Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQW1

SEC31B, Protein transport protein Sec31B, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC31BQ9NQW1 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SEC31BQ9NQW1 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SEC31BQ9NQW1 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SEC31BQ9NQW1 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SEC31BQ9NQW1 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SEC31BQ9NQW1 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SEC31BQ9NQW1 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SEC31BQ9NQW1 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SEC31BQ9NQW1 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SEC31BQ9NQW1 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SEC31BQ9NQW1 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SEC31BQ9NQW1 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SEC31BQ9NQW1 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SEC31BQ9NQW1 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SEC31BQ9NQW1 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SEC31BQ9NQW1 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SEC31BQ9NQW1 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SEC31BQ9NQW1 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SEC31BQ9NQW1 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SEC31BQ9NQW1 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SEC31BQ9NQW1 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SEC31BQ9NQW1 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SEC31BQ9NQW1 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SEC31BQ9NQW1 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SEC31BQ9NQW1 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SEC31BQ9NQW1 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SEC31BQ9NQW1 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SEC31BQ9NQW1 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SEC31BQ9NQW1 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SEC31BQ9NQW1 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SEC31BQ9NQW1 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SEC31BQ9NQW1 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SEC31BQ9NQW1 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SEC31BQ9NQW1 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SEC31BQ9NQW1 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SEC31BQ9NQW1 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SEC31BQ9NQW1 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SEC31BQ9NQW1 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SEC31BQ9NQW1 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SEC31BQ9NQW1 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SEC31BQ9NQW1 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SEC31BQ9NQW1 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SEC31BQ9NQW1 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SEC31BQ9NQW1 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SEC31BQ9NQW1 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SEC31BQ9NQW1 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SEC31BQ9NQW1 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SEC31BQ9NQW1 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SEC31BQ9NQW1 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SEC31BQ9NQW1 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SEC31BQ9NQW1 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SEC31BQ9NQW1 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SEC31BQ9NQW1 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SEC31BQ9NQW1 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SEC31BQ9NQW1 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SEC31BQ9NQW1 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SEC31BQ9NQW1 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SEC31BQ9NQW1 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SEC31BQ9NQW1 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SEC31BQ9NQW1 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SEC31BQ9NQW1 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SEC31BQ9NQW1 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SEC31BQ9NQW1 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SEC31BQ9NQW1 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SEC31BQ9NQW1 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SEC31BQ9NQW1 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SEC31BQ9NQW1 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SEC31BQ9NQW1 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SEC31BQ9NQW1 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SEC31BQ9NQW1 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SEC31BQ9NQW1 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SEC31BQ9NQW1 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SEC31BQ9NQW1 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SEC31BQ9NQW1 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SEC31BQ9NQW1 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SEC31BQ9NQW1 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SEC31BQ9NQW1 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SEC31BQ9NQW1 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SEC31BQ9NQW1 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SEC31BQ9NQW1 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SEC31BQ9NQW1 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SEC31BQ9NQW1 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SEC31BQ9NQW1 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SEC31BQ9NQW1 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SEC31BQ9NQW1 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SEC31BQ9NQW1 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SEC31BQ9NQW1 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SEC31BQ9NQW1 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SEC31BQ9NQW1 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEC31BQ9NQW1 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEC31BQ9NQW1 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEC31BQ9NQW1 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEC31BQ9NQW1 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEC31BQ9NQW1 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEC31BQ9NQW1 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEC31BQ9NQW1 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SEC31BQ9NQW1 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEC31BQ9NQW1 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEC31BQ9NQW1 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEC31BQ9NQW1 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms