Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1E3

Nfkbia, NF-kappa-B inhibitor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfkbiaQ9Z1E3 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NfkbiaQ9Z1E3 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NfkbiaQ9Z1E3 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NfkbiaQ9Z1E3 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NfkbiaQ9Z1E3 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NfkbiaQ9Z1E3 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NfkbiaQ9Z1E3 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NfkbiaQ9Z1E3 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NfkbiaQ9Z1E3 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NfkbiaQ9Z1E3 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NfkbiaQ9Z1E3 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NfkbiaQ9Z1E3 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NfkbiaQ9Z1E3 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NfkbiaQ9Z1E3 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NfkbiaQ9Z1E3 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NfkbiaQ9Z1E3 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NfkbiaQ9Z1E3 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NfkbiaQ9Z1E3 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NfkbiaQ9Z1E3 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NfkbiaQ9Z1E3 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NfkbiaQ9Z1E3 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NfkbiaQ9Z1E3 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NfkbiaQ9Z1E3 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NfkbiaQ9Z1E3 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NfkbiaQ9Z1E3 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NfkbiaQ9Z1E3 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NfkbiaQ9Z1E3 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NfkbiaQ9Z1E3 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NfkbiaQ9Z1E3 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NfkbiaQ9Z1E3 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NfkbiaQ9Z1E3 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NfkbiaQ9Z1E3 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NfkbiaQ9Z1E3 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NfkbiaQ9Z1E3 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NfkbiaQ9Z1E3 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NfkbiaQ9Z1E3 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NfkbiaQ9Z1E3 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NfkbiaQ9Z1E3 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NfkbiaQ9Z1E3 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NfkbiaQ9Z1E3 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NfkbiaQ9Z1E3 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NfkbiaQ9Z1E3 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NfkbiaQ9Z1E3 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NfkbiaQ9Z1E3 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NfkbiaQ9Z1E3 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NfkbiaQ9Z1E3 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NfkbiaQ9Z1E3 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NfkbiaQ9Z1E3 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NfkbiaQ9Z1E3 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NfkbiaQ9Z1E3 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NfkbiaQ9Z1E3 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NfkbiaQ9Z1E3 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NfkbiaQ9Z1E3 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NfkbiaQ9Z1E3 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NfkbiaQ9Z1E3 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NfkbiaQ9Z1E3 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NfkbiaQ9Z1E3 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NfkbiaQ9Z1E3 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NfkbiaQ9Z1E3 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NfkbiaQ9Z1E3 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NfkbiaQ9Z1E3 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NfkbiaQ9Z1E3 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NfkbiaQ9Z1E3 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NfkbiaQ9Z1E3 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NfkbiaQ9Z1E3 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NfkbiaQ9Z1E3 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NfkbiaQ9Z1E3 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NfkbiaQ9Z1E3 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NfkbiaQ9Z1E3 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NfkbiaQ9Z1E3 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NfkbiaQ9Z1E3 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NfkbiaQ9Z1E3 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NfkbiaQ9Z1E3 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NfkbiaQ9Z1E3 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NfkbiaQ9Z1E3 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NfkbiaQ9Z1E3 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NfkbiaQ9Z1E3 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NfkbiaQ9Z1E3 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NfkbiaQ9Z1E3 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NfkbiaQ9Z1E3 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NfkbiaQ9Z1E3 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NfkbiaQ9Z1E3 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NfkbiaQ9Z1E3 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NfkbiaQ9Z1E3 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NfkbiaQ9Z1E3 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NfkbiaQ9Z1E3 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NfkbiaQ9Z1E3 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NfkbiaQ9Z1E3 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NfkbiaQ9Z1E3 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NfkbiaQ9Z1E3 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NfkbiaQ9Z1E3 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NfkbiaQ9Z1E3 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NfkbiaQ9Z1E3 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NfkbiaQ9Z1E3 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NfkbiaQ9Z1E3 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NfkbiaQ9Z1E3 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NfkbiaQ9Z1E3 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NfkbiaQ9Z1E3 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NfkbiaQ9Z1E3 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NfkbiaQ9Z1E3 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms