Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Length 700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 RPL29P14-201ENST00000495837 428 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPREP23469 RNU6-162P-201ENST00000516228 103 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPREP23469 RNU6ATAC12P-201ENST00000516542 115 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPREP23469 RNA5SP468-201ENST00000516782 93 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPREP23469 AC026403.1-201ENST00000518938 295 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPREP23469 LINC00648-202ENST00000555985 2885 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPREP23469 TMCO5A-203ENST00000558158 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPREP23469 NCOA1-202ENST00000348332 6895 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPREP23469 IL33-201ENST00000381434 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
PTPREP23469 ZNF616-201ENST00000330123 2563 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
PTPREP23469 SNORD35B-201ENST00000363660 87 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
PTPREP23469 RGS18-201ENST00000367460 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
PTPREP23469 RNU6-1104P-201ENST00000384723 104 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
PTPREP23469 RNA5SP129-201ENST00000410276 118 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
PTPREP23469 Y_RNA.601-201ENST00000410500 113 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
PTPREP23469 RPL23AP83-201ENST00000434984 473 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
PTPREP23469 RNU1-95P-201ENST00000516357 160 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
PTPREP23469 RNU1-128P-201ENST00000516704 160 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
PTPREP23469 AC068657.1-201ENST00000520807 306 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
PTPREP23469 U7.3-201ENST00000616123 62 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
PTPREP23469 Z82217.1-201ENST00000625157 8149 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
PTPREP23469 AC009093.8-201ENST00000641769 292 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
PTPREP23469 ZC3H11A-214ENST00000639812 11825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
PTPREP23469 GPRC6A-201ENST00000310357 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
PTPREP23469 RNF38-201ENST00000259605 5012 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
PTPREP23469 UBA6-201ENST00000322244 9564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
PTPREP23469 RNU6-349P-201ENST00000362402 107 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
PTPREP23469 RNU6-1279P-201ENST00000383917 103 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
PTPREP23469 MIR1912-201ENST00000410389 80 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
PTPREP23469 AL513477.1-202ENST00000417061 214 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
PTPREP23469 AL451129.1-201ENST00000437471 285 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
PTPREP23469 snoU13.28-201ENST00000459235 104 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
PTPREP23469 AC078918.1-201ENST00000498515 228 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
PTPREP23469 RNA5SP179-201ENST00000517284 121 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
PTPREP23469 IGKV2OR2-8-201ENST00000558710 300 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
PTPREP23469 MIR3163-201ENST00000581592 73 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
PTPREP23469 OR9H1P-201ENST00000446393 4888 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
PTPREP23469 TRMT10A-203ENST00000394877 3516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
PTPREP23469 MAPK10-372ENST00000641954 3413 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
PTPREP23469 AKAP7-209ENST00000541650 2008 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
PTPREP23469 FBXO11-201ENST00000402508 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPREP23469 AC000123.3-201ENST00000624029 4975 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPREP23469 SLCO1B3-201ENST00000261196 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPREP23469 ARHGAP28-202ENST00000314319 5415 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPREP23469 AC010889.1-201ENST00000566193 2666 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPREP23469 RNU6-944P-201ENST00000364023 107 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPREP23469 RNU6-979P-201ENST00000383896 107 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPREP23469 RNU6-675P-201ENST00000384236 104 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPREP23469 MIR607-201ENST00000385241 96 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPREP23469 RNU6-644P-201ENST00000391155 98 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPREP23469 U8.17-201ENST00000391292 132 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPREP23469 RPL21P3-201ENST00000395517 478 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPREP23469 AC016909.1-201ENST00000415916 166 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPREP23469 RN7SKP282-201ENST00000516824 299 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
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PTPREP23469 YPEL5P3-201ENST00000547227 352 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPREP23469 AC022523.2-201ENST00000561045 150 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPREP23469 MIR5588-201ENST00000581890 63 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPREP23469 AL161756.2-201ENST00000604597 246 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPREP23469 AC091167.4-201ENST00000605079 184 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPREP23469 ZNF479-202ENST00000331162 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPREP23469 PCAT4-201ENST00000504263 2091 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPREP23469 AGBL2-201ENST00000357610 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
PTPREP23469 SYNE2-204ENST00000358025 21842 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
PTPREP23469 PLCL2-202ENST00000432376 3940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
PTPREP23469 FAT3-204ENST00000525166 18699 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
PTPREP23469 RNU6-1099P-201ENST00000363533 107 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
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PTPREP23469 Y_RNA.437-201ENST00000384113 113 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PTPREP23469 SNORA3.3-201ENST00000408712 125 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PTPREP23469 RNU7-164P-201ENST00000459221 62 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PTPREP23469 AC019288.1-201ENST00000557918 224 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PTPREP23469 MIR4666B-201ENST00000578142 81 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PTPREP23469 MIR4438-201ENST00000585271 93 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PTPREP23469 AC019176.2-201ENST00000611579 315 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PTPREP23469 ETDC-201ENST00000635820 180 ntAPPRIS P1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
PTPREP23469 FAM35CP-201ENST00000554755 2470 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PTPREP23469 CCDC14-217ENST00000485727 7917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
PTPREP23469 DDX60L-201ENST00000260184 6754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
PTPREP23469 TNNI3K-201ENST00000326637 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
PTPREP23469 SPAG17-201ENST00000336338 6924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
PTPREP23469 OR6A2-202ENST00000641196 4295 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
PTPREP23469 CD84-206ENST00000368054 8181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
PTPREP23469 RNU6-24P-201ENST00000384440 107 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PTPREP23469 MIR518F-201ENST00000384973 87 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PTPREP23469 TRAV41-201ENST00000390468 336 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
PTPREP23469 AL451046.2-201ENST00000403074 277 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PTPREP23469 SNRPGP13-201ENST00000442212 177 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PTPREP23469 RPS29P21-201ENST00000496272 170 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PTPREP23469 RNU7-123P-201ENST00000515911 60 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PTPREP23469 RNU6-948P-201ENST00000516374 107 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PTPREP23469 MIR3609-201ENST00000582661 80 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PTPREP23469 AC013412.1-201ENST00000610687 192 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PTPREP23469 AC012314.7-201ENST00000619693 93 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PTPREP23469 MAP3K21-201ENST00000366622 4005 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
PTPREP23469 LINC01733-201ENST00000449316 4604 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
PTPREP23469 BRCA2-201ENST00000380152 11986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
PTPREP23469 PPP1R12A-204ENST00000546369 2977 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
PTPREP23469 LINC00670-201ENST00000313495 2953 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
PTPREP23469 SNORA33-201ENST00000363664 130 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
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