Protein–RNA interactions for Protein: Q59H18

TNNI3K, Serine/threonine-protein kinase TNNI3K, humanhuman

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3KQ59H18 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNNI3KQ59H18 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNNI3KQ59H18 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNNI3KQ59H18 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNNI3KQ59H18 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TNNI3KQ59H18 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNNI3KQ59H18 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNNI3KQ59H18 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNNI3KQ59H18 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNNI3KQ59H18 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNNI3KQ59H18 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNNI3KQ59H18 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNNI3KQ59H18 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNNI3KQ59H18 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNNI3KQ59H18 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNNI3KQ59H18 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNNI3KQ59H18 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNNI3KQ59H18 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNNI3KQ59H18 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNNI3KQ59H18 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNNI3KQ59H18 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNNI3KQ59H18 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNNI3KQ59H18 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNNI3KQ59H18 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNNI3KQ59H18 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNNI3KQ59H18 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNNI3KQ59H18 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNNI3KQ59H18 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TNNI3KQ59H18 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNNI3KQ59H18 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNNI3KQ59H18 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNNI3KQ59H18 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNNI3KQ59H18 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNNI3KQ59H18 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNNI3KQ59H18 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNNI3KQ59H18 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNNI3KQ59H18 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNNI3KQ59H18 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNNI3KQ59H18 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNNI3KQ59H18 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNNI3KQ59H18 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNNI3KQ59H18 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNNI3KQ59H18 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNNI3KQ59H18 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNNI3KQ59H18 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNNI3KQ59H18 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNNI3KQ59H18 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNNI3KQ59H18 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNNI3KQ59H18 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNNI3KQ59H18 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNNI3KQ59H18 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNNI3KQ59H18 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TNNI3KQ59H18 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TNNI3KQ59H18 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNNI3KQ59H18 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TNNI3KQ59H18 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TNNI3KQ59H18 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TNNI3KQ59H18 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNNI3KQ59H18 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TNNI3KQ59H18 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNNI3KQ59H18 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNNI3KQ59H18 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TNNI3KQ59H18 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TNNI3KQ59H18 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TNNI3KQ59H18 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TNNI3KQ59H18 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TNNI3KQ59H18 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TNNI3KQ59H18 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TNNI3KQ59H18 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TNNI3KQ59H18 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TNNI3KQ59H18 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TNNI3KQ59H18 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TNNI3KQ59H18 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TNNI3KQ59H18 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TNNI3KQ59H18 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TNNI3KQ59H18 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TNNI3KQ59H18 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TNNI3KQ59H18 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TNNI3KQ59H18 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TNNI3KQ59H18 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TNNI3KQ59H18 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TNNI3KQ59H18 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TNNI3KQ59H18 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TNNI3KQ59H18 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNNI3KQ59H18 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNNI3KQ59H18 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNNI3KQ59H18 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TNNI3KQ59H18 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TNNI3KQ59H18 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNNI3KQ59H18 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TNNI3KQ59H18 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNNI3KQ59H18 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNNI3KQ59H18 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNNI3KQ59H18 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNNI3KQ59H18 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNNI3KQ59H18 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNNI3KQ59H18 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNNI3KQ59H18 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNNI3KQ59H18 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNNI3KQ59H18 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 521.7 ms