Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAK3

Rhobtb1, Rho-related BTB domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 695 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhobtb1Q9DAK3 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rhobtb1Q9DAK3 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rhobtb1Q9DAK3 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rhobtb1Q9DAK3 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rhobtb1Q9DAK3 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rhobtb1Q9DAK3 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rhobtb1Q9DAK3 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rhobtb1Q9DAK3 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rhobtb1Q9DAK3 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rhobtb1Q9DAK3 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rhobtb1Q9DAK3 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rhobtb1Q9DAK3 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rhobtb1Q9DAK3 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rhobtb1Q9DAK3 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rhobtb1Q9DAK3 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rhobtb1Q9DAK3 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rhobtb1Q9DAK3 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rhobtb1Q9DAK3 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rhobtb1Q9DAK3 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rhobtb1Q9DAK3 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rhobtb1Q9DAK3 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rhobtb1Q9DAK3 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rhobtb1Q9DAK3 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rhobtb1Q9DAK3 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rhobtb1Q9DAK3 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rhobtb1Q9DAK3 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rhobtb1Q9DAK3 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rhobtb1Q9DAK3 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rhobtb1Q9DAK3 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rhobtb1Q9DAK3 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rhobtb1Q9DAK3 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rhobtb1Q9DAK3 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rhobtb1Q9DAK3 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rhobtb1Q9DAK3 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rhobtb1Q9DAK3 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rhobtb1Q9DAK3 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rhobtb1Q9DAK3 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rhobtb1Q9DAK3 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rhobtb1Q9DAK3 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rhobtb1Q9DAK3 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rhobtb1Q9DAK3 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rhobtb1Q9DAK3 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rhobtb1Q9DAK3 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rhobtb1Q9DAK3 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rhobtb1Q9DAK3 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rhobtb1Q9DAK3 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rhobtb1Q9DAK3 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rhobtb1Q9DAK3 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rhobtb1Q9DAK3 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rhobtb1Q9DAK3 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rhobtb1Q9DAK3 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rhobtb1Q9DAK3 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rhobtb1Q9DAK3 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rhobtb1Q9DAK3 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rhobtb1Q9DAK3 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rhobtb1Q9DAK3 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rhobtb1Q9DAK3 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Rhobtb1Q9DAK3 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rhobtb1Q9DAK3 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rhobtb1Q9DAK3 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rhobtb1Q9DAK3 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Rhobtb1Q9DAK3 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rhobtb1Q9DAK3 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Rhobtb1Q9DAK3 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Rhobtb1Q9DAK3 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rhobtb1Q9DAK3 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Rhobtb1Q9DAK3 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rhobtb1Q9DAK3 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rhobtb1Q9DAK3 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rhobtb1Q9DAK3 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rhobtb1Q9DAK3 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rhobtb1Q9DAK3 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rhobtb1Q9DAK3 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Rhobtb1Q9DAK3 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rhobtb1Q9DAK3 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rhobtb1Q9DAK3 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rhobtb1Q9DAK3 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rhobtb1Q9DAK3 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rhobtb1Q9DAK3 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rhobtb1Q9DAK3 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rhobtb1Q9DAK3 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rhobtb1Q9DAK3 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rhobtb1Q9DAK3 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rhobtb1Q9DAK3 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rhobtb1Q9DAK3 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rhobtb1Q9DAK3 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rhobtb1Q9DAK3 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rhobtb1Q9DAK3 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rhobtb1Q9DAK3 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rhobtb1Q9DAK3 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rhobtb1Q9DAK3 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rhobtb1Q9DAK3 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rhobtb1Q9DAK3 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Rhobtb1Q9DAK3 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rhobtb1Q9DAK3 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rhobtb1Q9DAK3 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rhobtb1Q9DAK3 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rhobtb1Q9DAK3 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Rhobtb1Q9DAK3 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rhobtb1Q9DAK3 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms