Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ68

1700029P11Rik, RIKEN cDNA 1700029P11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700029P11RikQ9CQ68 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
1700029P11RikQ9CQ68 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
1700029P11RikQ9CQ68 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
1700029P11RikQ9CQ68 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
1700029P11RikQ9CQ68 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
1700029P11RikQ9CQ68 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
1700029P11RikQ9CQ68 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
1700029P11RikQ9CQ68 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
1700029P11RikQ9CQ68 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
1700029P11RikQ9CQ68 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
1700029P11RikQ9CQ68 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
1700029P11RikQ9CQ68 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
1700029P11RikQ9CQ68 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
1700029P11RikQ9CQ68 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
1700029P11RikQ9CQ68 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
1700029P11RikQ9CQ68 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
1700029P11RikQ9CQ68 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
1700029P11RikQ9CQ68 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
1700029P11RikQ9CQ68 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
1700029P11RikQ9CQ68 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
1700029P11RikQ9CQ68 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
1700029P11RikQ9CQ68 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
1700029P11RikQ9CQ68 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
1700029P11RikQ9CQ68 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
1700029P11RikQ9CQ68 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
1700029P11RikQ9CQ68 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
1700029P11RikQ9CQ68 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
1700029P11RikQ9CQ68 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
1700029P11RikQ9CQ68 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
1700029P11RikQ9CQ68 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
1700029P11RikQ9CQ68 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
1700029P11RikQ9CQ68 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
1700029P11RikQ9CQ68 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
1700029P11RikQ9CQ68 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
1700029P11RikQ9CQ68 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
1700029P11RikQ9CQ68 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
1700029P11RikQ9CQ68 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
1700029P11RikQ9CQ68 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
1700029P11RikQ9CQ68 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
1700029P11RikQ9CQ68 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
1700029P11RikQ9CQ68 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
1700029P11RikQ9CQ68 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
1700029P11RikQ9CQ68 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
1700029P11RikQ9CQ68 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
1700029P11RikQ9CQ68 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
1700029P11RikQ9CQ68 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
1700029P11RikQ9CQ68 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.19
1700029P11RikQ9CQ68 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
1700029P11RikQ9CQ68 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
1700029P11RikQ9CQ68 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
1700029P11RikQ9CQ68 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
1700029P11RikQ9CQ68 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
1700029P11RikQ9CQ68 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
1700029P11RikQ9CQ68 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
1700029P11RikQ9CQ68 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
1700029P11RikQ9CQ68 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
1700029P11RikQ9CQ68 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
1700029P11RikQ9CQ68 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
1700029P11RikQ9CQ68 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
1700029P11RikQ9CQ68 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
1700029P11RikQ9CQ68 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
1700029P11RikQ9CQ68 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
1700029P11RikQ9CQ68 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
1700029P11RikQ9CQ68 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
1700029P11RikQ9CQ68 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
1700029P11RikQ9CQ68 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
1700029P11RikQ9CQ68 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
1700029P11RikQ9CQ68 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
1700029P11RikQ9CQ68 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
1700029P11RikQ9CQ68 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
1700029P11RikQ9CQ68 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
1700029P11RikQ9CQ68 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
1700029P11RikQ9CQ68 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
1700029P11RikQ9CQ68 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
1700029P11RikQ9CQ68 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
1700029P11RikQ9CQ68 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
1700029P11RikQ9CQ68 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
1700029P11RikQ9CQ68 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
1700029P11RikQ9CQ68 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
1700029P11RikQ9CQ68 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
1700029P11RikQ9CQ68 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
1700029P11RikQ9CQ68 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
1700029P11RikQ9CQ68 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
1700029P11RikQ9CQ68 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
1700029P11RikQ9CQ68 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
1700029P11RikQ9CQ68 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
1700029P11RikQ9CQ68 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
1700029P11RikQ9CQ68 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
1700029P11RikQ9CQ68 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
1700029P11RikQ9CQ68 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
1700029P11RikQ9CQ68 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
1700029P11RikQ9CQ68 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
1700029P11RikQ9CQ68 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
1700029P11RikQ9CQ68 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
1700029P11RikQ9CQ68 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
1700029P11RikQ9CQ68 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
1700029P11RikQ9CQ68 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
1700029P11RikQ9CQ68 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
1700029P11RikQ9CQ68 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
1700029P11RikQ9CQ68 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms