Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 ZNF415-207ENST00000595193 2479 ntTSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
TRIM28Q13263 PCDH15-234ENST00000622048 6820 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
TRIM28Q13263 AC091152.2-201ENST00000591628 2569 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
TRIM28Q13263 IDE-202ENST00000371581 4480 ntTSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
TRIM28Q13263 ARHGAP28-202ENST00000314319 5415 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
TRIM28Q13263 OR51A7-202ENST00000641490 2186 ntAPPRIS P1 BASIC3.9□□□□□ -1.78
TRIM28Q13263 TDRD15-201ENST00000405799 6135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.78
TRIM28Q13263 AC007496.3-201ENST00000624987 3443 ntBASIC3.9□□□□□ -1.78
TRIM28Q13263 CYSLTR2-201ENST00000282018 4672 ntAPPRIS P1 BASIC3.9□□□□□ -1.79
TRIM28Q13263 RNU6-880P-201ENST00000384526 107 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
TRIM28Q13263 RNU6-19P-201ENST00000384718 107 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
TRIM28Q13263 SNORA26.2-201ENST00000390922 122 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
TRIM28Q13263 U6atac.2-201ENST00000408644 118 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
TRIM28Q13263 RPL37P4-201ENST00000448908 268 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
TRIM28Q13263 RN7SL330P-201ENST00000469709 307 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
TRIM28Q13263 RPS26P45-201ENST00000471748 340 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
TRIM28Q13263 AC024270.4-201ENST00000570202 421 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
TRIM28Q13263 RPL30P11-203ENST00000598995 310 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
TRIM28Q13263 AC025754.2-201ENST00000606491 432 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
TRIM28Q13263 PRKACB-217ENST00000610457 4206 ntTSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.79
TRIM28Q13263 PRKACB-218ENST00000610703 4240 ntTSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.79
TRIM28Q13263 NCOA1-203ENST00000395856 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
TRIM28Q13263 GYPA-201ENST00000324022 751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
TRIM28Q13263 RNU6-640P-201ENST00000363693 105 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
TRIM28Q13263 SNORA71.1-201ENST00000364523 117 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
TRIM28Q13263 RNU6-294P-201ENST00000364999 102 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
TRIM28Q13263 Y_RNA.348-201ENST00000365403 103 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
TRIM28Q13263 AP002088.1-201ENST00000382740 395 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
TRIM28Q13263 RNU6-1197P-201ENST00000391183 107 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
TRIM28Q13263 SNORA36B-201ENST00000410438 131 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
TRIM28Q13263 Y_RNA.649-201ENST00000459077 103 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
TRIM28Q13263 AC010401.1-201ENST00000463867 348 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
TRIM28Q13263 RPS29P20-201ENST00000489592 171 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
TRIM28Q13263 RPS27AP10-201ENST00000496103 208 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
TRIM28Q13263 AIG1P1-201ENST00000503376 148 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
TRIM28Q13263 RNU5F-2P-201ENST00000516066 82 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
TRIM28Q13263 RNU1-117P-201ENST00000517041 158 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
TRIM28Q13263 RNU6-762P-201ENST00000517107 102 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
TRIM28Q13263 SCARNA20.6-201ENST00000517251 106 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
TRIM28Q13263 AC068205.3-201ENST00000636385 468 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
TRIM28Q13263 C1orf141-205ENST00000475209 2079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
TRIM28Q13263 KTN1-206ENST00000413890 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
TRIM28Q13263 LRRC49-224ENST00000560691 2531 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
TRIM28Q13263 SLAIN1-203ENST00000351546 2394 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
TRIM28Q13263 OR4M1-202ENST00000641200 3493 ntAPPRIS P1 BASIC3.89□□□□□ -1.79
TRIM28Q13263 PDE1A-205ENST00000435564 4885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
TRIM28Q13263 PLAG1-201ENST00000316981 7322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
TRIM28Q13263 FIGNL1-202ENST00000395556 3485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
TRIM28Q13263 UBA5-201ENST00000264991 2850 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
TRIM28Q13263 RNA5SP295-201ENST00000362655 121 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
