421 AC060773.1-201ENST00000421698 310 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
MSLNQ13421 AL445305.1-201ENST00000432577 575 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
MSLNQ13421 AC099677.2-201ENST00000436385 175 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
MSLNQ13421 Y_RNA.635-201ENST00000459041 101 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
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