Protein–RNA interactions for Protein: Q66X19

Nlrp4e, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 4E, mousemouse

Predictions only

Length 978 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp4eQ66X19 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nlrp4eQ66X19 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nlrp4eQ66X19 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nlrp4eQ66X19 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nlrp4eQ66X19 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nlrp4eQ66X19 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nlrp4eQ66X19 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nlrp4eQ66X19 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nlrp4eQ66X19 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nlrp4eQ66X19 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nlrp4eQ66X19 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nlrp4eQ66X19 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nlrp4eQ66X19 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nlrp4eQ66X19 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nlrp4eQ66X19 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nlrp4eQ66X19 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nlrp4eQ66X19 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nlrp4eQ66X19 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nlrp4eQ66X19 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nlrp4eQ66X19 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nlrp4eQ66X19 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nlrp4eQ66X19 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nlrp4eQ66X19 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nlrp4eQ66X19 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nlrp4eQ66X19 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Nlrp4eQ66X19 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nlrp4eQ66X19 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nlrp4eQ66X19 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nlrp4eQ66X19 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nlrp4eQ66X19 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nlrp4eQ66X19 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nlrp4eQ66X19 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nlrp4eQ66X19 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nlrp4eQ66X19 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nlrp4eQ66X19 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nlrp4eQ66X19 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nlrp4eQ66X19 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nlrp4eQ66X19 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nlrp4eQ66X19 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nlrp4eQ66X19 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nlrp4eQ66X19 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Nlrp4eQ66X19 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Nlrp4eQ66X19 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Nlrp4eQ66X19 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nlrp4eQ66X19 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Nlrp4eQ66X19 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nlrp4eQ66X19 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nlrp4eQ66X19 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nlrp4eQ66X19 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nlrp4eQ66X19 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Nlrp4eQ66X19 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nlrp4eQ66X19 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nlrp4eQ66X19 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nlrp4eQ66X19 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nlrp4eQ66X19 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nlrp4eQ66X19 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nlrp4eQ66X19 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nlrp4eQ66X19 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nlrp4eQ66X19 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nlrp4eQ66X19 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nlrp4eQ66X19 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nlrp4eQ66X19 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nlrp4eQ66X19 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nlrp4eQ66X19 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nlrp4eQ66X19 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nlrp4eQ66X19 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nlrp4eQ66X19 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nlrp4eQ66X19 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nlrp4eQ66X19 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nlrp4eQ66X19 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nlrp4eQ66X19 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nlrp4eQ66X19 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nlrp4eQ66X19 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nlrp4eQ66X19 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nlrp4eQ66X19 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nlrp4eQ66X19 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nlrp4eQ66X19 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nlrp4eQ66X19 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nlrp4eQ66X19 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nlrp4eQ66X19 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nlrp4eQ66X19 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nlrp4eQ66X19 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nlrp4eQ66X19 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Nlrp4eQ66X19 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nlrp4eQ66X19 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nlrp4eQ66X19 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nlrp4eQ66X19 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nlrp4eQ66X19 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nlrp4eQ66X19 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nlrp4eQ66X19 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nlrp4eQ66X19 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nlrp4eQ66X19 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Nlrp4eQ66X19 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nlrp4eQ66X19 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nlrp4eQ66X19 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nlrp4eQ66X19 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Nlrp4eQ66X19 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nlrp4eQ66X19 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Nlrp4eQ66X19 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nlrp4eQ66X19 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms