Protein–RNA interactions for Protein: Q05952

TNP2, Nuclear transition protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP2Q05952 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 KRT8P2-201ENST00000556193 944 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 AL353729.2-201ENST00000605859 1249 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
TNP2Q05952 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.39
TNP2Q05952 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
TNP2Q05952 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.39
TNP2Q05952 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TNP2Q05952 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TNP2Q05952 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
TNP2Q05952 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TNP2Q05952 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TNP2Q05952 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TNP2Q05952 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
TNP2Q05952 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
TNP2Q05952 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
TNP2Q05952 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
TNP2Q05952 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TNP2Q05952 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TNP2Q05952 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
TNP2Q05952 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
TNP2Q05952 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
TNP2Q05952 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
TNP2Q05952 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC12.64□□□□□ -0.39
TNP2Q05952 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
TNP2Q05952 AC092925.1-201ENST00000470739 493 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
TNP2Q05952 MAPK10-223ENST00000511167 1265 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
TNP2Q05952 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
TNP2Q05952 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
TNP2Q05952 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
TNP2Q05952 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
TNP2Q05952 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
TNP2Q05952 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TNP2Q05952 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TNP2Q05952 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TNP2Q05952 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TNP2Q05952 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
TNP2Q05952 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TNP2Q05952 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TNP2Q05952 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TNP2Q05952 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TNP2Q05952 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TNP2Q05952 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
TNP2Q05952 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
TNP2Q05952 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TNP2Q05952 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TNP2Q05952 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TNP2Q05952 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TNP2Q05952 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
TNP2Q05952 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
TNP2Q05952 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TNP2Q05952 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TNP2Q05952 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
TNP2Q05952 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TNP2Q05952 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TNP2Q05952 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TNP2Q05952 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
TNP2Q05952 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TNP2Q05952 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TNP2Q05952 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
TNP2Q05952 AC109587.1-201ENST00000482368 962 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
TNP2Q05952 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
TNP2Q05952 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
TNP2Q05952 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
TNP2Q05952 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC12.63□□□□□ -0.39
TNP2Q05952 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC12.63□□□□□ -0.39
TNP2Q05952 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
TNP2Q05952 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TNP2Q05952 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TNP2Q05952 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TNP2Q05952 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
TNP2Q05952 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
TNP2Q05952 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
TNP2Q05952 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
TNP2Q05952 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
TNP2Q05952 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
TNP2Q05952 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
TNP2Q05952 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TNP2Q05952 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TNP2Q05952 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TNP2Q05952 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TNP2Q05952 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TNP2Q05952 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TNP2Q05952 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms