Protein–RNA interactions for Protein: P62746

Rhob, Rho-related GTP-binding protein RhoB, mousemouse

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhobP62746 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
RhobP62746 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RhobP62746 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RhobP62746 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
RhobP62746 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RhobP62746 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RhobP62746 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RhobP62746 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
RhobP62746 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RhobP62746 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RhobP62746 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RhobP62746 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RhobP62746 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RhobP62746 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RhobP62746 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RhobP62746 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RhobP62746 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RhobP62746 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
RhobP62746 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RhobP62746 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RhobP62746 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
RhobP62746 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
RhobP62746 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RhobP62746 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RhobP62746 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RhobP62746 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RhobP62746 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RhobP62746 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RhobP62746 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RhobP62746 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RhobP62746 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RhobP62746 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RhobP62746 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RhobP62746 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RhobP62746 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RhobP62746 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RhobP62746 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RhobP62746 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RhobP62746 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RhobP62746 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RhobP62746 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RhobP62746 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RhobP62746 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RhobP62746 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RhobP62746 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RhobP62746 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RhobP62746 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
RhobP62746 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
RhobP62746 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RhobP62746 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RhobP62746 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RhobP62746 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
RhobP62746 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
RhobP62746 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
RhobP62746 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
RhobP62746 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
RhobP62746 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
RhobP62746 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
RhobP62746 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.35
RhobP62746 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
RhobP62746 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
RhobP62746 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
RhobP62746 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
RhobP62746 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
RhobP62746 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
RhobP62746 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
RhobP62746 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
RhobP62746 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
RhobP62746 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
RhobP62746 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
RhobP62746 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
RhobP62746 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
RhobP62746 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
RhobP62746 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
RhobP62746 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
RhobP62746 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
RhobP62746 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
RhobP62746 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
RhobP62746 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
RhobP62746 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
RhobP62746 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
RhobP62746 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
RhobP62746 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
RhobP62746 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
RhobP62746 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
RhobP62746 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
RhobP62746 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
RhobP62746 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
RhobP62746 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
RhobP62746 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
RhobP62746 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
RhobP62746 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
RhobP62746 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
RhobP62746 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
RhobP62746 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
RhobP62746 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
RhobP62746 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
RhobP62746 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
RhobP62746 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
RhobP62746 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms