Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKS6

PACSIN3, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3Q9UKS6 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PACSIN3Q9UKS6 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PACSIN3Q9UKS6 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PACSIN3Q9UKS6 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PACSIN3Q9UKS6 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PACSIN3Q9UKS6 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PACSIN3Q9UKS6 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PACSIN3Q9UKS6 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
PACSIN3Q9UKS6 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PACSIN3Q9UKS6 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PACSIN3Q9UKS6 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PACSIN3Q9UKS6 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PACSIN3Q9UKS6 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PACSIN3Q9UKS6 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PACSIN3Q9UKS6 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PACSIN3Q9UKS6 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PACSIN3Q9UKS6 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PACSIN3Q9UKS6 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PACSIN3Q9UKS6 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PACSIN3Q9UKS6 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PACSIN3Q9UKS6 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PACSIN3Q9UKS6 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PACSIN3Q9UKS6 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PACSIN3Q9UKS6 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PACSIN3Q9UKS6 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PACSIN3Q9UKS6 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PACSIN3Q9UKS6 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PACSIN3Q9UKS6 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PACSIN3Q9UKS6 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PACSIN3Q9UKS6 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PACSIN3Q9UKS6 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PACSIN3Q9UKS6 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PACSIN3Q9UKS6 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
PACSIN3Q9UKS6 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PACSIN3Q9UKS6 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PACSIN3Q9UKS6 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
PACSIN3Q9UKS6 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
PACSIN3Q9UKS6 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PACSIN3Q9UKS6 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PACSIN3Q9UKS6 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
PACSIN3Q9UKS6 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PACSIN3Q9UKS6 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PACSIN3Q9UKS6 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PACSIN3Q9UKS6 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PACSIN3Q9UKS6 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PACSIN3Q9UKS6 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PACSIN3Q9UKS6 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PACSIN3Q9UKS6 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PACSIN3Q9UKS6 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PACSIN3Q9UKS6 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PACSIN3Q9UKS6 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PACSIN3Q9UKS6 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PACSIN3Q9UKS6 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PACSIN3Q9UKS6 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PACSIN3Q9UKS6 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PACSIN3Q9UKS6 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PACSIN3Q9UKS6 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PACSIN3Q9UKS6 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PACSIN3Q9UKS6 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PACSIN3Q9UKS6 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PACSIN3Q9UKS6 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PACSIN3Q9UKS6 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PACSIN3Q9UKS6 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PACSIN3Q9UKS6 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PACSIN3Q9UKS6 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PACSIN3Q9UKS6 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PACSIN3Q9UKS6 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PACSIN3Q9UKS6 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PACSIN3Q9UKS6 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PACSIN3Q9UKS6 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PACSIN3Q9UKS6 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PACSIN3Q9UKS6 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PACSIN3Q9UKS6 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PACSIN3Q9UKS6 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PACSIN3Q9UKS6 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PACSIN3Q9UKS6 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PACSIN3Q9UKS6 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PACSIN3Q9UKS6 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PACSIN3Q9UKS6 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PACSIN3Q9UKS6 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PACSIN3Q9UKS6 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PACSIN3Q9UKS6 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PACSIN3Q9UKS6 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PACSIN3Q9UKS6 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PACSIN3Q9UKS6 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PACSIN3Q9UKS6 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PACSIN3Q9UKS6 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PACSIN3Q9UKS6 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PACSIN3Q9UKS6 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PACSIN3Q9UKS6 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PACSIN3Q9UKS6 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PACSIN3Q9UKS6 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PACSIN3Q9UKS6 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PACSIN3Q9UKS6 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PACSIN3Q9UKS6 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PACSIN3Q9UKS6 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PACSIN3Q9UKS6 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PACSIN3Q9UKS6 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PACSIN3Q9UKS6 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PACSIN3Q9UKS6 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms