Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJW6

Alyref2, Aly/REF export factor 2, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alyref2Q9JJW6 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Alyref2Q9JJW6 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Alyref2Q9JJW6 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Alyref2Q9JJW6 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Alyref2Q9JJW6 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Alyref2Q9JJW6 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Alyref2Q9JJW6 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Alyref2Q9JJW6 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Alyref2Q9JJW6 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Alyref2Q9JJW6 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Alyref2Q9JJW6 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Alyref2Q9JJW6 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Alyref2Q9JJW6 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Alyref2Q9JJW6 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Alyref2Q9JJW6 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Alyref2Q9JJW6 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Alyref2Q9JJW6 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Alyref2Q9JJW6 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Alyref2Q9JJW6 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Alyref2Q9JJW6 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Alyref2Q9JJW6 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Alyref2Q9JJW6 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Alyref2Q9JJW6 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Alyref2Q9JJW6 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Alyref2Q9JJW6 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Alyref2Q9JJW6 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Alyref2Q9JJW6 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Alyref2Q9JJW6 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Alyref2Q9JJW6 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Alyref2Q9JJW6 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Alyref2Q9JJW6 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Alyref2Q9JJW6 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Alyref2Q9JJW6 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Alyref2Q9JJW6 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Alyref2Q9JJW6 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Alyref2Q9JJW6 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Alyref2Q9JJW6 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Alyref2Q9JJW6 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Alyref2Q9JJW6 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Alyref2Q9JJW6 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Alyref2Q9JJW6 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Alyref2Q9JJW6 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Alyref2Q9JJW6 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Alyref2Q9JJW6 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Alyref2Q9JJW6 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Alyref2Q9JJW6 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Alyref2Q9JJW6 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Alyref2Q9JJW6 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Alyref2Q9JJW6 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Alyref2Q9JJW6 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Alyref2Q9JJW6 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Alyref2Q9JJW6 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Alyref2Q9JJW6 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Alyref2Q9JJW6 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Alyref2Q9JJW6 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Alyref2Q9JJW6 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Alyref2Q9JJW6 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Alyref2Q9JJW6 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Alyref2Q9JJW6 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Alyref2Q9JJW6 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Alyref2Q9JJW6 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Alyref2Q9JJW6 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Alyref2Q9JJW6 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Alyref2Q9JJW6 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Alyref2Q9JJW6 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Alyref2Q9JJW6 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Alyref2Q9JJW6 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Alyref2Q9JJW6 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Alyref2Q9JJW6 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Alyref2Q9JJW6 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Alyref2Q9JJW6 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Alyref2Q9JJW6 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Alyref2Q9JJW6 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Alyref2Q9JJW6 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Alyref2Q9JJW6 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Alyref2Q9JJW6 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Alyref2Q9JJW6 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Alyref2Q9JJW6 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Alyref2Q9JJW6 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Alyref2Q9JJW6 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Alyref2Q9JJW6 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Alyref2Q9JJW6 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Alyref2Q9JJW6 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Alyref2Q9JJW6 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Alyref2Q9JJW6 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Alyref2Q9JJW6 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Alyref2Q9JJW6 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Alyref2Q9JJW6 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Alyref2Q9JJW6 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Alyref2Q9JJW6 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Alyref2Q9JJW6 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Alyref2Q9JJW6 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Alyref2Q9JJW6 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Alyref2Q9JJW6 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Alyref2Q9JJW6 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Alyref2Q9JJW6 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Alyref2Q9JJW6 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Alyref2Q9JJW6 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Alyref2Q9JJW6 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Alyref2Q9JJW6 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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