Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 FGF7P1-201ENST00000582820 288 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
PTPRDP23468 AC092296.3-201ENST00000589968 249 ntTSL 3 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
PTPRDP23468 U6.73-201ENST00000619194 103 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
PTPRDP23468 DEUP1-202ENST00000525646 1920 ntTSL 1 (best) BASIC-0.02□□□□□ -2.41
PTPRDP23468 SNORD44.1-201ENST00000363202 61 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
PTPRDP23468 SNORA2B-201ENST00000384583 137 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
PTPRDP23468 RNU6-1093P-201ENST00000391194 107 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
PTPRDP23468 MRPL42P3-201ENST00000401492 326 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
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PTPRDP23468 AC073261.1-201ENST00000429409 121 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
PTPRDP23468 AC119618.1-201ENST00000434191 222 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
PTPRDP23468 AL133217.1-201ENST00000450980 425 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
PTPRDP23468 MTCO2P6-201ENST00000463134 685 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
PTPRDP23468 AC024382.1-201ENST00000520224 292 ntTSL 3 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
PTPRDP23468 AC009558.1-201ENST00000561174 581 ntTSL 4 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
PTPRDP23468 BNIP3P40-201ENST00000596017 556 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
PTPRDP23468 MTND5P17-201ENST00000418405 1603 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
PTPRDP23468 RNA5SP264-201ENST00000363115 107 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
PTPRDP23468 MIR562-201ENST00000384894 95 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
PTPRDP23468 MTCYBP36-201ENST00000404146 440 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
PTPRDP23468 SNRPGP12-201ENST00000449481 213 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
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PTPRDP23468 RNU6-344P-201ENST00000516635 111 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
PTPRDP23468 AC025647.1-201ENST00000517879 253 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
PTPRDP23468 AP003716.2-201ENST00000528260 108 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
PTPRDP23468 AP003181.2-201ENST00000528941 181 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
PTPRDP23468 AL121821.1-201ENST00000557067 530 ntTSL 3 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
PTPRDP23468 MIR4802-201ENST00000581881 80 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
PTPRDP23468 AC092634.7-201ENST00000621022 103 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
PTPRDP23468 AC013437.2-201ENST00000639587 677 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
PTPRDP23468 C9orf84-203ENST00000374287 4721 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC-0.04□□□□□ -2.42
PTPRDP23468 MIRLET7C-201ENST00000362160 84 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
PTPRDP23468 Y_RNA.60-201ENST00000362831 98 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
PTPRDP23468 RNU6-179P-201ENST00000363350 107 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
PTPRDP23468 Y_RNA.265-201ENST00000364677 108 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
PTPRDP23468 RNU6-108P-201ENST00000365558 107 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
PTPRDP23468 RNU6-1200P-201ENST00000384162 107 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
PTPRDP23468 SNORA12.1-201ENST00000390873 148 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
PTPRDP23468 RNU6ATAC11P-201ENST00000408541 125 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
PTPRDP23468 Z68323.1-201ENST00000450365 519 ntTSL 3 BASIC-0.04□□□□□ -2.42
PTPRDP23468 OFD1P4Y-201ENST00000455273 1179 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
PTPRDP23468 USP9YP25-201ENST00000457708 443 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
PTPRDP23468 AC007215.1-201ENST00000464893 276 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
PTPRDP23468 MTND1P22-201ENST00000510572 951 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
PTPRDP23468 LINC01218-201ENST00000515150 481 ntTSL 3 BASIC-0.04□□□□□ -2.42
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PTPRDP23468 AC068137.4-201ENST00000638485 296 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
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PTPRDP23468 AC097462.1-201ENST00000514125 324 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
PTPRDP23468 MTND4LP18-201ENST00000526864 291 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
PTPRDP23468 AC023827.1-201ENST00000569247 97 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
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PTPRDP23468 Y_RNA.390-201ENST00000383932 102 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
PTPRDP23468 Y_RNA.471-201ENST00000384312 102 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
PTPRDP23468 RNU6-393P-201ENST00000384475 107 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
PTPRDP23468 MIR520C-201ENST00000385005 87 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
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