Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 RNU2-64P-201ENST00000411315 191 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PGGT1BP53609 RPS12P2-201ENST00000439728 269 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PGGT1BP53609 LINC02041-201ENST00000440726 246 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
PGGT1BP53609 IFNA11P-201ENST00000446352 526 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PGGT1BP53609 snoU13.14-201ENST00000459372 104 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PGGT1BP53609 VTRNA2-2P-201ENST00000516091 103 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PGGT1BP53609 HSPE1P18-201ENST00000517602 280 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PGGT1BP53609 AP003465.1-201ENST00000520575 382 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
PGGT1BP53609 AK6P2-201ENST00000549020 471 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PGGT1BP53609 IGKV1-33-202ENST00000558152 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
PGGT1BP53609 ACTG1P17-203ENST00000561222 537 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
PGGT1BP53609 AC009779.6-201ENST00000603972 165 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PGGT1BP53609 IGKV1D-33-202ENST00000611734 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
PGGT1BP53609 MIR6817-201ENST00000615588 66 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PGGT1BP53609 AC091932.3-201ENST00000624223 323 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PGGT1BP53609 AC127459.3-201ENST00000624328 466 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PGGT1BP53609 MRPL42-202ENST00000393128 1983 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
PGGT1BP53609 SPAM1-206ENST00000460182 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
PGGT1BP53609 RRAS2-211ENST00000537760 2034 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
PGGT1BP53609 Y_RNA.44-201ENST00000362676 108 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PGGT1BP53609 VTRNA1-1-201ENST00000363120 99 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PGGT1BP53609 RNU6-1210P-201ENST00000363775 107 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PGGT1BP53609 Y_RNA.297-201ENST00000364950 91 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PGGT1BP53609 TRAV41-201ENST00000390468 336 ntAPPRIS P1 BASIC2.37□□□□□ -2.03
PGGT1BP53609 AL136320.1-201ENST00000417273 430 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
PGGT1BP53609 RAB28P5-201ENST00000427490 651 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PGGT1BP53609 LINC02238-202ENST00000436262 320 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
PGGT1BP53609 AC004386.2-201ENST00000441858 148 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PGGT1BP53609 AC080013.2-201ENST00000460866 323 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PGGT1BP53609 AC092666.1-201ENST00000492054 573 ntTSL 4 BASIC2.37□□□□□ -2.03
PGGT1BP53609 RPS23P5-201ENST00000495419 428 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PGGT1BP53609 AC026436.1-201ENST00000510537 270 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PGGT1BP53609 RNU6-107P-201ENST00000516643 102 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PGGT1BP53609 RNU2-31P-201ENST00000516954 155 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PGGT1BP53609 RNU1-117P-201ENST00000517041 158 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PGGT1BP53609 SCARNA3-201ENST00000517097 143 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PGGT1BP53609 CR936218.1-201ENST00000570454 304 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
PGGT1BP53609 BX284668.6-201ENST00000606899 438 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PGGT1BP53609 AC005520.5-201ENST00000613926 164 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PGGT1BP53609 AC023490.1-201ENST00000614584 375 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
PGGT1BP53609 AC004467.1-201ENST00000615678 330 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PGGT1BP53609 AC011718.1-201ENST00000622906 375 ntTSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
PGGT1BP53609 XRCC4-205ENST00000511817 1636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
PGGT1BP53609 NEB-203ENST00000397345 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
PGGT1BP53609 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
PGGT1BP53609 CHD1-201ENST00000284049 6457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
PGGT1BP53609 SNORA72.2-201ENST00000365028 127 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PGGT1BP53609 Y_RNA.383-201ENST00000383855 97 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PGGT1BP53609 Y_RNA.510-201ENST00000384511 114 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PGGT1BP53609 SNORA53-201ENST00000391141 249 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PGGT1BP53609 MIR548I3-201ENST00000408378 149 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PGGT1BP53609 MIR548I1-201ENST00000408810 149 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PGGT1BP53609 RNA5SP184-201ENST00000411071 108 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PGGT1BP53609 MTCO1P5-201ENST00000433573 344 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PGGT1BP53609 AC007395.1-201ENST00000451333 677 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PGGT1BP53609 PRELID3BP1-201ENST00000457142 540 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PGGT1BP53609 AC140059.1-201ENST00000489238 361 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
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PGGT1BP53609 SNORD116-28-201ENST00000516123 91 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
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PGGT1BP53609 AC233702.2-202ENST00000562547 291 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PGGT1BP53609 MIR5006-201ENST00000583027 110 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PGGT1BP53609 AL356280.1-201ENST00000603614 379 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
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PGGT1BP53609 ZNF117-204ENST00000620222 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
PGGT1BP53609 CCSAP-202ENST00000366686 4399 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
PGGT1BP53609 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
PGGT1BP53609 ARHGAP28-204ENST00000419673 5492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
PGGT1BP53609 AC080128.1-201ENST00000474389 1917 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PGGT1BP53609 SNORA25.1-201ENST00000362326 128 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PGGT1BP53609 U3.9-201ENST00000363823 204 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PGGT1BP53609 RNU6-662P-201ENST00000384253 104 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
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PGGT1BP53609 U6atac.2-201ENST00000408644 118 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PGGT1BP53609 AL590399.1-203ENST00000412631 256 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
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PGGT1BP53609 PIGPP3-201ENST00000425307 415 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PGGT1BP53609 AL353680.1-201ENST00000433788 337 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
PGGT1BP53609 KCNJ6-AS1-201ENST00000435001 357 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
PGGT1BP53609 POLR2KP2-201ENST00000438155 177 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PGGT1BP53609 AL445687.1-201ENST00000439946 251 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PGGT1BP53609 EEF1B2P7-201ENST00000451177 676 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PGGT1BP53609 TSPY5P-202ENST00000456541 142 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
PGGT1BP53609 SNORA59A-201ENST00000459326 152 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PGGT1BP53609 AC091959.1-201ENST00000495857 238 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PGGT1BP53609 AC023141.11-201ENST00000508864 202 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PGGT1BP53609 AC087518.1-201ENST00000524098 187 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
PGGT1BP53609 MIR3199-1-201ENST00000582434 88 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PGGT1BP53609 MIR3117-201ENST00000584034 78 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PGGT1BP53609 AC069294.1-201ENST00000608397 350 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PGGT1BP53609 AC005562.2-201ENST00000618264 111 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PGGT1BP53609 AC090517.3-201ENST00000625170 141 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PGGT1BP53609 hsa-mir-548d-1.1-201ENST00000636914 97 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PGGT1BP53609 UHMK1-204ENST00000545294 8117 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
PGGT1BP53609 AKAP7-209ENST00000541650 2008 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
PGGT1BP53609 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
PGGT1BP53609 LRRIQ3-204ENST00000395089 2673 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
PGGT1BP53609 SLC4A7-201ENST00000295736 7757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
PGGT1BP53609 Y_RNA.150-201ENST00000363562 102 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
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