Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 AC107886.1-201ENST00000526935 516 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
CNTN1Q12860 AL035078.1-202ENST00000531627 413 ntTSL 2 BASIC1.7□□□□□ -2.14
CNTN1Q12860 AL121579.1-201ENST00000555129 305 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CNTN1Q12860 AC005899.2-201ENST00000584353 90 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CNTN1Q12860 RNU6ATAC35P-201ENST00000609276 444 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CNTN1Q12860 AC083806.3-201ENST00000614016 455 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CNTN1Q12860 AL773524.1-201ENST00000614065 229 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CNTN1Q12860 Y_RNA.106-201ENST00000363189 100 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CNTN1Q12860 RNU6-1188P-201ENST00000363795 107 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CNTN1Q12860 RNU6-280P-201ENST00000364145 104 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CNTN1Q12860 RNU6-700P-201ENST00000391043 107 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CNTN1Q12860 RNU1-139P-201ENST00000391307 165 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CNTN1Q12860 MIR190B-201ENST00000401119 79 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CNTN1Q12860 LINC01509-202ENST00000423523 408 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
CNTN1Q12860 MTCYBP10-201ENST00000424905 650 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CNTN1Q12860 USP9YP16-201ENST00000430287 407 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CNTN1Q12860 USP9YP23-201ENST00000455085 407 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CNTN1Q12860 AC022445.1-201ENST00000457499 408 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
CNTN1Q12860 AC091951.2-201ENST00000500762 203 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CNTN1Q12860 AC097473.1-201ENST00000508142 408 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CNTN1Q12860 AL117351.2-201ENST00000513571 157 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CNTN1Q12860 RNU6-1114P-201ENST00000516022 107 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CNTN1Q12860 RNU6-948P-201ENST00000516374 107 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CNTN1Q12860 SUMO2P18-201ENST00000518873 252 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CNTN1Q12860 AP001001.1-201ENST00000532422 826 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
CNTN1Q12860 APOOP3-201ENST00000536787 586 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CNTN1Q12860 CR936218.1-201ENST00000570454 304 ntTSL 2 BASIC1.69□□□□□ -2.14
CNTN1Q12860 LINC01919-202ENST00000579506 384 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
CNTN1Q12860 MIR5695-201ENST00000579717 85 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CNTN1Q12860 MIR548S-201ENST00000581352 82 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CNTN1Q12860 LINC02104-202ENST00000604954 599 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
CNTN1Q12860 AC113139.1-201ENST00000605049 239 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CNTN1Q12860 5S_rRNA.11-201ENST00000618635 84 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CNTN1Q12860 AL078596.1-201ENST00000624856 447 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CNTN1Q12860 MTND5P16-201ENST00000460269 1703 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CNTN1Q12860 FGF7-202ENST00000560270 1688 ntTSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
CNTN1Q12860 RNU6-874P-201ENST00000362390 105 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CNTN1Q12860 RNU5F-3P-201ENST00000363767 117 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CNTN1Q12860 RNU6-1235P-201ENST00000384559 107 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CNTN1Q12860 AL033519.2-201ENST00000403958 392 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CNTN1Q12860 Y_RNA.646-201ENST00000410980 101 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CNTN1Q12860 RNU6-1304P-201ENST00000411374 106 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CNTN1Q12860 AC244636.1-201ENST00000421152 228 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CNTN1Q12860 RPL23AP50-201ENST00000434149 455 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CNTN1Q12860 ATP5J2P3-201ENST00000451550 258 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CNTN1Q12860 RNU6-498P-201ENST00000459468 107 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CNTN1Q12860 AC091179.3-201ENST00000474761 144 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CNTN1Q12860 RNU6-307P-201ENST00000516743 106 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CNTN1Q12860 AC005034.5-201ENST00000604219 466 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CNTN1Q12860 AC005296.1-201ENST00000616145 209 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CNTN1Q12860 AC092794.2-201ENST00000620933 563 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CNTN1Q12860 AC068205.3-201ENST00000636385 468 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CNTN1Q12860 BCL2L11-225ENST00000640419 249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
CNTN1Q12860 GS1-279B7.1-204ENST00000641809 378 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CNTN1Q12860 SKIL-202ENST00000413427 2702 ntTSL 1 (best) BASIC1.67□□□□□ -2.14
CNTN1Q12860 RNU6-727P-201ENST00000363592 107 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CNTN1Q12860 SNORD87-201ENST00000364849 89 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CNTN1Q12860 Y_RNA.415-201ENST00000384012 112 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CNTN1Q12860 RNU6-793P-201ENST00000384233 104 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CNTN1Q12860 RNU6-310P-201ENST00000384655 107 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CNTN1Q12860 RNA5SP212-201ENST00000391223 107 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CNTN1Q12860 AC060773.1-201ENST00000421698 310 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CNTN1Q12860 AC092755.1-201ENST00000441746 97 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
CNTN1Q12860 RPL23AP6-201ENST00000446637 472 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CNTN1Q12860 AC074290.1-201ENST00000448883 135 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CNTN1Q12860 RNU7-57P-201ENST00000459540 60 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CNTN1Q12860 AC096721.1-201ENST00000513540 552 ntTSL 4 BASIC1.67□□□□□ -2.14
CNTN1Q12860 RNU6-559P-201ENST00000516151 98 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CNTN1Q12860 RNU6-277P-201ENST00000516272 106 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CNTN1Q12860 AC090510.1-201ENST00000567456 425 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
CNTN1Q12860 MIR5690-201ENST00000583739 73 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CNTN1Q12860 AC104819.3-201ENST00000603264 540 ntTSL 4 BASIC1.67□□□□□ -2.14
CNTN1Q12860 RNU6-661P-201ENST00000362409 107 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CNTN1Q12860 Y_RNA.179-201ENST00000363844 90 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CNTN1Q12860 Y_RNA.364-201ENST00000365532 101 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CNTN1Q12860 RNY3P14-201ENST00000384309 102 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CNTN1Q12860 RNA5SP100-201ENST00000410903 110 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CNTN1Q12860 RNA5SP59-201ENST00000410922 110 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CNTN1Q12860 LINC01594-201ENST00000445083 611 ntTSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
CNTN1Q12860 RNU7-87P-201ENST00000459343 62 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CNTN1Q12860 RNA5SP57-201ENST00000459463 123 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CNTN1Q12860 RPL17P19-201ENST00000489069 552 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CNTN1Q12860 AC093303.1-201ENST00000514549 295 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CNTN1Q12860 RNU6-1041P-201ENST00000516254 102 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CNTN1Q12860 RNU6-875P-201ENST00000516488 106 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CNTN1Q12860 5S_rRNA.3-201ENST00000517021 110 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CNTN1Q12860 CBX3P4-201ENST00000538909 354 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CNTN1Q12860 AK6P2-201ENST00000549020 471 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CNTN1Q12860 AC004584.2-201ENST00000570407 410 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CNTN1Q12860 MIR4303-201ENST00000581299 66 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CNTN1Q12860 MZT1P2-201ENST00000604387 248 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CNTN1Q12860 AL132765.2-201ENST00000610812 351 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CNTN1Q12860 AC010999.1-201ENST00000611856 324 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CNTN1Q12860 5S_rRNA.19-201ENST00000612131 110 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CNTN1Q12860 5S_rRNA.18-201ENST00000621941 110 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CNTN1Q12860 RBMS2-209ENST00000639027 192 ntTSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
CNTN1Q12860 ATP11C-202ENST00000361648 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.14
CNTN1Q12860 TFEC-204ENST00000457268 6309 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
CNTN1Q12860 RNU6-281P-201ENST00000384212 103 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CNTN1Q12860 MIR548B-201ENST00000385247 97 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
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