Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJY4

GGA2, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA2, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA2Q9UJY4 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GGA2Q9UJY4 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
GGA2Q9UJY4 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GGA2Q9UJY4 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GGA2Q9UJY4 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GGA2Q9UJY4 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GGA2Q9UJY4 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
GGA2Q9UJY4 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GGA2Q9UJY4 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GGA2Q9UJY4 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GGA2Q9UJY4 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GGA2Q9UJY4 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GGA2Q9UJY4 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GGA2Q9UJY4 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GGA2Q9UJY4 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GGA2Q9UJY4 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GGA2Q9UJY4 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GGA2Q9UJY4 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GGA2Q9UJY4 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GGA2Q9UJY4 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GGA2Q9UJY4 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GGA2Q9UJY4 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GGA2Q9UJY4 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GGA2Q9UJY4 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GGA2Q9UJY4 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GGA2Q9UJY4 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GGA2Q9UJY4 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GGA2Q9UJY4 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GGA2Q9UJY4 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
GGA2Q9UJY4 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GGA2Q9UJY4 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GGA2Q9UJY4 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GGA2Q9UJY4 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GGA2Q9UJY4 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GGA2Q9UJY4 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GGA2Q9UJY4 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GGA2Q9UJY4 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GGA2Q9UJY4 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GGA2Q9UJY4 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GGA2Q9UJY4 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GGA2Q9UJY4 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GGA2Q9UJY4 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GGA2Q9UJY4 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GGA2Q9UJY4 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GGA2Q9UJY4 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GGA2Q9UJY4 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GGA2Q9UJY4 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GGA2Q9UJY4 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GGA2Q9UJY4 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GGA2Q9UJY4 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GGA2Q9UJY4 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GGA2Q9UJY4 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GGA2Q9UJY4 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GGA2Q9UJY4 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
GGA2Q9UJY4 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GGA2Q9UJY4 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GGA2Q9UJY4 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GGA2Q9UJY4 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GGA2Q9UJY4 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GGA2Q9UJY4 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GGA2Q9UJY4 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GGA2Q9UJY4 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GGA2Q9UJY4 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GGA2Q9UJY4 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GGA2Q9UJY4 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GGA2Q9UJY4 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GGA2Q9UJY4 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GGA2Q9UJY4 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GGA2Q9UJY4 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GGA2Q9UJY4 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GGA2Q9UJY4 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GGA2Q9UJY4 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
GGA2Q9UJY4 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GGA2Q9UJY4 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
GGA2Q9UJY4 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GGA2Q9UJY4 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GGA2Q9UJY4 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
GGA2Q9UJY4 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GGA2Q9UJY4 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GGA2Q9UJY4 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
GGA2Q9UJY4 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GGA2Q9UJY4 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GGA2Q9UJY4 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GGA2Q9UJY4 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GGA2Q9UJY4 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GGA2Q9UJY4 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
GGA2Q9UJY4 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GGA2Q9UJY4 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GGA2Q9UJY4 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GGA2Q9UJY4 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GGA2Q9UJY4 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GGA2Q9UJY4 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GGA2Q9UJY4 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GGA2Q9UJY4 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GGA2Q9UJY4 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GGA2Q9UJY4 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GGA2Q9UJY4 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GGA2Q9UJY4 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GGA2Q9UJY4 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GGA2Q9UJY4 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms