Protein–RNA interactions for Protein: Q925E8

Sptssb, Serine palmitoyltransferase small subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 76 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SptssbQ925E8 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
SptssbQ925E8 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
SptssbQ925E8 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
SptssbQ925E8 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
SptssbQ925E8 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
SptssbQ925E8 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
SptssbQ925E8 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
SptssbQ925E8 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
SptssbQ925E8 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
SptssbQ925E8 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
SptssbQ925E8 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
SptssbQ925E8 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.17□□□□□ -0.94
SptssbQ925E8 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
SptssbQ925E8 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
SptssbQ925E8 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
SptssbQ925E8 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
SptssbQ925E8 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
SptssbQ925E8 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
SptssbQ925E8 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
SptssbQ925E8 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
SptssbQ925E8 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
SptssbQ925E8 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
SptssbQ925E8 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
SptssbQ925E8 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
SptssbQ925E8 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
SptssbQ925E8 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
SptssbQ925E8 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
SptssbQ925E8 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
SptssbQ925E8 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC9.17□□□□□ -0.94
SptssbQ925E8 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
SptssbQ925E8 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
SptssbQ925E8 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
SptssbQ925E8 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
SptssbQ925E8 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
SptssbQ925E8 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
SptssbQ925E8 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
SptssbQ925E8 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
SptssbQ925E8 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
SptssbQ925E8 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
SptssbQ925E8 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
SptssbQ925E8 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
SptssbQ925E8 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
SptssbQ925E8 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
SptssbQ925E8 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
SptssbQ925E8 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
SptssbQ925E8 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
SptssbQ925E8 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
SptssbQ925E8 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
SptssbQ925E8 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
SptssbQ925E8 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
SptssbQ925E8 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
SptssbQ925E8 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
SptssbQ925E8 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
SptssbQ925E8 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
SptssbQ925E8 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
SptssbQ925E8 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
SptssbQ925E8 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
SptssbQ925E8 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
SptssbQ925E8 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
SptssbQ925E8 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
SptssbQ925E8 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC9.16□□□□□ -0.94
SptssbQ925E8 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC9.16□□□□□ -0.94
SptssbQ925E8 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
SptssbQ925E8 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
SptssbQ925E8 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
SptssbQ925E8 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
SptssbQ925E8 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
SptssbQ925E8 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
SptssbQ925E8 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
SptssbQ925E8 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
SptssbQ925E8 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
SptssbQ925E8 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
SptssbQ925E8 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
SptssbQ925E8 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
SptssbQ925E8 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
SptssbQ925E8 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
SptssbQ925E8 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
SptssbQ925E8 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC9.16□□□□□ -0.94
SptssbQ925E8 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
SptssbQ925E8 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
SptssbQ925E8 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
SptssbQ925E8 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
SptssbQ925E8 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
SptssbQ925E8 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC9.16□□□□□ -0.94
SptssbQ925E8 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
SptssbQ925E8 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
SptssbQ925E8 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
SptssbQ925E8 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
SptssbQ925E8 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
SptssbQ925E8 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
SptssbQ925E8 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
SptssbQ925E8 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
SptssbQ925E8 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
SptssbQ925E8 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
SptssbQ925E8 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
SptssbQ925E8 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
SptssbQ925E8 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
SptssbQ925E8 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
SptssbQ925E8 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
SptssbQ925E8 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms