Protein–RNA interactions for Protein: Q5U5Q3

MEX3C, RNA-binding E3 ubiquitin-protein ligase MEX3C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 659 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEX3CQ5U5Q3 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MEX3CQ5U5Q3 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MEX3CQ5U5Q3 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MEX3CQ5U5Q3 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MEX3CQ5U5Q3 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MEX3CQ5U5Q3 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MEX3CQ5U5Q3 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MEX3CQ5U5Q3 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MEX3CQ5U5Q3 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MEX3CQ5U5Q3 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MEX3CQ5U5Q3 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MEX3CQ5U5Q3 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MEX3CQ5U5Q3 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MEX3CQ5U5Q3 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MEX3CQ5U5Q3 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MEX3CQ5U5Q3 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MEX3CQ5U5Q3 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MEX3CQ5U5Q3 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MEX3CQ5U5Q3 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MEX3CQ5U5Q3 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
MEX3CQ5U5Q3 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MEX3CQ5U5Q3 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MEX3CQ5U5Q3 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MEX3CQ5U5Q3 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MEX3CQ5U5Q3 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MEX3CQ5U5Q3 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MEX3CQ5U5Q3 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MEX3CQ5U5Q3 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MEX3CQ5U5Q3 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MEX3CQ5U5Q3 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MEX3CQ5U5Q3 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MEX3CQ5U5Q3 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MEX3CQ5U5Q3 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MEX3CQ5U5Q3 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MEX3CQ5U5Q3 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MEX3CQ5U5Q3 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MEX3CQ5U5Q3 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MEX3CQ5U5Q3 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MEX3CQ5U5Q3 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
MEX3CQ5U5Q3 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MEX3CQ5U5Q3 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MEX3CQ5U5Q3 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MEX3CQ5U5Q3 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MEX3CQ5U5Q3 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MEX3CQ5U5Q3 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MEX3CQ5U5Q3 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MEX3CQ5U5Q3 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MEX3CQ5U5Q3 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MEX3CQ5U5Q3 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MEX3CQ5U5Q3 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MEX3CQ5U5Q3 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MEX3CQ5U5Q3 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MEX3CQ5U5Q3 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MEX3CQ5U5Q3 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MEX3CQ5U5Q3 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
MEX3CQ5U5Q3 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MEX3CQ5U5Q3 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MEX3CQ5U5Q3 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
MEX3CQ5U5Q3 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
MEX3CQ5U5Q3 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MEX3CQ5U5Q3 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MEX3CQ5U5Q3 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MEX3CQ5U5Q3 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MEX3CQ5U5Q3 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MEX3CQ5U5Q3 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MEX3CQ5U5Q3 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MEX3CQ5U5Q3 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MEX3CQ5U5Q3 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MEX3CQ5U5Q3 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MEX3CQ5U5Q3 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MEX3CQ5U5Q3 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MEX3CQ5U5Q3 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MEX3CQ5U5Q3 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MEX3CQ5U5Q3 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
MEX3CQ5U5Q3 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MEX3CQ5U5Q3 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MEX3CQ5U5Q3 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
MEX3CQ5U5Q3 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MEX3CQ5U5Q3 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MEX3CQ5U5Q3 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MEX3CQ5U5Q3 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MEX3CQ5U5Q3 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MEX3CQ5U5Q3 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MEX3CQ5U5Q3 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MEX3CQ5U5Q3 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MEX3CQ5U5Q3 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MEX3CQ5U5Q3 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
MEX3CQ5U5Q3 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
MEX3CQ5U5Q3 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MEX3CQ5U5Q3 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MEX3CQ5U5Q3 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
MEX3CQ5U5Q3 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
MEX3CQ5U5Q3 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MEX3CQ5U5Q3 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MEX3CQ5U5Q3 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MEX3CQ5U5Q3 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MEX3CQ5U5Q3 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MEX3CQ5U5Q3 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MEX3CQ5U5Q3 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MEX3CQ5U5Q3 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms