Protein–RNA interactions for Protein: Q53FE4

C4orf17, Uncharacterized protein C4orf17, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf17Q53FE4 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C4orf17Q53FE4 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C4orf17Q53FE4 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C4orf17Q53FE4 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C4orf17Q53FE4 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C4orf17Q53FE4 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C4orf17Q53FE4 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
C4orf17Q53FE4 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
C4orf17Q53FE4 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
C4orf17Q53FE4 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C4orf17Q53FE4 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
C4orf17Q53FE4 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C4orf17Q53FE4 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C4orf17Q53FE4 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
C4orf17Q53FE4 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
C4orf17Q53FE4 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
C4orf17Q53FE4 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
C4orf17Q53FE4 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C4orf17Q53FE4 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
C4orf17Q53FE4 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC17■□□□□ 0.31
C4orf17Q53FE4 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC17■□□□□ 0.31
C4orf17Q53FE4 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
C4orf17Q53FE4 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
C4orf17Q53FE4 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
C4orf17Q53FE4 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
C4orf17Q53FE4 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
C4orf17Q53FE4 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
C4orf17Q53FE4 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
C4orf17Q53FE4 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C4orf17Q53FE4 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C4orf17Q53FE4 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C4orf17Q53FE4 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C4orf17Q53FE4 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C4orf17Q53FE4 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C4orf17Q53FE4 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C4orf17Q53FE4 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C4orf17Q53FE4 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C4orf17Q53FE4 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C4orf17Q53FE4 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C4orf17Q53FE4 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
C4orf17Q53FE4 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C4orf17Q53FE4 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C4orf17Q53FE4 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C4orf17Q53FE4 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C4orf17Q53FE4 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C4orf17Q53FE4 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
C4orf17Q53FE4 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
C4orf17Q53FE4 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C4orf17Q53FE4 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C4orf17Q53FE4 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C4orf17Q53FE4 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C4orf17Q53FE4 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C4orf17Q53FE4 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C4orf17Q53FE4 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C4orf17Q53FE4 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C4orf17Q53FE4 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C4orf17Q53FE4 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C4orf17Q53FE4 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C4orf17Q53FE4 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C4orf17Q53FE4 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C4orf17Q53FE4 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C4orf17Q53FE4 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
C4orf17Q53FE4 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
C4orf17Q53FE4 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C4orf17Q53FE4 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C4orf17Q53FE4 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
C4orf17Q53FE4 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C4orf17Q53FE4 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C4orf17Q53FE4 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
C4orf17Q53FE4 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C4orf17Q53FE4 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C4orf17Q53FE4 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C4orf17Q53FE4 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C4orf17Q53FE4 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
C4orf17Q53FE4 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
C4orf17Q53FE4 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
C4orf17Q53FE4 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
C4orf17Q53FE4 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
C4orf17Q53FE4 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
C4orf17Q53FE4 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
C4orf17Q53FE4 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C4orf17Q53FE4 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C4orf17Q53FE4 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C4orf17Q53FE4 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
C4orf17Q53FE4 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
C4orf17Q53FE4 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C4orf17Q53FE4 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
C4orf17Q53FE4 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C4orf17Q53FE4 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C4orf17Q53FE4 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C4orf17Q53FE4 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C4orf17Q53FE4 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C4orf17Q53FE4 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C4orf17Q53FE4 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C4orf17Q53FE4 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C4orf17Q53FE4 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
C4orf17Q53FE4 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C4orf17Q53FE4 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
C4orf17Q53FE4 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C4orf17Q53FE4 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms