Protein–RNA interactions for Protein: P30536

TSPO, Translocator protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOP30536 AL590399.1-203ENST00000412631 256 ntTSL 5 BASIC0.55□□□□□ -2.32
TSPOP30536 STAG3L5P-204ENST00000443759 179 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
TSPOP30536 NDUFB4P10-201ENST00000452541 359 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
TSPOP30536 RNA5SP255-201ENST00000516370 107 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
TSPOP30536 RNU6-430P-201ENST00000517078 107 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
TSPOP30536 AC100807.1-201ENST00000517640 552 ntTSL 5 BASIC0.55□□□□□ -2.32
TSPOP30536 AC004817.2-201ENST00000561794 651 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
TSPOP30536 MIR4698-201ENST00000577795 80 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
TSPOP30536 MIR4424-201ENST00000585257 86 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
TSPOP30536 AL589935.1-202ENST00000612512 393 ntTSL 5 BASIC0.55□□□□□ -2.32
TSPOP30536 AL050303.3-201ENST00000613704 284 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
TSPOP30536 AC103705.1-201ENST00000619013 241 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
TSPOP30536 MIR96-201ENST00000362288 78 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
TSPOP30536 RNA5SP361-201ENST00000362686 118 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
TSPOP30536 Y_RNA.159-201ENST00000363674 87 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
TSPOP30536 U3.8-201ENST00000363675 217 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
TSPOP30536 SNORA25.9-201ENST00000365087 128 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
TSPOP30536 DEFB134-201ENST00000382205 314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.54□□□□□ -2.32
TSPOP30536 RNU5A-6P-201ENST00000384136 116 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
TSPOP30536 MIR487A-201ENST00000385009 80 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
TSPOP30536 MIR1185-2-201ENST00000408687 86 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
TSPOP30536 RNA5SP504-201ENST00000410676 117 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
TSPOP30536 AC000123.1-201ENST00000418215 516 ntTSL 5 BASIC0.54□□□□□ -2.32
TSPOP30536 AC005019.2-201ENST00000434321 359 ntTSL 5 BASIC0.54□□□□□ -2.32
TSPOP30536 TPTE2P5-203ENST00000458118 728 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
TSPOP30536 RNU7-90P-201ENST00000459216 62 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
TSPOP30536 RPS26P48-201ENST00000491713 339 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
TSPOP30536 MTND1P5-201ENST00000517906 940 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
TSPOP30536 AC087683.1-201ENST00000591187 441 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
TSPOP30536 AL590095.2-201ENST00000604136 117 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
TSPOP30536 AC104465.1-201ENST00000611365 139 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
TSPOP30536 LINC02033-202ENST00000623312 492 ntTSL 3 BASIC0.54□□□□□ -2.32
TSPOP30536 AC023934.1-201ENST00000574529 2389 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
TSPOP30536 Y_RNA.191-201ENST00000363972 113 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
TSPOP30536 RNU6-110P-201ENST00000384508 104 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
TSPOP30536 MIR521-1-201ENST00000384902 87 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
TSPOP30536 SNORA26.8-201ENST00000391306 124 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
TSPOP30536 MIR450B-201ENST00000401182 78 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
TSPOP30536 RPS26P5-201ENST00000418544 335 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
TSPOP30536 LINC01866-201ENST00000421181 201 ntTSL 3 BASIC0.53□□□□□ -2.32
TSPOP30536 AL359672.1-201ENST00000442302 409 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
TSPOP30536 RNU7-21P-201ENST00000459430 62 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
TSPOP30536 MTCO1P29-201ENST00000496868 288 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
TSPOP30536 RNU6-917P-201ENST00000516294 104 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
TSPOP30536 RNU6-1198P-201ENST00000516904 67 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
TSPOP30536 MTCO2P4-201ENST00000517968 247 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
TSPOP30536 AL157687.1-201ENST00000554853 619 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
TSPOP30536 AL357078.3-201ENST00000607528 618 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
TSPOP30536 AL136370.1-201ENST00000608166 691 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
TSPOP30536 AL354950.2-201ENST00000617939 290 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
TSPOP30536 MIR6835-201ENST00000621552 64 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
TSPOP30536 CASC19-280ENST00000642102 1351 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
TSPOP30536 RNU4-12P-201ENST00000365233 139 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
TSPOP30536 RNU6-933P-201ENST00000384424 107 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
TSPOP30536 RNU6-733P-201ENST00000410759 104 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
TSPOP30536 RNU6-325P-201ENST00000411132 105 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
TSPOP30536 AL355314.2-201ENST00000427182 436 ntTSL 3 BASIC0.52□□□□□ -2.33
TSPOP30536 FABP5P4-201ENST00000437203 171 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
TSPOP30536 AL360091.3-201ENST00000442146 387 ntTSL 5 BASIC0.52□□□□□ -2.33
TSPOP30536 MCHR2-AS1-203ENST00000451220 429 ntTSL 3 BASIC0.52□□□□□ -2.33
TSPOP30536 RPL23AP75-201ENST00000491601 451 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
TSPOP30536 AC063944.1-201ENST00000496943 295 ntTSL 3 BASIC0.52□□□□□ -2.33
TSPOP30536 AC022493.2-201ENST00000506122 481 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
TSPOP30536 AC100763.1-201ENST00000532735 522 ntTSL 3 BASIC0.52□□□□□ -2.33
TSPOP30536 AC002558.3-201ENST00000574021 401 ntTSL 3 BASIC0.52□□□□□ -2.33
TSPOP30536 CPDP1-201ENST00000579660 283 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
TSPOP30536 FAM106DP-201ENST00000586416 501 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
TSPOP30536 AC092747.3-201ENST00000603769 301 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
TSPOP30536 PTP4A2-220ENST00000627328 615 ntTSL 5 BASIC0.52□□□□□ -2.33
TSPOP30536 SNORD115-8-201ENST00000363856 82 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
TSPOP30536 SNORD115-38-201ENST00000365037 82 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
TSPOP30536 RNU6-214P-201ENST00000384130 107 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
TSPOP30536 RNU6-424P-201ENST00000384367 105 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
TSPOP30536 MIR499A-201ENST00000384903 122 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
TSPOP30536 AL445305.1-201ENST00000432577 575 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
TSPOP30536 RPEP5-201ENST00000441137 268 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
TSPOP30536 AC012445.1-201ENST00000442831 607 ntTSL 3 BASIC0.51□□□□□ -2.33
TSPOP30536 MTCO2P7-201ENST00000446518 666 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
TSPOP30536 AC003988.1-201ENST00000447198 578 ntTSL 5 BASIC0.51□□□□□ -2.33
TSPOP30536 TPT1P7-201ENST00000458300 517 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
TSPOP30536 COX6CP6-201ENST00000490840 228 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
TSPOP30536 AC117454.1-201ENST00000491120 168 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
TSPOP30536 AC093730.1-201ENST00000508825 448 ntTSL 3 BASIC0.51□□□□□ -2.33
TSPOP30536 LINC02500-201ENST00000512547 493 ntTSL 3 BASIC0.51□□□□□ -2.33
TSPOP30536 SNORA70.12-201ENST00000516084 153 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
TSPOP30536 CYP3A137P-201ENST00000562436 69 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
TSPOP30536 AC068700.1-201ENST00000565862 3754 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
TSPOP30536 RNASEH2B-AS1-206ENST00000601286 657 ntTSL 5 BASIC0.51□□□□□ -2.33
TSPOP30536 AL353765.1-201ENST00000605514 183 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
TSPOP30536 Y_RNA.164-201ENST00000363709 102 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
TSPOP30536 Y_RNA.265-201ENST00000364677 108 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
TSPOP30536 SNORD87-201ENST00000364849 89 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
TSPOP30536 SNORA72.3-201ENST00000365074 132 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
TSPOP30536 SNORD114-22-201ENST00000365423 72 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
TSPOP30536 SNORD116-13-201ENST00000384408 92 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
TSPOP30536 RNY3P9-201ENST00000384727 106 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
TSPOP30536 AL162411.1-201ENST00000413145 526 ntTSL 2 BASIC0.5□□□□□ -2.33
TSPOP30536 AL353743.2-204ENST00000456242 419 ntTSL 3 BASIC0.5□□□□□ -2.33
TSPOP30536 LINC01399-202ENST00000458450 244 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
TSPOP30536 AC091133.4-201ENST00000511142 308 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
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