Protein–RNA interactions for Protein: P46736

BRCC3, Lys-63-specific deubiquitinase BRCC36, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCC3P46736 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BRCC3P46736 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BRCC3P46736 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
BRCC3P46736 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BRCC3P46736 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BRCC3P46736 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BRCC3P46736 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BRCC3P46736 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BRCC3P46736 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BRCC3P46736 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BRCC3P46736 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BRCC3P46736 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BRCC3P46736 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BRCC3P46736 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BRCC3P46736 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BRCC3P46736 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BRCC3P46736 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BRCC3P46736 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BRCC3P46736 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BRCC3P46736 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BRCC3P46736 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
BRCC3P46736 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
BRCC3P46736 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
BRCC3P46736 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
BRCC3P46736 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BRCC3P46736 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BRCC3P46736 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BRCC3P46736 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BRCC3P46736 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BRCC3P46736 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BRCC3P46736 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BRCC3P46736 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
BRCC3P46736 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BRCC3P46736 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BRCC3P46736 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BRCC3P46736 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BRCC3P46736 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BRCC3P46736 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
BRCC3P46736 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
BRCC3P46736 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
BRCC3P46736 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BRCC3P46736 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BRCC3P46736 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BRCC3P46736 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BRCC3P46736 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
BRCC3P46736 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
BRCC3P46736 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BRCC3P46736 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
BRCC3P46736 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BRCC3P46736 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BRCC3P46736 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BRCC3P46736 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BRCC3P46736 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BRCC3P46736 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BRCC3P46736 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BRCC3P46736 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BRCC3P46736 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BRCC3P46736 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
BRCC3P46736 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BRCC3P46736 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BRCC3P46736 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BRCC3P46736 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BRCC3P46736 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BRCC3P46736 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BRCC3P46736 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BRCC3P46736 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BRCC3P46736 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BRCC3P46736 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BRCC3P46736 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BRCC3P46736 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
BRCC3P46736 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BRCC3P46736 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BRCC3P46736 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BRCC3P46736 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BRCC3P46736 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BRCC3P46736 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BRCC3P46736 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
BRCC3P46736 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BRCC3P46736 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BRCC3P46736 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BRCC3P46736 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BRCC3P46736 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BRCC3P46736 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BRCC3P46736 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BRCC3P46736 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
BRCC3P46736 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BRCC3P46736 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BRCC3P46736 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
BRCC3P46736 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BRCC3P46736 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BRCC3P46736 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BRCC3P46736 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
BRCC3P46736 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BRCC3P46736 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BRCC3P46736 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BRCC3P46736 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BRCC3P46736 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
BRCC3P46736 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BRCC3P46736 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BRCC3P46736 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms