Protein–RNA interactions for Protein: Q12907

LMAN2, Vesicular integral-membrane protein VIP36, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN2Q12907 WWP1-201ENST00000265428 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
LMAN2Q12907 ZCCHC10-202ENST00000355372 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
LMAN2Q12907 OR51A7-202ENST00000641490 2186 ntAPPRIS P1 BASIC2.59□□□□□ -1.99
LMAN2Q12907 RNU6-626P-201ENST00000363354 107 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
LMAN2Q12907 RNA5SP393-201ENST00000363423 117 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
LMAN2Q12907 SNORD113-8-201ENST00000363497 74 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
LMAN2Q12907 RNU6-727P-201ENST00000363592 107 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
LMAN2Q12907 SNORD32B-201ENST00000364460 84 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
LMAN2Q12907 RNU6-20P-201ENST00000384106 107 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
LMAN2Q12907 MIR518C-201ENST00000384822 101 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
LMAN2Q12907 Y_RNA.581-201ENST00000391017 97 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
LMAN2Q12907 RNU2-38P-201ENST00000410856 79 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
LMAN2Q12907 RNU5A-5P-201ENST00000411054 116 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
LMAN2Q12907 AL590399.1-203ENST00000412631 256 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
LMAN2Q12907 Z98742.3-201ENST00000418637 326 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
LMAN2Q12907 RNU6-344P-201ENST00000516635 111 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
LMAN2Q12907 AP003128.1-201ENST00000531414 448 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
LMAN2Q12907 AK6P2-201ENST00000549020 471 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
LMAN2Q12907 AC112481.1-201ENST00000549669 901 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
LMAN2Q12907 PTP4A1-204ENST00000578299 135 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
LMAN2Q12907 MIR4423-201ENST00000580922 80 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
LMAN2Q12907 AC105245.1-201ENST00000581934 244 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
LMAN2Q12907 MIR5006-201ENST00000583027 110 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
LMAN2Q12907 MIR4658-201ENST00000584344 65 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
LMAN2Q12907 MYSM1-208ENST00000622766 6020 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
LMAN2Q12907 SACS-201ENST00000382292 15324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
LMAN2Q12907 RTL4-201ENST00000340433 2613 ntAPPRIS P1 BASIC2.58□□□□□ -2
LMAN2Q12907 AGL-204ENST00000370161 6923 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
LMAN2Q12907 CCSAP-202ENST00000366686 4399 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
LMAN2Q12907 Y_RNA.14-201ENST00000362415 103 ntBASIC2.58□□□□□ -2
LMAN2Q12907 SNORD81.1-201ENST00000363064 77 ntBASIC2.58□□□□□ -2
LMAN2Q12907 Y_RNA.230-201ENST00000364348 109 ntBASIC2.58□□□□□ -2
LMAN2Q12907 Y_RNA.350-201ENST00000365409 98 ntBASIC2.58□□□□□ -2
LMAN2Q12907 Y_RNA.476-201ENST00000384347 108 ntBASIC2.58□□□□□ -2
LMAN2Q12907 Y_RNA.597-201ENST00000410463 100 ntBASIC2.58□□□□□ -2
LMAN2Q12907 Y_RNA.602-201ENST00000410535 92 ntBASIC2.58□□□□□ -2
LMAN2Q12907 AC009237.7-201ENST00000447357 229 ntBASIC2.58□□□□□ -2
LMAN2Q12907 RNU6-625P-201ENST00000459412 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
LMAN2Q12907 RN7SL297P-201ENST00000483161 293 ntBASIC2.58□□□□□ -2
LMAN2Q12907 RNU2-44P-201ENST00000516795 194 ntBASIC2.58□□□□□ -2
LMAN2Q12907 MDM2-232ENST00000544561 213 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
LMAN2Q12907 NKAIN2-205ENST00000546092 148 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
LMAN2Q12907 AC018448.1-201ENST00000552843 316 ntBASIC2.58□□□□□ -2
LMAN2Q12907 CR936218.1-201ENST00000570454 304 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
LMAN2Q12907 MIR4648-201ENST00000580107 72 ntBASIC2.58□□□□□ -2