TRIM28Q13263 SNORD114-19-201ENST00000363072 75 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
TRIM28Q13263 RNU6-978P-201ENST00000364371 103 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
TRIM28Q13263 MIR607-201ENST00000385241 96 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
TRIM28Q13263 MIRLET7F2-201ENST00000385277 83 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
TRIM28Q13263 EI24P2-201ENST00000397776 1076 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
TRIM28Q13263 AC099548.1-201ENST00000421443 426 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
TRIM28Q13263 HSPE1P21-201ENST00000438283 308 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
TRIM28Q13263 SNORA59A-201ENST00000459326 152 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
TRIM28Q13263 RNU7-115P-201ENST00000516433 55 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
TRIM28Q13263 RNU6-344P-201ENST00000516635 111 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
TRIM28Q13263 RNU6-1282P-201ENST00000516735 96 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
TRIM28Q13263 AC016597.1-201ENST00000564893 528 ntTSL 4 BASIC3.88□□□□□ -1.79
TRIM28Q13263 MIR3923-201ENST00000579521 83 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
TRIM28Q13263 SNORD11B-201ENST00000607707 90 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
TRIM28Q13263 XIST_intron.1-201ENST00000619444 68 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
TRIM28Q13263 LINC01068-202ENST00000620874 626 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
TRIM28Q13263 AL596211.1-201ENST00000569873 2277 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
TRIM28Q13263 MYOT-201ENST00000239926 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
TRIM28Q13263 ZNF479-202ENST00000331162 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
TRIM28Q13263 RNU6-309P-201ENST00000364573 106 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
TRIM28Q13263 Y_RNA.510-201ENST00000384511 114 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
TRIM28Q13263 AC027124.2-201ENST00000428249 105 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
TRIM28Q13263 AC020594.1-201ENST00000437680 338 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
TRIM28Q13263 RPS12P18-201ENST00000442381 270 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
TRIM28Q13263 AC012668.1-201ENST00000457625 228 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
TRIM28Q13263 APOA2-205ENST00000468465 421 ntTSL 2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
TRIM28Q13263 RN7SKP19-201ENST00000516016 252 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
TRIM28Q13263 RNU4ATAC3P-201ENST00000516699 126 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
TRIM28Q13263 AP003465.1-201ENST00000520575 382 ntTSL 2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
TRIM28Q13263 AC011602.1-201ENST00000546484 331 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
TRIM28Q13263 NPPA-AS1_3.1-201ENST00000617059 108 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
TRIM28Q13263 ZGRF1-212ENST00000612287 2176 ntTSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
TRIM28Q13263 KCNJ16-203ENST00000392671 3981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
TRIM28Q13263 HEATR5B-201ENST00000233099 6905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
TRIM28Q13263 FASTKD1-205ENST00000453929 2791 ntTSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
TRIM28Q13263 DENND2C-203ENST00000393277 4730 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
TRIM28Q13263 RNU1-75P-201ENST00000347264 129 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
TRIM28Q13263 MIR22-201ENST00000362190 85 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
TRIM28Q13263 SNORA7.2-201ENST00000364446 145 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
TRIM28Q13263 MIR493-201ENST00000385254 89 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
TRIM28Q13263 Y_RNA.587-201ENST00000391210 103 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
TRIM28Q13263 Z98941.1-201ENST00000407764 100 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
TRIM28Q13263 RNU6-554P-201ENST00000410466 106 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
TRIM28Q13263 FO680682.1-201ENST00000421261 345 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
TRIM28Q13263 COTL1P1-201ENST00000422309 375 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
TRIM28Q13263 TSPY5P-202ENST00000456541 142 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
TRIM28Q13263 MIR5047-201ENST00000579212 100 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
TRIM28Q13263 MIR3136-201ENST00000583498 78 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
TRIM28Q13263 AC091178.2-201ENST00000584401 117 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
TRIM28Q13263 LINC01482-203ENST00000589610 468 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
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