Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 NPS-201ENST00000398023 270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
CHAF1AQ13111 MIR190B-201ENST00000401119 79 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CHAF1AQ13111 RNA5SP247-201ENST00000411181 105 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CHAF1AQ13111 AC004866.1-201ENST00000411748 78 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CHAF1AQ13111 MRPS18CP6-201ENST00000423587 223 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CHAF1AQ13111 MTND2P29-201ENST00000438595 412 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CHAF1AQ13111 AL591504.1-201ENST00000450681 414 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
CHAF1AQ13111 AC114982.1-201ENST00000469402 321 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CHAF1AQ13111 AP000870.1-201ENST00000472927 406 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CHAF1AQ13111 RPS27P21-201ENST00000486977 252 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CHAF1AQ13111 AP003072.1-201ENST00000531740 145 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CHAF1AQ13111 AC020661.2-201ENST00000560114 134 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CHAF1AQ13111 AC004584.2-201ENST00000570407 410 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CHAF1AQ13111 MIR3171-201ENST00000584270 74 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CHAF1AQ13111 MIR4448-201ENST00000584360 86 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CHAF1AQ13111 LINC02104-202ENST00000604954 599 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
CHAF1AQ13111 AC007742.2-201ENST00000618226 398 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CHAF1AQ13111 uc_338.22-201ENST00000622722 187 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CHAF1AQ13111 XRCC4-205ENST00000511817 1636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
CHAF1AQ13111 VPS13A-206ENST00000376646 2262 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
CHAF1AQ13111 Y_RNA.5-201ENST00000362334 102 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CHAF1AQ13111 RNU6-23P-201ENST00000363283 107 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CHAF1AQ13111 RNU6-873P-201ENST00000363833 107 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CHAF1AQ13111 Y_RNA.314-201ENST00000365114 102 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CHAF1AQ13111 MIR586-201ENST00000385035 97 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CHAF1AQ13111 RNU1-139P-201ENST00000391307 165 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CHAF1AQ13111 RNU6ATAC38P-201ENST00000408119 126 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CHAF1AQ13111 AC007098.1-201ENST00000420122 367 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CHAF1AQ13111 AC139712.2-201ENST00000424302 339 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CHAF1AQ13111 PLCB1-IT1-201ENST00000441231 373 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
CHAF1AQ13111 MTCO1P44-201ENST00000441935 243 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CHAF1AQ13111 AC074290.1-201ENST00000448883 135 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CHAF1AQ13111 AC025033.1-201ENST00000463883 194 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CHAF1AQ13111 AC008852.1-201ENST00000510198 451 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
CHAF1AQ13111 RNU2-34P-201ENST00000516534 121 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CHAF1AQ13111 AL157911.1-202ENST00000554123 502 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
CHAF1AQ13111 SNRPGP19-201ENST00000603826 189 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CHAF1AQ13111 SNORD11B-201ENST00000607707 90 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CHAF1AQ13111 AL807742.1-203ENST00000637444 759 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
CHAF1AQ13111 BCL2L11-225ENST00000640419 249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
CHAF1AQ13111 MIR340-201ENST00000362125 95 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CHAF1AQ13111 RNA5SP493-201ENST00000364115 91 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CHAF1AQ13111 SNORD114-6-201ENST00000364393 72 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CHAF1AQ13111 SNORA16B-201ENST00000364674 135 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CHAF1AQ13111 Y_RNA.395-201ENST00000383945 109 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CHAF1AQ13111 Y_RNA.428-201ENST00000384078 102 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CHAF1AQ13111 USP9YP16-201ENST00000430287 407 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CHAF1AQ13111 AL445305.1-201ENST00000432577 575 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CHAF1AQ13111 EHHADH-202ENST00000440662 656 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
CHAF1AQ13111 AL357134.1-201ENST00000445848 426 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CHAF1AQ13111 LINC01564-201ENST00000448327 566 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
CHAF1AQ13111 USP9YP23-201ENST00000455085 407 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CHAF1AQ13111 RPL23AP42-201ENST00000471152 471 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CHAF1AQ13111 AC067942.3-201ENST00000512025 362 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CHAF1AQ13111 LINC01337-201ENST00000515871 440 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
CHAF1AQ13111 RNU6-1114P-201ENST00000516022 107 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CHAF1AQ13111 Y_RNA.673-201ENST00000516306 88 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CHAF1AQ13111 RNU6-295P-201ENST00000516901 104 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CHAF1AQ13111 SNORD116.3-201ENST00000517176 78 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CHAF1AQ13111 MIR3169-201ENST00000578032 83 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CHAF1AQ13111 AC245748.3-201ENST00000588710 241 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
CHAF1AQ13111 AC002984.1-201ENST00000591692 448 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CHAF1AQ13111 AC006157.1-201ENST00000611750 366 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CHAF1AQ13111 AC008555.8-201ENST00000623602 2168 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CHAF1AQ13111 FSIP2-206ENST00000611759 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
CHAF1AQ13111 SCN7A-206ENST00000619410 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
CHAF1AQ13111 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
CHAF1AQ13111 XRCC4-202ENST00000338635 1579 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
CHAF1AQ13111 Y_RNA.106-201ENST00000363189 100 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CHAF1AQ13111 RNY3P11-201ENST00000364153 102 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CHAF1AQ13111 Y_RNA.364-201ENST00000365532 101 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CHAF1AQ13111 MIR10B-201ENST00000385011 110 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CHAF1AQ13111 TRAJ49-201ENST00000390488 56 ntAPPRIS P1 BASIC2.46□□□□□ -2.02
CHAF1AQ13111 U8.13-201ENST00000390842 128 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CHAF1AQ13111 5S_rRNA.2-201ENST00000391293 112 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CHAF1AQ13111 RNU6-1156P-201ENST00000410365 100 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CHAF1AQ13111 AL590399.1-203ENST00000412631 256 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
CHAF1AQ13111 MTCYBP6-201ENST00000441810 138 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CHAF1AQ13111 AL137792.2-201ENST00000443484 235 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CHAF1AQ13111 LINC02540-201ENST00000455554 570 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
CHAF1AQ13111 HMGN2P23-201ENST00000456759 269 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CHAF1AQ13111 RNU7-87P-201ENST00000459343 62 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CHAF1AQ13111 RNU7-169P-201ENST00000459456 61 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CHAF1AQ13111 AC010531.2-201ENST00000465012 153 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CHAF1AQ13111 AC110009.1-201ENST00000512965 451 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
CHAF1AQ13111 RNU6-948P-201ENST00000516374 107 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CHAF1AQ13111 RN7SKP295-201ENST00000517264 153 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CHAF1AQ13111 AC103794.1-201ENST00000531763 197 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
CHAF1AQ13111 AC012435.2-201ENST00000562869 361 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
CHAF1AQ13111 SUB1P3-201ENST00000564581 315 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CHAF1AQ13111 AC090510.1-201ENST00000567456 425 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
CHAF1AQ13111 AC007485.1-201ENST00000616755 206 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CHAF1AQ13111 AL590240.4-201ENST00000616908 390 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CHAF1AQ13111 AC008873.1-201ENST00000625051 138 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CHAF1AQ13111 AC009487.4-201ENST00000624969 3585 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CHAF1AQ13111 AC092881.1-201ENST00000638218 2733 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CHAF1AQ13111 KNL1-204ENST00000527044 5404 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
CHAF1AQ13111 XIRP2-201ENST00000295237 5246 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
CHAF1AQ13111 CYLC2-204ENST00000612124 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
CHAF1AQ13111 MUC15-202ENST00000436318 3118 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
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