LMAN2Q12907 RPL17P51-201ENST00000605218 238 ntBASIC2.58□□□□□ -2
LMAN2Q12907 AP001282.2-201ENST00000616149 309 ntBASIC2.58□□□□□ -2
LMAN2Q12907 WARS-244ENST00000627608 123 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
LMAN2Q12907 hsa-mir-548d-1.1-201ENST00000636914 97 ntBASIC2.58□□□□□ -2
LMAN2Q12907 AL807742.1-203ENST00000637444 759 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
LMAN2Q12907 EYS-202ENST00000342421 2168 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
LMAN2Q12907 MCF2-204ENST00000414978 3813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
LMAN2Q12907 CEP70-211ENST00000484888 1993 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
LMAN2Q12907 AASDH-207ENST00000513376 3241 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
LMAN2Q12907 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
LMAN2Q12907 Y_RNA.447-201ENST00000384184 113 ntBASIC2.57□□□□□ -2
LMAN2Q12907 RNU6-1274P-201ENST00000384557 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
LMAN2Q12907 Y_RNA.570-201ENST00000384750 101 ntBASIC2.57□□□□□ -2
LMAN2Q12907 AL033519.2-201ENST00000403958 392 ntBASIC2.57□□□□□ -2
LMAN2Q12907 ELOCP21-201ENST00000412558 336 ntBASIC2.57□□□□□ -2
LMAN2Q12907 MAGEA8-AS1-201ENST00000427671 476 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
LMAN2Q12907 AL356320.1-201ENST00000429616 163 ntBASIC2.57□□□□□ -2
LMAN2Q12907 KRTAP13-6P-201ENST00000508999 371 ntBASIC2.57□□□□□ -2
LMAN2Q12907 RNU6-496P-201ENST00000516145 99 ntBASIC2.57□□□□□ -2
LMAN2Q12907 SNORA31.15-201ENST00000516771 132 ntBASIC2.57□□□□□ -2
LMAN2Q12907 AC124657.1-201ENST00000527819 429 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
LMAN2Q12907 MIR5194-201ENST00000582634 120 ntBASIC2.57□□□□□ -2
LMAN2Q12907 SNORD11B-201ENST00000607707 90 ntBASIC2.57□□□□□ -2
LMAN2Q12907 AC069294.1-201ENST00000608397 350 ntBASIC2.57□□□□□ -2
LMAN2Q12907 SDR42E1P4-201ENST00000620894 481 ntBASIC2.57□□□□□ -2
LMAN2Q12907 MIR6733-201ENST00000635723 61 ntBASIC2.57□□□□□ -2
LMAN2Q12907 Y_RNA.415-201ENST00000384012 112 ntBASIC2.56□□□□□ -2
LMAN2Q12907 RNU1-138P-201ENST00000384093 164 ntBASIC2.56□□□□□ -2
LMAN2Q12907 Y_RNA.498-201ENST00000384460 102 ntBASIC2.56□□□□□ -2
LMAN2Q12907 RNU6-102P-201ENST00000384485 104 ntBASIC2.56□□□□□ -2
LMAN2Q12907 Y_RNA.541-201ENST00000384640 113 ntBASIC2.56□□□□□ -2
LMAN2Q12907 Y_RNA.562-201ENST00000384695 113 ntBASIC2.56□□□□□ -2
LMAN2Q12907 AL390729.2-201ENST00000416137 156 ntBASIC2.56□□□□□ -2
LMAN2Q12907 AC139712.2-201ENST00000424302 339 ntBASIC2.56□□□□□ -2
LMAN2Q12907 HSPE1P25-201ENST00000455484 251 ntBASIC2.56□□□□□ -2
LMAN2Q12907 AC080013.2-201ENST00000460866 323 ntBASIC2.56□□□□□ -2
LMAN2Q12907 RPL39P38-201ENST00000467018 153 ntBASIC2.56□□□□□ -2
LMAN2Q12907 RPS23P5-201ENST00000495419 428 ntBASIC2.56□□□□□ -2
LMAN2Q12907 AC116563.1-201ENST00000505454 396 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
LMAN2Q12907 RNU6-586P-201ENST00000517265 104 ntBASIC2.56□□□□□ -2
LMAN2Q12907 AC245748.3-201ENST00000588710 241 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
LMAN2Q12907 AC005176.2-201ENST00000596933 147 ntBASIC2.56□□□□□ -2
LMAN2Q12907 SNORD113-5-201ENST00000607261 78 ntBASIC2.56□□□□□ -2
LMAN2Q12907 AC011373.1-201ENST00000607270 237 ntBASIC2.56□□□□□ -2
LMAN2Q12907 AC068631.1-220ENST00000630726 256 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
LMAN2Q12907 MTND5P6-201ENST00000422338 1798 ntBASIC2.56□□□□□ -2
LMAN2Q12907 APC-201ENST00000257430 10701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
LMAN2Q12907 MIR335-201ENST00000362173 94 ntBASIC2.55□□□□□ -2
LMAN2Q12907 RNU4-90P-201ENST00000362773 141 ntBASIC2.55□□□□□ -2
LMAN2Q12907 RNU6-379P-201ENST00000363813 104 ntBASIC2.55□□□□□ -2
LMAN2Q12907 RNU6-944P-201ENST00000364023 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
LMAN2Q12907 RNU6-1175P-201ENST00000365200 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
LMAN2Q12907 Y_RNA.489-201ENST00000384410 101 ntBASIC2.55□□□□□ -2
LMAN2Q12907 RAB28P5-201ENST00000427490 651 ntBASIC2.55□□□□□ -2
LMAN2Q12907 ANKRD30BP1-201ENST00000451052 2186 ntBASIC2.55□□□□□ -2
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